More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3301 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_3301  lipoate synthase  100 
 
 		 364 aa  747    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0967934 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4787  PhoH family protein  63.61 
 
 		 332 aa  425  1e-118  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0880837 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4663  PhoH family protein  63.61 
 
 		 332 aa  425  1e-118  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.337379  normal  0.248973 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4951  PhoH-like protein  64.78 
 
 		 334 aa  424  1e-117  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.643445 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2739  PhoH family protein  62.73 
 
 		 328 aa  421  1e-117  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1127  hypothetical protein  63.72 
 
 		 340 aa  422  1e-117  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4841  PhoH family protein  63.31 
 
 		 332 aa  422  1e-117  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0633  PhoH family protein  61.83 
 
 		 332 aa  420  1e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0141931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12330  hypothetical protein  63.11 
 
 		 340 aa  420  1e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3780  PhoH family protein  64.11 
 
 		 350 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.150452 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2910  PhoH family protein  58.38 
 
 		 348 aa  415  9.999999999999999e-116  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4805  PhoH-like protein  63.44 
 
 		 340 aa  413  1e-114  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4346  PhoH-like protein  63.39 
 
 		 340 aa  413  1e-114  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09060  PhoH-like protein  62.16 
 
 		 336 aa  409  1e-113  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.706372  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1107  PhoH family protein  61.27 
 
 		 351 aa  395  1e-109  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2924  PhoH family protein  57.92 
 
 		 347 aa  397  1e-109  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0071554 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2949  PhoH family protein  61.56 
 
 		 350 aa  395  1e-109  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.8067  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0483  phoH family protein  61.34 
 
 		 367 aa  395  1e-109  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000530716  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0814  PhoH-like protein  57.42 
 
 		 365 aa  398  1e-109  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1186  PhoH family protein  61.78 
 
 		 348 aa  397  1e-109  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0119675 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1218  PhoH family protein  60.67 
 
 		 351 aa  398  1e-109  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0284374  normal  0.476314 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0534  PhoH family protein  58 
 
 		 342 aa  395  1e-109  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.749286 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1458  PhoH family protein  56.76 
 
 		 341 aa  392  1e-108  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.321315  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3697  PhoH family protein  59.15 
 
 		 347 aa  392  1e-108  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.104563  hitchhiker  0.00339235 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0712  PhoH family protein  59.31 
 
 		 347 aa  392  1e-108  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.242379  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01229  hypothetical protein  62.35 
 
 		 365 aa  394  1e-108  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004212  phosphate starvation-inducible protein PhoH  61.95 
 
 		 365 aa  392  1e-108  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00393498  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00628  predicted protein with nucleoside triphosphate hydrolase domain  60.45 
 
 		 359 aa  390  1e-107  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2966  PhoH family protein  60.45 
 
 		 359 aa  390  1e-107  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.069683  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0587  PhoH family protein  59.66 
 
 		 346 aa  389  1e-107  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.139571  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0689  PhoH family protein  59.94 
 
 		 346 aa  390  1e-107  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00018585  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0823  PhoH family protein  60.8 
 
 		 348 aa  390  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02231  putative ATP-binding protein in pho regulon  60.28 
 
 		 370 aa  389  1e-107  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.719746  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0728  PhoH family protein  60.8 
 
 		 348 aa  390  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.93581 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0775  PhoH family protein  60.8 
 
 		 348 aa  390  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.774508  normal  0.946623 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0753  PhoH family protein  59.94 
 
 		 346 aa  390  1e-107  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00493548  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0714  PhoH family protein  60.8 
 
 		 348 aa  390  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0457534  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0682  PhoH family protein  59.94 
 
 		 346 aa  390  1e-107  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0121436  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00619  hypothetical protein  60.45 
 
 		 359 aa  390  1e-107  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0707  PhoH family protein  59.94 
 
 		 346 aa  390  1e-107  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0340161  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0995  PhoH-like protein  61.49 
 
 		 356 aa  389  1e-107  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0457768  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0787  PhoH family protein  60.8 
 
 		 348 aa  390  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2985  PhoH family protein  60.45 
 
 		 359 aa  390  1e-107  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.189197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2856  PhoH family protein  59.31 
 
 		 349 aa  385  1e-106  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3304  PhoH family protein  59.14 
 
 		 348 aa  385  1e-106  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3472  PhoH family protein  57.3 
 
 		 347 aa  385  1e-106  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.020153  normal  0.0289175 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2335  PhoH-like protein  62.58 
 
 		 364 aa  386  1e-106  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1830  hypothetical protein  60.11 
 
 		 357 aa  388  1e-106  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3135  PhoH family protein  58.61 
 
 		 352 aa  386  1e-106  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3138  PhoH family protein  60.41 
 
