More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_0451 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011004  Rpal_0451  PhoH family protein  100 
 
 
351 aa  710    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0591  PhoH-like protein, phosphate starvation inducible  89.8 
 
 
344 aa  617  1e-176  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0047  putative phosphate starvation-inducible protein, PhoH-like protein  90.06 
 
 
345 aa  617  1e-175  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.959569 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0469  PhoH-like protein  86.32 
 
 
352 aa  615  1e-175  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.803585 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0241  PhoH-like protein  88.86 
 
 
351 aa  614  1e-175  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0022  PhoH-like protein  86.61 
 
 
349 aa  603  1.0000000000000001e-171  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.232507  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0015  PhoH-like protein  84.9 
 
 
349 aa  592  1e-168  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.945712  normal  0.0639944 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1811  PhoH family protein  72.93 
 
 
379 aa  468  1.0000000000000001e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.147763  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1056  PhoH family protein  63.04 
 
 
341 aa  406  1.0000000000000001e-112  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.563658  normal  0.821458 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2896  PhoH family protein  60.47 
 
 
355 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.434704 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3181  PhoH family protein  63.22 
 
 
365 aa  403  1e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0246823  normal  0.0183443 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3529  PhoH family protein  63.47 
 
 
368 aa  401  1e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.556211  normal  0.320113 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0638  PhoH family protein  64.35 
 
 
338 aa  398  9.999999999999999e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.622943 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3400  PhoH family protein  62.46 
 
 
368 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0161796  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3205  PhoH family protein  64.8 
 
 
368 aa  401  9.999999999999999e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0234  PhoH family protein  63.38 
 
 
369 aa  398  9.999999999999999e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.253584  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2155  PhoH family protein  62.54 
 
 
327 aa  391  1e-108  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0868609  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0757  PhoH family protein  59.46 
 
 
353 aa  389  1e-107  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.899998  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0041  PhoH family protein  62.66 
 
 
351 aa  389  1e-107  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000833124 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0030  PhoH family protein  61.23 
 
 
349 aa  385  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.04719 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2067  PhoH family protein  61.9 
 
 
327 aa  385  1e-106  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0286047  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0018  PhoH family protein  61.71 
 
 
350 aa  385  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.28473 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0438  phosphate starvation inducible protein  62.22 
 
 
357 aa  386  1e-106  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.695996  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3920  PhoH-like protein  60.31 
 
 
348 aa  372  1e-102  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3618  PhoH family protein  58.28 
 
 
342 aa  348  6e-95  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1244  PhoH family protein  55.49 
 
 
370 aa  348  6e-95  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3873  hypothetical protein  52.87 
 
 
339 aa  332  7.000000000000001e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.504084  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3599  hypothetical protein  53.17 
 
 
346 aa  331  1e-89  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3284  PhoH family protein  53.17 
 
 
346 aa  331  1e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2388  PhoH family protein  52.16 
 
 
360 aa  330  2e-89  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.156507  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3771  PhoH-like protein  52.81 
 
 
322 aa  330  3e-89  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0981  PhoH-like protein  54.11 
 
 
348 aa  324  2e-87  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0700  PhoH-like protein  50.58 
 
 
373 aa  319  3.9999999999999996e-86  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.233967 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1354  PhoH family protein  52.66 
 
 
333 aa  319  6e-86  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0963523  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1016  PhoH family protein  51.56 
 
 
337 aa  314  1.9999999999999998e-84  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0442383  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3692  PhoH family protein  50.64 
 
 
375 aa  310  2e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.316664  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0069  PhoH family protein  47.01 
 
 
363 aa  308  1.0000000000000001e-82  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0287585 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0779  PhoH family protein  50 
 
 
331 aa  302  7.000000000000001e-81  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1436  PhoH family protein  50.16 
 
 
326 aa  301  8.000000000000001e-81  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.384314 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2230  PhoH family protein  50 
 
 
329 aa  300  2e-80  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.148579  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0188  PhoH-like protein  50 
 
 
338 aa  300  2e-80  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2063  PhoH-like protein  53.38 
 
 
335 aa  300  2e-80  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.590057 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1815  PhoH family protein  48.73 
 
 
323 aa  296  3e-79  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.294918  normal  0.443651 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0574  PhoH family protein  46.71 
 
 
322 aa  296  4e-79  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.184118  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1340  PhoH family protein  46.82 
 
 
328 aa  295  6e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0134835  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1138  PhoH family protein  48.26 
 
 
315 aa  295  1e-78  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0422  PhoH family protein  51.44 
 
 
330 aa  294  1e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1071  PhoH-like protein  47.62 
 
