More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_6171 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_6171  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  100 
 
 
368 aa  745    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.025897 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4359  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  70.54 
 
 
344 aa  466  9.999999999999999e-131  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.657095  normal  0.503804 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6326  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  55.45 
 
 
347 aa  345  1e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.116507  normal  0.0480291 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0527  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  43.64 
 
 
338 aa  278  1e-73  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2465  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  41.84 
 
 
347 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.844771  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0410  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  42.99 
 
 
335 aa  272  7e-72  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.133119  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3166  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  42.73 
 
 
340 aa  272  8.000000000000001e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1168  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  44.61 
 
 
348 aa  271  1e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000189528  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1400  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  42.48 
 
 
348 aa  271  2e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00002128  hitchhiker  5.26638e-21 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1903  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  44.95 
 
 
339 aa  271  2e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000116797  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3899  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  42.48 
 
 
348 aa  271  2e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00229604  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2452  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  41.84 
 
 
347 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2185  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  41.84 
 
 
347 aa  270  4e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.132113  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2530  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  41.84 
 
 
347 aa  270  4e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00134439  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1042  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  41.02 
 
 
343 aa  270  4e-71  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.161921  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1167  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  41.32 
 
 
343 aa  269  5e-71  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.371916  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2268  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  41.54 
 
 
347 aa  269  5e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3652  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  42.18 
 
 
349 aa  269  5e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0452792  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2436  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  41.54 
 
 
347 aa  269  5e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.606943  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3812  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  42.18 
 
 
348 aa  269  5.9999999999999995e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.82392e-61 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3937  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  42.18 
 
 
348 aa  269  5.9999999999999995e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00621767  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2228  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  41.84 
 
 
347 aa  269  7e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0790084  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2392  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  41.54 
 
 
347 aa  269  7e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3838  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  42.18 
 
 
348 aa  268  1e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.747438  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3560  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  42.18 
 
 
349 aa  268  1e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0433298  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2241  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  41.25 
 
 
347 aa  268  1e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.363521  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3848  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  42.18 
 
 
348 aa  268  1e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000145815  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3542  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  41.89 
 
 
349 aa  267  2e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000959699  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_845  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  43.87 
 
 
338 aa  267  2e-70  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.514485  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0765  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  41.02 
 
 
343 aa  268  2e-70  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00127422  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0687  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  41.87 
 
 
337 aa  266  4e-70  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0640  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  44.41 
 
 
344 aa  265  8e-70  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0972  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  42.94 
 
 
338 aa  264  2e-69  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0636  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  43.67 
 
 
344 aa  264  2e-69  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00726008  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1463  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  41.74 
 
 
341 aa  264  2e-69  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1135  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  41.69 
 
 
333 aa  263  3e-69  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0863  aspartate semialdehyde dehydrogenase  42.64 
 
 
338 aa  263  4e-69  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3570  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  41.76 
 
 
348 aa  263  4.999999999999999e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00136281  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0724  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  44.11 
 
 
344 aa  263  4.999999999999999e-69  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.675858  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2939  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  41.25 
 
 
347 aa  263  4.999999999999999e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0514925  hitchhiker  0.00000205933 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2453  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  42.18 
 
 
348 aa  262  6.999999999999999e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000194693  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01202  Aspartate-semialdehyde dehydrogenase  43.67 
 
 
338 aa  262  8e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1458  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  41.14 
 
 
344 aa  261  1e-68  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.920891  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3606  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  44.17 
 
 
347 aa  259  4e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2854  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  44.41 
 
 
342 aa  259  6e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.923137  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2926  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  40.36 
 
 
348 aa  259  6e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2060  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  42.9 
 
 
347 aa  258  1e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2160  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  42.25 
 
 
325 aa  257  2e-67  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2990  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  43.25 
 
 
339 aa  257  2e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.478455  normal  0.64702 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3032  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  43.25 
 
 
339 aa  257  2e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.59861 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01262  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  42.94 
 
 
341 aa  256  4e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1448  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  45.35 
 
