More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_0241 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007778  RPB_0591  PhoH-like protein, phosphate starvation inducible  93.02 
 
 
344 aa  647    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0241  PhoH-like protein  100 
 
 
351 aa  708    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0451  PhoH family protein  88.86 
 
 
351 aa  629  1e-179  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0469  PhoH-like protein  88.18 
 
 
352 aa  625  1e-178  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.803585 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0022  PhoH-like protein  86.25 
 
 
349 aa  610  9.999999999999999e-175  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.232507  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0047  putative phosphate starvation-inducible protein, PhoH-like protein  86.8 
 
 
345 aa  610  9.999999999999999e-175  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.959569 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0015  PhoH-like protein  84.24 
 
 
349 aa  592  1e-168  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.945712  normal  0.0639944 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1811  PhoH family protein  71.96 
 
 
379 aa  472  1e-132  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.147763  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1056  PhoH family protein  63.95 
 
 
341 aa  416  9.999999999999999e-116  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.563658  normal  0.821458 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2896  PhoH family protein  62.97 
 
 
355 aa  409  1e-113  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.434704 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3181  PhoH family protein  62.65 
 
 
365 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0246823  normal  0.0183443 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0234  PhoH family protein  63.95 
 
 
369 aa  402  1e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.253584  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3529  PhoH family protein  62.81 
 
 
368 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.556211  normal  0.320113 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3205  PhoH family protein  62.81 
 
 
368 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3400  PhoH family protein  63.12 
 
 
368 aa  398  1e-109  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0161796  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0638  PhoH family protein  63.41 
 
 
338 aa  397  1e-109  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.622943 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0030  PhoH family protein  61.35 
 
 
349 aa  388  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.04719 
 
 
-
 
NC_004310  BR2155  PhoH family protein  61.27 
 
 
327 aa  387  1e-106  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0868609  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0041  PhoH family protein  57.74 
 
 
351 aa  382  1e-105  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000833124 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2067  PhoH family protein  60.95 
 
 
327 aa  383  1e-105  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0286047  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0018  PhoH family protein  60.43 
 
 
350 aa  382  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.28473 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0757  PhoH family protein  60.32 
 
 
353 aa  384  1e-105  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.899998  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0438  phosphate starvation inducible protein  60.31 
 
 
357 aa  382  1e-105  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.695996  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3920  PhoH-like protein  58.75 
 
 
348 aa  377  1e-103  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3618  PhoH family protein  55.27 
 
 
342 aa  342  4e-93  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1244  PhoH family protein  52.07 
 
 
370 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3771  PhoH-like protein  53.02 
 
 
322 aa  332  6e-90  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3284  PhoH family protein  52.74 
 
 
346 aa  330  3e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3599  hypothetical protein  52.74 
 
 
346 aa  330  3e-89  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3873  hypothetical protein  52.13 
 
 
339 aa  329  5.0000000000000004e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.504084  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0700  PhoH-like protein  51.36 
 
 
373 aa  325  8.000000000000001e-88  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.233967 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1016  PhoH family protein  51.7 
 
 
337 aa  323  2e-87  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0442383  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2388  PhoH family protein  51.03 
 
 
360 aa  322  5e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.156507  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0981  PhoH-like protein  51.75 
 
 
348 aa  318  1e-85  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1354  PhoH family protein  51.55 
 
 
333 aa  317  1e-85  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0963523  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3692  PhoH family protein  50.93 
 
 
375 aa  317  2e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.316664  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0069  PhoH family protein  47.01 
 
 
363 aa  313  3.9999999999999997e-84  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0287585 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1436  PhoH family protein  50.16 
 
 
326 aa  309  5e-83  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.384314 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0779  PhoH family protein  49.07 
 
 
331 aa  305  6e-82  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0188  PhoH-like protein  50.76 
 
 
338 aa  305  6e-82  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2063  PhoH-like protein  50.45 
 
 
335 aa  301  1e-80  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.590057 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4156  PhoH family protein  49.35 
 
 
319 aa  301  2e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4204  PhoH family protein  48.7 
 
 
319 aa  299  4e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4042  PhoH family protein  48.7 
 
 
319 aa  299  4e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.713354  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4052  PhoH family protein  48.7 
 
 
319 aa  299  4e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4529  PhoH family protein  48.7 
 
 
319 aa  299  4e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4327  PhoH family protein  48.7 
 
 
319 aa  299  4e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.24127e-53 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0814  PhoH family protein  49.03 
 
 
319 aa  298  6e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.429473  decreased coverage  1.44799e-22 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1815  PhoH family protein  48.89 
 
