More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_3697 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_3472  PhoH family protein  90.49 
 
 		 347 aa  640    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.020153  normal  0.0289175 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3697  PhoH family protein  100 
 
 		 347 aa  714    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.104563  hitchhiker  0.00339235 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2924  PhoH family protein  91.2 
 
 		 347 aa  629  1e-179  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0071554 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3138  PhoH family protein  87.28 
 
 		 346 aa  609  1e-173  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.504008  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2576  PhoH family protein  84.35 
 
 		 356 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0746934 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1105  PhoH family protein  83.57 
 
 		 348 aa  577  1e-164  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000125149 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3304  PhoH family protein  83.86 
 
 		 348 aa  580  1e-164  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2856  PhoH family protein  83.33 
 
 		 349 aa  579  1e-164  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0814  PhoH-like protein  80.94 
 
 		 365 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1003  PhoH family protein  82.47 
 
 		 354 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00802061  normal  0.173492 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1007  PhoH family protein  85.03 
 
 		 354 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.109119  normal  0.0769537 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3440  PhoH family protein  83.82 
 
 		 341 aa  568  1e-161  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00065537 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3262  PhoH family protein  83.82 
 
 		 341 aa  568  1e-161  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0712  PhoH family protein  81.74 
 
 		 347 aa  566  1e-160  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.242379  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1180  PhoH family protein  85.02 
 
 		 355 aa  558  1e-158  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1068  PhoH family protein  82.4 
 
 		 347 aa  560  1e-158  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00161934  normal  0.0253074 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01229  hypothetical protein  75.76 
 
 		 365 aa  501  1e-141  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2207  PhoH-like protein  75.88 
 
 		 345 aa  504  1e-141  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.935668  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02231  putative ATP-binding protein in pho regulon  77.04 
 
 		 370 aa  502  1e-141  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.719746  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004212  phosphate starvation-inducible protein PhoH  75.15 
 
 		 365 aa  499  1e-140  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00393498  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0483  phoH family protein  75.45 
 
 		 367 aa  498  1e-140  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000530716  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0787  PhoH family protein  72.83 
 
 		 348 aa  494  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0714  PhoH family protein  72.83 
 
 		 348 aa  494  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0457534  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0728  PhoH family protein  72.83 
 
 		 348 aa  494  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.93581 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0775  PhoH family protein  72.83 
 
 		 348 aa  494  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.774508  normal  0.946623 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0823  PhoH family protein  72.83 
 
 		 348 aa  494  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1186  PhoH family protein  74.04 
 
 		 348 aa  491  9.999999999999999e-139  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0119675 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0534  PhoH family protein  70 
 
 		 342 aa  493  9.999999999999999e-139  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.749286 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00628  predicted protein with nucleoside triphosphate hydrolase domain  74.55 
 
 		 359 aa  490  1e-137  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2966  PhoH family protein  74.55 
 
 		 359 aa  490  1e-137  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.069683  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00619  hypothetical protein  74.55 
 
 		 359 aa  490  1e-137  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3573  phoH family protein  70.18 
 
 		 368 aa  489  1e-137  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.189544  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0587  PhoH family protein  74.24 
 
 		 346 aa  488  1e-137  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.139571  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0689  PhoH family protein  74.55 
 
 		 346 aa  490  1e-137  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00018585  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1107  PhoH family protein  74.03 
 
 		 351 aa  489  1e-137  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3006  PhoH family protein  70.49 
 
 		 357 aa  488  1e-137  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.425195  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2985  PhoH family protein  74.55 
 
 		 359 aa  490  1e-137  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.189197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0707  PhoH family protein  74.55 
 
 		 346 aa  490  1e-137  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0340161  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0682  PhoH family protein  74.55 
 
 		 346 aa  490  1e-137  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0121436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2916  PhoH family protein  70.49 
 
 		 357 aa  488  1e-137  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0010821  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2949  PhoH family protein  75.23 
 
 		 350 aa  488  1e-137  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.8067  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1830  hypothetical protein  70.49 
 
 		 357 aa  488  1e-137  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0753  PhoH family protein  74.55 
 
 		 346 aa  490  1e-137  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00493548  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0995  PhoH-like protein  74.47 
 
 		 356 aa  484  1e-136  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0457768  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3135  PhoH family protein  71.06 
 
 		 352 aa  484  1e-136  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1218  PhoH family protein  71.51 
 
 		 351 aa  485  1e-136  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0284374  normal  0.476314 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1196  PhoH family protein  70.77 
 
 		 352 aa  481  1e-135  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.415676  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3780  PhoH family protein  63.3 
 
 		 350 aa  418  1e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.150452 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0345  PhoH-like ATP-binding protein  60.89 
 
