More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0452 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_0452  PhoH-like protein  100 
 
 		 331 aa  673    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.010717  normal  0.615683 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0513  PhoH-like protein  89.16 
 
 		 341 aa  614  1e-175  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0422  PhoH family protein  86.4 
 
 		 330 aa  582  1.0000000000000001e-165  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0407  PhoH family protein  85.8 
 
 		 330 aa  570  1e-161  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0842646 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0530  PHOH-like protein  84.57 
 
 		 325 aa  556  1e-157  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.159561  normal  0.089115 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0604  PhoH family protein  74.49 
 
 		 348 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6022  PhoH-like protein  76.25 
 
 		 348 aa  514  1.0000000000000001e-145  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.611976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2611  PhoH family protein  75.07 
 
 		 348 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.126253  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2747  PhoH family protein  74.71 
 
 		 348 aa  512  1e-144  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0636869  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0225  PhoH family protein  74.42 
 
 		 352 aa  509  1e-143  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0888  PhoH family protein  73.99 
 
 		 354 aa  509  1e-143  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.437404  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0709  PhoH family protein  73.99 
 
 		 354 aa  508  1e-143  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.95861  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2437  PhoH family protein  74.42 
 
 		 352 aa  509  1e-143  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2722  PhoH family protein  74.78 
 
 		 348 aa  508  1e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.72441  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2082  PhoH-like protein  74.78 
 
 		 348 aa  508  1e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2357  PhoH family protein  74.42 
 
 		 352 aa  509  1e-143  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2694  PhoH family protein  74.78 
 
 		 348 aa  508  1e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2721  PhoH family protein  74.42 
 
 		 352 aa  509  1e-143  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0723  PhoH family protein  73.99 
 
 		 354 aa  508  1e-143  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0411  PhoH family protein  73.9 
 
 		 362 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.234067 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0590  PhoH family protein  73.14 
 
 		 358 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.178371  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0629  putative PhoH-family protein  75 
 
 		 359 aa  503  1e-141  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.518903 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3330  PhoH family protein  74.19 
 
 		 357 aa  501  1e-141  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.128023 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2705  PhoH-like protein  65.35 
 
 		 319 aa  414  9.999999999999999e-116  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.595006 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2696  PhoH-like protein  64.11 
 
 		 346 aa  414  1e-114  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0866  PhoH family protein  68.17 
 
 		 339 aa  409  1e-113  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3528  PhoH-like protein  64.01 
 
 		 340 aa  402  1e-111  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.959961  normal  0.0258567 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3239  putative phoH-like protein  64.63 
 
 		 338 aa  397  1e-109  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0650  PhoH-like protein  64.49 
 
 		 328 aa  397  1e-109  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3950  PhoH family protein  63.38 
 
 		 374 aa  394  1e-109  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.493956 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4095  PhoH-like protein  62.58 
 
 		 337 aa  392  1e-108  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4067  PhoH family protein  63.67 
 
 		 316 aa  385  1e-106  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.579724 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0509  PhoH family protein  60.74 
 
 		 345 aa  387  1e-106  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4241  PhoH family protein  63.34 
 
 		 316 aa  380  1e-104  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.220372 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4666  PhoH family protein  62.46 
 
 		 316 aa  379  1e-104  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0492  PhoH family protein  63.14 
 
 		 335 aa  380  1e-104  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.307318  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3701  PhoH family protein  63.14 
 
 		 335 aa  379  1e-104  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.933672  normal  0.818626 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1225  PhoH family protein  59.81 
 
 		 323 aa  367  1e-100  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0738  PhoH-like protein  61.09 
 
 		 338 aa  366  1e-100  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.184449  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0633  PhoH family protein  59.37 
 
 		 332 aa  361  1e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0141931  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4787  PhoH family protein  58.73 
 
 		 332 aa  358  9e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0880837 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4663  PhoH family protein  58.73 
 
 		 332 aa  358  9e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.337379  normal  0.248973 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0238  PhoH-like protein  58.07 
 
 		 330 aa  357  9.999999999999999e-98  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4841  PhoH family protein  56.92 
 
 		 332 aa  356  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2910  PhoH family protein  56.83 
 
 		 348 aa  353  2e-96  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0892  PhoH family protein  56.72 
 
 		 359 aa  352  4e-96  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.427486  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0395  PhoH family protein  59.68 
 
 		 343 aa  350  2e-95  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.503054 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4805  PhoH-like protein  56.92 
 
 		 340 aa  349  5e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1458  PhoH family protein  55.84 
 
 		 341 aa  348  6e-95  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.321315  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3573  phoH family protein  53.53 
 
 		 368 aa  345  5e-94  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.189544  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09060  PhoH-like protein  59.16 
 