 		 346 aa  387  1e-106  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.504008  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1196  PhoH family protein  58.61 
 
 		 352 aa  387  1e-106  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.415676  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2207  PhoH-like protein  60.33 
 
 		 345 aa  387  1e-106  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.935668  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1003  PhoH family protein  58.29 
 
 		 354 aa  387  1e-106  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00802061  normal  0.173492 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1007  PhoH family protein  58.29 
 
 		 354 aa  387  1e-106  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.109119  normal  0.0769537 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3006  PhoH family protein  60.11 
 
 		 357 aa  388  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.425195  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2916  PhoH family protein  60.11 
 
 		 357 aa  388  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0010821  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2576  PhoH family protein  60.12 
 
 		 356 aa  387  1e-106  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0746934 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3573  phoH family protein  57.65 
 
 		 368 aa  384  1e-105  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.189544  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3262  PhoH family protein  60.12 
 
 		 341 aa  381  1e-105  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1180  PhoH family protein  60.82 
 
 		 355 aa  384  1e-105  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1105  PhoH family protein  59.14 
 
 		 348 aa  384  1e-105  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000125149 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00447  ATP-binding protein  59.88 
 
 		 328 aa  382  1e-105  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.000644199  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3440  PhoH family protein  60.12 
 
 		 341 aa  381  1e-105  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00065537 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1068  PhoH family protein  59.21 
 
 		 347 aa  384  1e-105  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00161934  normal  0.0253074 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0238  PhoH-like protein  57.93 
 
 		 330 aa  380  1e-104  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0395  PhoH family protein  57.88 
 
 		 343 aa  381  1e-104  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.503054 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0892  PhoH family protein  55.46 
 
 		 359 aa  378  1e-104  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.427486  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2291  PhoH family protein  59.82 
 
 		 334 aa  377  1e-103  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1353  PhoH family protein  58.15 
 
 		 328 aa  374  1e-102  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000248045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0627  putative PhoH-like protein, ATPase  55.14 
 
 		 361 aa  374  1e-102  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.121399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1970  PhoH family protein  55.33 
 
 		 379 aa  372  1e-102  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0372063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0591  PhoH-like protein  57.1 
 
 		 361 aa  372  1e-102  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1883  PhoH family protein  57.28 
 
 		 327 aa  368  1e-101  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.114064  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0474  PhoH-like protein  55.72 
 
 		 322 aa  365  1e-100  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1948  ATP binding protein  56.97 
 
 		 327 aa  367  1e-100  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.875532  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0345  PhoH-like ATP-binding protein  53.89 
 
 		 370 aa  356  2.9999999999999997e-97  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1495  PhoH-like protein  53.73 
 
 		 323 aa  354  1e-96  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0682  PhoH family protein  53.73 
 
 		 323 aa  355  1e-96  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0597  PhoH-like protein  54.8 
 
 		 340 aa  345  5e-94  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0749  PhoH family protein  54.8 
 
 		 327 aa  345  5e-94  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00019197 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1183  PhoH family protein  55.66 
 
 		 337 aa  343  2e-93  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2138  PhoH family protein  53.03 
 
 		 331 aa  340  2e-92  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.888079  normal  0.261527 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0492  PhoH family protein  52.62 
 
 		 335 aa  335  1e-90  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.307318  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3701  PhoH family protein  52.31 
 
 		 335 aa  333  4e-90  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.933672  normal  0.818626 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4067  PhoH family protein  53.12 
 
 		 316 aa  333  4e-90  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.579724 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4666  PhoH family protein  52.5 
 
 		 316 aa  332  4e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3239  putative phoH-like protein  52.96 
 
 		 338 aa  332  6e-90  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4095  PhoH-like protein  54.21 
 
 		 337 aa  331  1e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1225  PhoH family protein  52.19 
 
 		 323 aa  331  1e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0509  PhoH family protein  54.52 
 
 		 345 aa  328  6e-89  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2705  PhoH-like protein  50.46 
 
 		 319 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.595006 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4241  PhoH family protein  52.81 
 
 		 316 aa  328  1.0000000000000001e-88  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.220372 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2747  PhoH family protein  51.28 
 
 		 348 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0636869  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2611  PhoH family protein  51.59 
 
 		 348 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.126253  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0513  PhoH-like protein  51.5 
 
 		 341 aa  325  5e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0650  PhoH-like protein  51.53 
 
 		 328 aa  325  8.000000000000001e-88  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0888  PhoH family protein  50.14 
 
 		 354 aa  325  1e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.437404  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3950  PhoH family protein  50.74 
 
 		 374 aa  324  1e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.493956 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0709  PhoH family protein  50.14 
 
 		 354 aa  324  1e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.95861  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0723  PhoH family protein  50.14 
 
 		 354 aa  324  1e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>