More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0579 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_0579  PhoH family protein  100 
 
 
318 aa  635    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.818814  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0986  PhoH family protein  70.25 
 
 
318 aa  456  1e-127  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1285  PhoH family protein  65.71 
 
 
322 aa  424  1e-118  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000129158  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1401  PhoH family protein  65.71 
 
 
322 aa  424  1e-117  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.100499  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0844  PhoH family protein  58.28 
 
 
293 aa  338  5.9999999999999996e-92  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2230  PhoH family protein  52.83 
 
 
329 aa  335  7.999999999999999e-91  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.148579  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12600  PhoH family protein  56.58 
 
 
320 aa  331  8e-90  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1272  PhoH family protein  53.61 
 
 
325 aa  331  1e-89  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1198  PhoH family protein  56.25 
 
 
348 aa  329  3e-89  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000331138  normal  0.399191 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0574  PhoH family protein  54.4 
 
 
322 aa  328  7e-89  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.184118  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1815  PhoH family protein  54.55 
 
 
323 aa  323  3e-87  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.294918  normal  0.443651 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0593  PhoH-like protein  53.63 
 
 
333 aa  320  9.999999999999999e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.318782  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1071  PhoH-like protein  53.62 
 
 
333 aa  321  9.999999999999999e-87  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0134  PhoH family protein  52.9 
 
 
319 aa  319  3e-86  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1733  PhoH family protein  50.32 
 
 
326 aa  318  7.999999999999999e-86  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0779  PhoH family protein  52.77 
 
 
331 aa  318  9e-86  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4280  PhoH family protein  55.08 
 
 
323 aa  318  9e-86  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2206  PhoH family protein  51.27 
 
 
333 aa  317  1e-85  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00548846 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1340  PhoH family protein  51.38 
 
 
328 aa  315  6e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0134835  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0329  PhoH family protein  52.9 
 
 
316 aa  313  1.9999999999999998e-84  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1272  PhoH-like protein protein  53.59 
 
 
352 aa  312  3.9999999999999997e-84  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.31699  normal  0.481954 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0255  PhoH family protein  55.02 
 
 
328 aa  312  3.9999999999999997e-84  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12394  phoH-like protein phoH1 (phosphate starvation-inducible protein psiH)  53.67 
 
 
352 aa  311  6.999999999999999e-84  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2713  PhoH family protein  48.87 
 
 
356 aa  311  7.999999999999999e-84  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.787993  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1566  PhoH-like protein  52.06 
 
 
322 aa  310  2.9999999999999997e-83  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.359583  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3387  PhoH family protein  50.48 
 
 
375 aa  309  4e-83  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.659837 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2905  PhoH family protein  47.5 
 
 
359 aa  309  4e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.21329  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2813  PhoH family protein  47.5 
 
 
359 aa  309  5e-83  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3467  PhoH family protein  51.92 
 
 
357 aa  308  6.999999999999999e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.015244 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3519  PhoH family protein  51.92 
 
 
357 aa  308  6.999999999999999e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.311943 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3070  PhoH family protein  52.35 
 
 
324 aa  308  8e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000842405 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0789  PhoH family protein  51.58 
 
 
333 aa  308  8e-83  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0567134 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3538  PhoH-like protein  50.65 
 
 
359 aa  307  1.0000000000000001e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1750  PhoH family protein  50 
 
 
376 aa  307  1.0000000000000001e-82  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.224703  normal  0.417547 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2706  PhoH family protein  51.1 
 
 
353 aa  306  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.622872 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2721  PhoH-like protein  48.23 
 
 
354 aa  307  2.0000000000000002e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.602788  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1653  phoH family protein  51.28 
 
 
332 aa  306  4.0000000000000004e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2484  PhoH family protein  52.16 
 
 
320 aa  306  4.0000000000000004e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0844  phosphate starvation-inducible protein PhoH ATPase  51.9 
 
 
381 aa  305  5.0000000000000004e-82  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7049  PhoH family protein  51.39 
 
 
393 aa  305  6e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.971543 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17250  phosphate starvation-inducible protein PhoH, predicted ATPase  49.39 
 
 
350 aa  305  7e-82  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.465991  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3453  PhoH family protein  50.96 
 
 
380 aa  304  2.0000000000000002e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.127019 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1658  PhoH family protein  49.52 
 
 
376 aa  303  3.0000000000000004e-81  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3456  PhoH-like protein  52.15 
 
 
319 aa  303  3.0000000000000004e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.745001  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3159  PhoH family protein  51.76 
 
 
343 aa  302  4.0000000000000003e-81  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00307849  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1385  PhoH family protein  51.92 
 
 
320 aa  302  5.000000000000001e-81  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2611  PhoH family protein  51.5 
 
 
351 aa  301  9e-81  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1083  PhoH family protein  52.12 
 