 
323 aa  298  8e-80  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.294918  normal  0.443651 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4385  PhoH family protein  48.7 
 
 
319 aa  298  1e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.550893  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4438  PhoH family protein  48.7 
 
 
319 aa  298  1e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000388335  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4422  PhoH family protein  49.03 
 
 
319 aa  298  1e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.273758  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2230  PhoH family protein  48.56 
 
 
329 aa  296  3e-79  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.148579  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1663  PhoH family protein  48.42 
 
 
315 aa  295  7e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1629  PhoH family protein  48.42 
 
 
315 aa  295  7e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0814  PhoH-like protein  49.84 
 
 
365 aa  295  8e-79  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1225  PhoH family protein  51.31 
 
 
323 aa  294  1e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1105  PhoH family protein  50 
 
 
348 aa  294  2e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000125149 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3697  PhoH family protein  50.32 
 
 
347 aa  294  2e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.104563  hitchhiker  0.00339235 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0422  PhoH family protein  50.31 
 
 
330 aa  294  2e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0513  PhoH-like protein  50.78 
 
 
341 aa  293  3e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3301  lipoate synthase  48.09 
 
 
364 aa  293  3e-78  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0967934 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1198  PhoH family protein  44.92 
 
 
348 aa  293  3e-78  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000331138  normal  0.399191 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1138  PhoH family protein  48.44 
 
 
315 aa  293  4e-78  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1180  PhoH family protein  50.8 
 
 
355 aa  292  5e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12330  hypothetical protein  48.37 
 
 
340 aa  292  5e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1127  hypothetical protein  48.69 
 
 
340 aa  292  6e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3304  PhoH family protein  50.48 
 
 
348 aa  292  6e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3262  PhoH family protein  50.48 
 
 
341 aa  291  8e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3440  PhoH family protein  50.48 
 
 
341 aa  291  8e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00065537 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2924  PhoH family protein  49.53 
 
 
347 aa  291  9e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0071554 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1340  PhoH family protein  46.65 
 
 
328 aa  291  1e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0134835  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1003  PhoH family protein  50.48 
 
 
354 aa  291  1e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00802061  normal  0.173492 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1007  PhoH family protein  50.48 
 
 
354 aa  291  1e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.109119  normal  0.0769537 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2722  PhoH family protein  49.4 
 
 
348 aa  290  2e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.72441  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2082  PhoH-like protein  49.4 
 
 
348 aa  290  2e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1068  PhoH family protein  50.48 
 
 
347 aa  290  2e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00161934  normal  0.0253074 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2694  PhoH family protein  49.4 
 
 
348 aa  290  2e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4666  PhoH family protein  50.49 
 
 
316 aa  290  3e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2856  PhoH family protein  50.16 
 
 
349 aa  289  4e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0452  PhoH-like protein  49.54 
 
 
331 aa  289  4e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.010717  normal  0.615683 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3031  PhoH family protein  47.88 
 
 
319 aa  289  4e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2949  PhoH family protein  49.84 
 
 
350 aa  289  5.0000000000000004e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.8067  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2163  PhoH family protein  48.44 
 
 
344 aa  289  5.0000000000000004e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0763863  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6022  PhoH-like protein  49.11 
 
 
348 aa  288  7e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.611976  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1071  PhoH-like protein  47.13 
 
 
333 aa  288  7e-77  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4241  PhoH family protein  50.33 
 
 
316 aa  288  9e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.220372 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3472  PhoH family protein  50 
 
 
347 aa  288  1e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.020153  normal  0.0289175 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3239  putative phoH-like protein  52.08 
 
 
338 aa  287  2e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004212  phosphate starvation-inducible protein PhoH  49.36 
 
 
365 aa  287  2e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00393498  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0574  PhoH family protein  46.35 
 
 
322 aa  287  2e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.184118  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1231  putative ATP-binding protein in pho regulon  48.6 
 
 
339 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000466652  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3701  PhoH family protein  51.3 
 
 
335 aa  286  2.9999999999999996e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.933672  normal  0.818626 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0712  PhoH family protein  48.87 
 
 
347 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.242379  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0483  phoH family protein  49.36 
 
 
367 aa  286  2.9999999999999996e-76  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000530716  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0492  PhoH family protein  50 
 
 
335 aa  286  2.9999999999999996e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.307318  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3138  PhoH family protein  49.36 
 
 
346 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.504008  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2739  PhoH family protein  49.02 
 
 
328 aa  286  2.9999999999999996e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3950  PhoH family protein  49.09 
 
 
374 aa  286  4e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.493956 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2576  PhoH family protein  48.71 
 
 
356 aa  286  5e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0746934 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>