 		 336 aa  345  7e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.706372  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4951  PhoH-like protein  55.52 
 
 		 334 aa  345  8e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.643445 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4346  PhoH-like protein  57.23 
 
 		 340 aa  345  8.999999999999999e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1127  hypothetical protein  55.18 
 
 		 340 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12330  hypothetical protein  55.59 
 
 		 340 aa  342  4e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2739  PhoH family protein  56.96 
 
 		 328 aa  342  7e-93  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0814  PhoH-like protein  54.38 
 
 		 365 aa  339  2.9999999999999998e-92  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3780  PhoH family protein  56.96 
 
 		 350 aa  339  4e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.150452 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0712  PhoH family protein  55.17 
 
 		 347 aa  335  5.999999999999999e-91  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.242379  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0534  PhoH family protein  55 
 
 		 342 aa  335  5.999999999999999e-91  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.749286 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1196  PhoH family protein  55.26 
 
 		 352 aa  333  3e-90  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.415676  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3135  PhoH family protein  55.26 
 
 		 352 aa  332  4e-90  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0749  PhoH family protein  54.15 
 
 		 327 aa  332  6e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00019197 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0597  PhoH-like protein  54.15 
 
 		 340 aa  331  8e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2916  PhoH family protein  54.97 
 
 		 357 aa  331  1e-89  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0010821  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1830  hypothetical protein  54.97 
 
 		 357 aa  331  1e-89  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3006  PhoH family protein  54.97 
 
 		 357 aa  331  1e-89  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.425195  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1218  PhoH family protein  54.97 
 
 		 351 aa  330  2e-89  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0284374  normal  0.476314 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0483  phoH family protein  54.93 
 
 		 367 aa  328  6e-89  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000530716  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1183  PhoH family protein  56.79 
 
 		 337 aa  328  7e-89  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1353  PhoH family protein  54.86 
 
 		 328 aa  328  8e-89  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000248045  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1107  PhoH family protein  54.19 
 
 		 351 aa  327  1.0000000000000001e-88  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004212  phosphate starvation-inducible protein PhoH  55.86 
 
 		 365 aa  327  2.0000000000000001e-88  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00393498  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0682  PhoH family protein  54.63 
 
 		 346 aa  327  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0121436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0707  PhoH family protein  54.63 
 
 		 346 aa  327  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0340161  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0689  PhoH family protein  54.63 
 
 		 346 aa  327  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00018585  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0753  PhoH family protein  54.63 
 
 		 346 aa  327  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00493548  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2291  PhoH family protein  59.38 
 
 		 334 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2207  PhoH-like protein  53.57 
 
 		 345 aa  327  3e-88  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.935668  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0587  PhoH family protein  54.63 
 
 		 346 aa  326  3e-88  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.139571  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00628  predicted protein with nucleoside triphosphate hydrolase domain  54.33 
 
 		 359 aa  325  5e-88  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2966  PhoH family protein  54.33 
 
 		 359 aa  325  5e-88  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.069683  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00619  hypothetical protein  54.33 
 
 		 359 aa  325  5e-88  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2985  PhoH family protein  54.33 
 
 		 359 aa  325  5e-88  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.189197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0591  PhoH-like protein  51.86 
 
 		 361 aa  325  6e-88  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0823  PhoH family protein  54.65 
 
 		 348 aa  324  1e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0728  PhoH family protein  54.65 
 
 		 348 aa  324  1e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.93581 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0775  PhoH family protein  54.65 
 
 		 348 aa  324  1e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.774508  normal  0.946623 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0787  PhoH family protein  54.65 
 
 		 348 aa  324  1e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0714  PhoH family protein  54.65 
 
 		 348 aa  324  1e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0457534  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02231  putative ATP-binding protein in pho regulon  54.03 
 
 		 370 aa  323  2e-87  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.719746  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0627  putative PhoH-like protein, ATPase  51.4 
 
 		 361 aa  323  2e-87  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.121399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01229  hypothetical protein  54.6 
 
 		 365 aa  323  2e-87  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2138  PhoH family protein  56.6 
 
 		 331 aa  323  2e-87  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.888079  normal  0.261527 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00447  ATP-binding protein  53.43 
 
 		 328 aa  323  3e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.000644199  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1970  PhoH family protein  49.85 
 
 		 379 aa  323  3e-87  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0372063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1186  PhoH family protein  54.33 
 
 		 348 aa  322  5e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0119675 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0345  PhoH-like ATP-binding protein  52.06 
 
 		 370 aa  322  7e-87  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2949  PhoH family protein  54.52 
 
 		 350 aa  321  9.999999999999999e-87  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.8067  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2576  PhoH family protein  56.43 
 
 		 356 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0746934 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>