 
345 aa  256  4e-67  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1871  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  42.25 
 
 
325 aa  256  4e-67  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3660  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  41.77 
 
 
329 aa  256  6e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.487501  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2220  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  41.69 
 
 
340 aa  256  6e-67  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.763212  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3170  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  40.06 
 
 
348 aa  255  7e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3351  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  42.12 
 
 
339 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0830053 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5364  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  42.17 
 
 
337 aa  254  1.0000000000000001e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.190609  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0910  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  42.42 
 
 
339 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000070881  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0424  hypothetical protein  42.3 
 
 
332 aa  253  3e-66  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1047  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  42.42 
 
 
339 aa  253  3e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00486598  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1941  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  40.06 
 
 
340 aa  253  5.000000000000001e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.733379  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3654  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  40.3 
 
 
330 aa  252  7e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00566269  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2250  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  42.17 
 
 
340 aa  252  7e-66  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0319  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  39.94 
 
 
343 aa  252  7e-66  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0338  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  41.14 
 
 
344 aa  252  7e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2062  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  42.77 
 
 
340 aa  252  8.000000000000001e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0493  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  41.44 
 
 
344 aa  252  9.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.60024  normal  0.710301 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1782  aspartate semialdehyde dehydrogenase  41.21 
 
 
339 aa  252  9.000000000000001e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.017997  hitchhiker  0.00498224 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0537  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  39.88 
 
 
329 aa  252  9.000000000000001e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1243  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  39.66 
 
 
342 aa  251  1e-65  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0237  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  40.67 
 
 
344 aa  251  1e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00833547 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1231  aspartate semialdehyde dehydrogenase  41.92 
 
 
340 aa  251  1e-65  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.160291 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0961  aspartate semialdehyde dehydrogenase  41.46 
 
 
332 aa  251  2e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08670  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  40.98 
 
 
351 aa  250  2e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0724448  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0587  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  40.77 
 
 
345 aa  250  2e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2183  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  41.62 
 
 
329 aa  251  2e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2221  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  41.87 
 
 
340 aa  250  3e-65  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2183  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  44.07 
 
 
349 aa  250  3e-65  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0306509  normal  0.940701 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03103  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  42.17 
 
 
337 aa  250  3e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002872  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  42.07 
 
 
337 aa  249  4e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0797453  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1949  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  42.22 
 
 
339 aa  248  8e-65  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0139  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  41.27 
 
 
330 aa  249  8e-65  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0283298 
 
 
-
 
NC_002950  PG0571  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  40.06 
 
 
337 aa  248  9e-65  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2308  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  41.46 
 
 
338 aa  248  1e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000121331  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0229  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  40.54 
 
 
344 aa  248  1e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0344  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  41.14 
 
 
344 aa  248  1e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.034026 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1320  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  39.7 
 
 
329 aa  248  1e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2986  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  41.99 
 
 
332 aa  248  1e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0787481  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1424  aspartate semialdehyde dehydrogenase  41.77 
 
 
338 aa  248  1e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000300384  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1489  aspartate semialdehyde dehydrogenase  41.77 
 
 
338 aa  248  1e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000183684  normal  0.923378 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0997  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  40.85 
 
 
328 aa  248  1e-64  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0122  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  39.64 
 
 
345 aa  247  2e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.222343 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2919  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  40.18 
 
 
340 aa  248  2e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1477  aspartate semialdehyde dehydrogenase  41.46 
 
 
338 aa  247  2e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000311076  normal  0.537594 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1066  aspartate semialdehyde dehydrogenase  43.12 
 
 
335 aa  246  3e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.058115  hitchhiker  0.00506315 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1484  aspartate-semialdehyde dehydrogenase, USG-1 related  41.09 
 
 
338 aa  246  3e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0171916  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1691  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  42.38 
 
 
338 aa  246  3e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000277188  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0757  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  40.3 
 
 
350 aa  247  3e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.88543 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2986  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  40.61 
 
 
338 aa  246  4e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000971394  normal  0.367426 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>