 
333 aa  293  3e-78  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0513  PhoH-like protein  52.38 
 
 
341 aa  292  7e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1629  PhoH family protein  47.48 
 
 
315 aa  291  1e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1663  PhoH family protein  47.48 
 
 
315 aa  291  1e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1105  PhoH family protein  49.85 
 
 
348 aa  290  4e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000125149 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4204  PhoH family protein  47.57 
 
 
319 aa  289  4e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4042  PhoH family protein  47.57 
 
 
319 aa  289  4e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.713354  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4052  PhoH family protein  47.57 
 
 
319 aa  289  4e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4529  PhoH family protein  47.57 
 
 
319 aa  289  4e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3950  PhoH family protein  50 
 
 
374 aa  289  4e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.493956 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4327  PhoH family protein  47.57 
 
 
319 aa  289  4e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.24127e-53 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1231  putative ATP-binding protein in pho regulon  50.32 
 
 
339 aa  289  5.0000000000000004e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000466652  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4156  PhoH family protein  48.22 
 
 
319 aa  289  5.0000000000000004e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2722  PhoH family protein  49.09 
 
 
348 aa  289  6e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.72441  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0814  PhoH-like protein  50 
 
 
365 aa  289  6e-77  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2082  PhoH-like protein  49.09 
 
 
348 aa  289  6e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2694  PhoH family protein  49.09 
 
 
348 aa  289  6e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2924  PhoH family protein  50.32 
 
 
347 aa  288  8e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0071554 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4385  PhoH family protein  47.9 
 
 
319 aa  288  1e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.550893  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3697  PhoH family protein  50.16 
 
 
347 aa  288  1e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.104563  hitchhiker  0.00339235 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0452  PhoH-like protein  50 
 
 
331 aa  288  1e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.010717  normal  0.615683 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4438  PhoH family protein  47.9 
 
 
319 aa  288  1e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000388335  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2295  PhoH family protein  47.42 
 
 
354 aa  287  2e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0814  PhoH family protein  47.57 
 
 
319 aa  287  2e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.429473  decreased coverage  1.44799e-22 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0712  PhoH family protein  50 
 
 
347 aa  287  2e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.242379  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0407  PhoH family protein  51.12 
 
 
330 aa  287  2e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0842646 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2705  PhoH-like protein  48.58 
 
 
319 aa  286  2.9999999999999996e-76  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.595006 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3304  PhoH family protein  50.32 
 
 
348 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2739  PhoH family protein  49.51 
 
 
328 aa  286  2.9999999999999996e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6022  PhoH-like protein  48.79 
 
 
348 aa  286  4e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.611976  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3262  PhoH family protein  50.32 
 
 
341 aa  286  4e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3440  PhoH family protein  50.32 
 
 
341 aa  286  4e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00065537 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4422  PhoH family protein  47.57 
 
 
319 aa  286  4e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.273758  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3138  PhoH family protein  49.36 
 
 
346 aa  286  4e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.504008  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0866  PhoH family protein  51.14 
 
 
339 aa  286  5e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3538  PhoH-like protein  49.83 
 
 
359 aa  285  5.999999999999999e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1198  PhoH family protein  46.71 
 
 
348 aa  285  7e-76  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000331138  normal  0.399191 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12330  hypothetical protein  46.58 
 
 
340 aa  285  8e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1127  hypothetical protein  45.92 
 
 
340 aa  285  9e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3472  PhoH family protein  49.84 
 
 
347 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.020153  normal  0.0289175 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3031  PhoH family protein  47.08 
 
 
319 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2611  PhoH family protein  48.79 
 
 
348 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.126253  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1225  PhoH family protein  50.65 
 
 
323 aa  283  2.0000000000000002e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1184  phosphate starvation-inducible protein PhoH, ATPase  50 
 
 
319 aa  283  2.0000000000000002e-75  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2163  PhoH family protein  50.16 
 
 
344 aa  283  2.0000000000000002e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0763863  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0888  PhoH family protein  49.1 
 
 
354 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.437404  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0709  PhoH family protein  49.1 
 
 
354 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.95861  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0723  PhoH family protein  49.1 
 
 
354 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2576  PhoH family protein  49.36 
 
 
356 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0746934 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1733  PhoH family protein  48.41 
 
 
326 aa  283  4.0000000000000003e-75  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0604  PhoH family protein  49.39 
 
 
348 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2357  PhoH family protein  48.8 
 
 
352 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0534  PhoH family protein  45.62 
 
 
342 aa  283  4.0000000000000003e-75  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.749286 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>