 
319 aa  301  1e-80  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0140162  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2112  PhoH family protein  49.21 
 
 
354 aa  301  1e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0707  PhoH family protein  48.75 
 
 
369 aa  301  1e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2295  PhoH family protein  51.1 
 
 
354 aa  301  1e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11730  phosphate starvation-inducible protein PhoH, predicted ATPase  47.81 
 
 
346 aa  301  1e-80  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.332483  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2048  PhoH family protein  50.8 
 
 
323 aa  300  2e-80  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1267  PhoH-like protein  49.52 
 
 
345 aa  300  2e-80  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0973906 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3832  PhoH family protein  50.64 
 
 
351 aa  300  2e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4627  PhoH family protein  48.74 
 
 
344 aa  299  3e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0248717 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1511  PhoH-like protein  51.63 
 
 
303 aa  300  3e-80  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.489678  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1415  PhoH family protein  52.61 
 
 
319 aa  299  4e-80  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000470642  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1415  PhoH family protein  51.95 
 
 
332 aa  299  4e-80  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3832  PhoH family protein  51.15 
 
 
329 aa  298  6e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00992918 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3573  phoH family protein  49.38 
 
 
368 aa  297  2e-79  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.189544  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2188  PhoH family protein  48.58 
 
 
345 aa  296  2e-79  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2762  PhoH family protein  50.81 
 
 
361 aa  296  3e-79  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0978111  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3247  PhoH family protein  49.21 
 
 
348 aa  296  3e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00788722  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1156  PhoH family protein  51.11 
 
 
340 aa  296  3e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.980193 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1127  hypothetical protein  48.36 
 
 
340 aa  296  4e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09060  PhoH-like protein  50.48 
 
 
336 aa  296  4e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.706372  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12330  hypothetical protein  49.66 
 
 
340 aa  295  6e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2910  PhoH family protein  51.46 
 
 
348 aa  295  7e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1969  PhoH family protein  50.48 
 
 
362 aa  295  9e-79  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000703344 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1985  PhoH family protein  49.04 
 
 
323 aa  295  9e-79  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.460583  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1231  putative ATP-binding protein in pho regulon  47.51 
 
 
339 aa  294  1e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000466652  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1093  PhoH family protein  52.96 
 
 
320 aa  294  1e-78  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.763193  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0575  PhoH family protein  48.09 
 
 
331 aa  294  1e-78  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0928819 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1912  PhoH family protein  49.84 
 
 
345 aa  294  2e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.237324  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1152  PhoH family protein  49.5 
 
 
321 aa  293  3e-78  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1283  PhoH family protein  50.16 
 
 
333 aa  293  3e-78  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.395155  normal  0.918011 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3780  PhoH family protein  50.17 
 
 
350 aa  293  4e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.150452 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1458  PhoH family protein  47.5 
 
 
341 aa  292  4e-78  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.321315  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4951  PhoH-like protein  49.84 
 
 
334 aa  291  9e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.643445 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4787  PhoH family protein  50 
 
 
332 aa  291  1e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0880837 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3031  PhoH family protein  50.99 
 
 
319 aa  291  1e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1209  PhoH family protein  52.29 
 
 
318 aa  291  1e-77  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000085366  normal  0.439996 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4663  PhoH family protein  50 
 
 
332 aa  291  1e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.337379  normal  0.248973 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0597  PhoH-like protein  46.53 
 
 
340 aa  290  2e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0754  PhoH family protein  53.11 
 
 
329 aa  290  2e-77  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0749  PhoH family protein  46.53 
 
 
327 aa  290  2e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00019197 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1576  PhoH family protein  49.35 
 
 
355 aa  290  2e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0922563  normal  0.0310303 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4841  PhoH family protein  49.66 
 
 
332 aa  289  4e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13470  phosphate starvation-inducible protein PhoH, predicted ATPase  46.2 
 
 
353 aa  289  4e-77  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.112875 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13580  phosphate starvation-inducible protein PhoH, predicted ATPase  48.57 
 
 
349 aa  289  4e-77  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.340051 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0633  PhoH family protein  49.33 
 
 
332 aa  289  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0141931  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00447  ATP-binding protein  49.52 
 
 
328 aa  289  6e-77  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.000644199  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4327  PhoH family protein  49.34 
 
 
319 aa  288  1e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.24127e-53 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4805  PhoH-like protein  49.17 
 
 
340 aa  287  1e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4204  PhoH family protein  49.34 
 
 
319 aa  288  1e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4346  PhoH-like protein  49.17 
 
 
340 aa  287  1e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4529  PhoH family protein  49.34 
 
 
319 aa  288  1e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2426  PhoH family protein  48.22 
 
 
320 aa  288  1e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000154292  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1546  PhoH family protein  47.8 
 
 
350 aa  288  1e-76  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>