 		 370 aa  416  9.999999999999999e-116  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1458  PhoH family protein  60.79 
 
 		 341 aa  414  1e-114  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.321315  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1127  hypothetical protein  63.61 
 
 		 340 aa  413  1e-114  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12330  hypothetical protein  63.29 
 
 		 340 aa  411  1e-114  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0238  PhoH-like protein  60.62 
 
 		 330 aa  408  1e-113  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4951  PhoH-like protein  64.87 
 
 		 334 aa  410  1e-113  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.643445 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4787  PhoH family protein  61.59 
 
 		 332 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0880837 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09060  PhoH-like protein  62.74 
 
 		 336 aa  401  9.999999999999999e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.706372  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0633  PhoH family protein  59.51 
 
 		 332 aa  398  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0141931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3301  lipoate synthase  60.66 
 
 		 364 aa  399  9.999999999999999e-111  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0967934 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4841  PhoH family protein  61.59 
 
 		 332 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4663  PhoH family protein  61.59 
 
 		 332 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.337379  normal  0.248973 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4805  PhoH-like protein  62.54 
 
 		 340 aa  395  1e-109  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4346  PhoH-like protein  62.22 
 
 		 340 aa  395  1e-109  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0395  PhoH family protein  57.66 
 
 		 343 aa  394  1e-108  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.503054 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00447  ATP-binding protein  61.83 
 
 		 328 aa  392  1e-108  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.000644199  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1353  PhoH family protein  60.76 
 
 		 328 aa  389  1e-107  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000248045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0474  PhoH-like protein  58.07 
 
 		 322 aa  391  1e-107  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2739  PhoH family protein  60.75 
 
 		 328 aa  390  1e-107  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0892  PhoH family protein  55.52 
 
 		 359 aa  386  1e-106  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.427486  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1183  PhoH family protein  60.19 
 
 		 337 aa  383  1e-105  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2291  PhoH family protein  59.2 
 
 		 334 aa  378  1e-104  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1948  ATP binding protein  56.75 
 
 		 327 aa  380  1e-104  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.875532  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1883  PhoH family protein  57.06 
 
 		 327 aa  381  1e-104  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.114064  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2910  PhoH family protein  57.7 
 
 		 348 aa  380  1e-104  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1495  PhoH-like protein  58.44 
 
 		 323 aa  377  1e-103  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0682  PhoH family protein  58.44 
 
 		 323 aa  377  1e-103  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2705  PhoH-like protein  58.23 
 
 		 319 aa  367  1e-100  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.595006 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2335  PhoH-like protein  61.71 
 
 		 364 aa  367  1e-100  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4666  PhoH family protein  55.59 
 
 		 316 aa  354  1e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1970  PhoH family protein  51.74 
 
 		 379 aa  349  4e-95  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0372063  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1225  PhoH family protein  57.88 
 
 		 323 aa  349  4e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0866  PhoH family protein  57.01 
 
 		 339 aa  347  1e-94  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2138  PhoH family protein  55.59 
 
 		 331 aa  347  2e-94  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.888079  normal  0.261527 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0492  PhoH family protein  56.31 
 
 		 335 aa  346  4e-94  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.307318  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0597  PhoH-like protein  56.69 
 
 		 340 aa  345  5e-94  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3701  PhoH family protein  55.99 
 
 		 335 aa  345  5e-94  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.933672  normal  0.818626 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0749  PhoH family protein  56.69 
 
 		 327 aa  345  5e-94  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00019197 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2696  PhoH-like protein  54.74 
 
 		 346 aa  345  6e-94  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0591  PhoH-like protein  51.33 
 
 		 361 aa  345  7e-94  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4067  PhoH family protein  55.05 
 
 		 316 aa  345  8.999999999999999e-94  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.579724 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0509  PhoH family protein  56.96 
 
 		 345 aa  344  1e-93  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4095  PhoH-like protein  54.6 
 
 		 337 aa  343  2e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0738  PhoH-like protein  55.91 
 
 		 338 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.184449  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4241  PhoH family protein  55.7 
 
 		 316 aa  342  5e-93  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.220372 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0627  putative PhoH-like protein, ATPase  50.29 
 
 		 361 aa  342  5.999999999999999e-93  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.121399  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0530  PHOH-like protein  56.09 
 
 		 325 aa  341  1e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.159561  normal  0.089115 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0422  PhoH family protein  55.21 
 
 		 330 aa  341  1e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3330  PhoH family protein  52.98 
 
 		 357 aa  340  2e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.128023 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6022  PhoH-like protein  52.84 
 
 		 348 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.611976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3950  PhoH family protein  54.73 
 
 		 374 aa  339  2.9999999999999998e-92  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.493956 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0888  PhoH family protein  53.15 
 
 		 354 aa  339  4e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.437404  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>