49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1668 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_1668  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 137 aa  280  3.0000000000000004e-75  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00903838  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1530  XRE family transcriptional regulator  53.08 
 
 		 137 aa  139  1.9999999999999998e-32  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0465  transcriptional regulator, XRE family  39.24 
 
 		 163 aa  50.8  0.000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00289124  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1604  DNA-binding protein  39.19 
 
 		 114 aa  50.4  0.000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00115974  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3618  XRE family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 123 aa  49.7  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0702  XRE family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 137 aa  49.3  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000217339  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20950  putative prophage repressor  37.18 
 
 		 200 aa  48.9  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000578065  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2375  hypothetical protein  39.74 
 
 		 220 aa  48.1  0.00004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07480  helix-turn-helix domain protein  37.5 
 
 		 301 aa  47.4  0.00007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.961759  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0281  XRE family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 78 aa  47.4  0.00007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0335018  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0344  putative HTH-type transcriptional regulator  33.78 
 
 		 318 aa  46.6  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0939644  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0364  XRE family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 231 aa  45.8  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2431  XRE family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 143 aa  45.1  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3135  transcriptional regulator, XRE family  37.68 
 
 		 137 aa  45.1  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.317529  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4781  transcriptional regulator, XRE family  29.69 
 
 		 113 aa  45.1  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00061071  normal  0.699893 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4788  transcriptional regulator, XRE family  29.69 
 
 		 114 aa  45.4  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000000200631  normal  0.763075 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3138  transcriptional regulator AnsR  33.72 
 
 		 125 aa  44.7  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3117  transcriptional regulator AnsR  33.72 
 
 		 125 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3160  transcriptional regulator AnsR  33.72 
 
 		 125 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.980504  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2847  ans operon repressor protein  33.72 
 
 		 125 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2120  transcriptional regulator AnsR  33.72 
 
 		 125 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2917  transcriptional regulator AnsR  33.72 
 
 		 125 aa  44.7  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.41229  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3137  transcriptional regulator AnsR  33.72 
 
 		 125 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3317  transcriptional regulator, XRE family  36.36 
 
 		 281 aa  45.1  0.0004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000786405  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2885  ans operon repressor protein  33.72 
 
 		 125 aa  44.7  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0484001  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0575  XRE family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 115 aa  43.9  0.0007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000142648  normal  0.969931 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0147  hypothetical protein  34.15 
 
 		 234 aa  43.9  0.0007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1365  helix-turn-helix domain-containing protein  29.66 
 
 		 352 aa  43.9  0.0007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6747  XRE family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 115 aa  43.9  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0637  XRE family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 115 aa  43.9  0.0007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000152617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1715  XRE family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 152 aa  43.9  0.0008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000119777  normal  0.864438 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0495  XRE family transcriptional regulator  43.59 
 
 		 100 aa  43.9  0.0008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00400235  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1027  transcriptional regulator, XRE family  36.99 
 
 		 321 aa  43.9  0.0008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0117  transcriptional regulator, XRE family  48.65 
 
 		 118 aa  43.1  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1349  immunity repressor protein  35.14 
 
 		 144 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4028  prophage LambdaBa02, repressor protein  29.17 
 
 		 122 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.210086  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2791  XRE family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 139 aa  43.1  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2460  XRE family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 142 aa  43.5  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0113682  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0165  hypothetical protein  35.37 
 
 		 227 aa  42.7  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0510  XRE family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 114 aa  42  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000759518  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3288  transcriptional regulator, XRE family  28.23 
 
 		 135 aa  42  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2436  transcriptional regulator, XRE family  35.9 
 
 		 104 aa  41.6  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3459  transcriptional regulator  33.7 
 
 		 145 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00424563  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4126  prophage LambdaBa02, repressor protein  28.12 
 
 		 122 aa  41.2  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.158818  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3831  prophage LambdaBa02, repressor protein  28.12 
 
 		 122 aa  41.2  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0071415  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0776  helix-turn-helix domain-containing protein  52.94 
 
 		 123 aa  40.4  0.008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000212762  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1292  transcriptional regulator, XRE family  31.08 
 
 		 110 aa  40  0.009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.020008  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3095  XRE family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 152 aa  40  0.009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3465  XRE family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 142 aa  40  0.01  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>