231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_6061 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_6061  ATP synthase F1, epsilon subunit  100 
 
 
140 aa  280  4.0000000000000003e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0114  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.58 
 
 
138 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.693828  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3457  ATP synthase F1, epsilon subunit  34.35 
 
 
137 aa  72  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3405  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  38.68 
 
 
138 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4264  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32.12 
 
 
138 aa  67  0.00000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4034  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  34.75 
 
 
138 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000113371 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3949  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  34.75 
 
 
138 aa  65.5  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1508  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35.09 
 
 
138 aa  65.5  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2958  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.09 
 
 
141 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0177  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.09 
 
 
141 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.313145  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3354  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.09 
 
 
141 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1586  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.09 
 
 
141 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3967  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.09 
 
 
141 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4041  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.09 
 
 
141 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3016  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.09 
 
 
141 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3130  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  30.43 
 
 
138 aa  63.9  0.0000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0107  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.09 
 
 
141 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0123  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.09 
 
 
141 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0950  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  30.43 
 
 
138 aa  63.2  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.594443  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3289  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.09 
 
 
141 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0107  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.09 
 
 
141 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.722454 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2948  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.09 
 
 
141 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0098  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.09 
 
 
141 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.712946  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0107  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.09 
 
 
141 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2581  ATP synthase F1, epsilon subunit  36.94 
 
 
134 aa  63.2  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3307  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.09 
 
 
141 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.236426  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3169  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35.09 
 
 
138 aa  60.8  0.000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00353797  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5429  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  31.03 
 
 
133 aa  58.2  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.886017  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4986  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  31.03 
 
 
133 aa  58.2  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.761733  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5004  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  31.03 
 
 
133 aa  58.2  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000172013  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5425  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  31.03 
 
 
133 aa  58.2  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0122155  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5481  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  31.03 
 
 
133 aa  58.2  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5102  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  31.03 
 
 
133 aa  58.5  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3026  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  29.63 
 
 
141 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6634  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  34.81 
 
 
133 aa  57.8  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0501397 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3302  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  31.9 
 
 
134 aa  57.8  0.00000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3414  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  31.03 
 
 
133 aa  57.8  0.00000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0041  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  29.63 
 
 
141 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.952205  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2211  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  31.53 
 
 
138 aa  57.8  0.00000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3893  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  28.89 
 
 
141 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.159746  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5154  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  30.17 
 
 
133 aa  57.4  0.00000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000334813  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5546  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  30.17 
 
 
133 aa  57.4  0.00000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000710132  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5525  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  30.17 
 
 
133 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000524846  hitchhiker  0.00000000227919 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3729  ATP synthase F1, epsilon subunit  27.34 
 
 
139 aa  57.4  0.00000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5395  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  30.17 
 
 
133 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.03867e-36 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5089  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  31.73 
 
 
138 aa  57.4  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0607  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  34.48 
 
 
138 aa  57.4  0.00000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.444989  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0216  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  31.65 
 
 
141 aa  57  0.00000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0918  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.66 
 
 
129 aa  57  0.00000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0350639  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0516  ATP synthase F1, epsilon subunit  33.98 
 
 
131 aa  56.2  0.0000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0984  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32.11 
 
 
134 aa  56.2  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.111243  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3824  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  31.03 
 
 
133 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0604  ATP synthase F1, epsilon subunit  38.05 
 
 
133 aa  55.5  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000108005  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0874  ATP synthase F1, epsilon subunit  29.63 
 
 
135 aa  55.8  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0421  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  29.93 
 
 
138 aa  55.1  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1739  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32.93 
 
 
129 aa  55.1  0.0000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.577687  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7379  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  34.31 
 
 
133 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.308596  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2196  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32.11 
 
 
134 aa  55.5  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3149  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32.71 
 
 
132 aa  55.1  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4502  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  41.3 
 
 
132 aa  54.7  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2800  ATP synthase F1, epsilon subunit  30.7 
 
 
133 aa  54.7  0.0000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.694074  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4483  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  41.3 
 
 
132 aa  54.7  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4347  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  41.3 
 
 
132 aa  54.3  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4735  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  40.24 
 
 
86 aa  54.7  0.0000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00461948 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_35127  F-ATPase family transporter: protons (mitochondrial)  31.85 
 
 
170 aa  54.7  0.0000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0023  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  31.58 
 
 
138 aa  53.5  0.0000009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.187642  hitchhiker  0.000120688 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3367  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32.74 
 
 
142 aa  53.1  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0027  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.33 
 
 
138 aa  53.5  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.155859  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2796  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.61 
 
 
140 aa  52.4  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0217  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.33 
 
 
134 aa  52.4  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.812773  normal  0.0791125 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4494  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32.33 
 
 
132 aa  52.4  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.023133 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2832  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  30.28 
 
 
134 aa  52.4  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3316  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  31.85 
 
 
137 aa  52  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0532539  normal  0.0655418 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2743  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  27.61 
 
 
141 aa  52  0.000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.17424 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1087  ATP synthase F1, epsilon subunit  27.48 
 
 
136 aa  51.6  0.000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2136  ATP synthase F1, epsilon subunit  33.33 
 
 
137 aa  50.8  0.000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0047  H+transporting two-sector ATPase delta/epsilon subunit  36 
 
 
88 aa  50.4  0.000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3202  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  40 
 
 
141 aa  50.1  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.447549  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0409  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  30.23 
 
 
135 aa  49.7  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.384593 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3386  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  29.01 
 
 
137 aa  49.7  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2806  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  40 
 
 
141 aa  50.1  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.668633 
 
 
-
 
NC_002936  DET0565  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  31.25 
 
 
140 aa  48.9  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0014162  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03114  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  30.15 
 
 
140 aa  48.9  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2316  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  28.45 
 
 
137 aa  49.3  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.711596  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3492  ATP synthase F1, epsilon subunit  27.61 
 
 
152 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0175018  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1122  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.33 
 
 
97 aa  48.9  0.00002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4089  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  25.95 
 
 
139 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0103  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  34.78 
 
 
129 aa  48.5  0.00003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4190  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  25.19 
 
 
139 aa  48.5  0.00003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0084  ATP synthase F1, epsilon subunit  33.67 
 
 
139 aa  48.5  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.78895  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4145  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  25.95 
 
 
139 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5412  ATP synthase F1, epsilon subunit  27.61 
 
 
152 aa  48.1  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.782662 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4874  ATP synthase F1, epsilon subunit  27.61 
 
 
152 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0143  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  34.78 
 
 
129 aa  48.5  0.00003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000440039  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0539  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  31.37 
 
 
140 aa  48.1  0.00004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000746068  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2138  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  28.83 
 
 
134 aa  48.1  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0782971  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2868  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  27.94 
 
 
140 aa  47.8  0.00004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2176  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  28.83 
 
 
134 aa  48.1  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0466412  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4790  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  30.22 
 
 
132 aa  47.8  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0115  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  34.78 
 
 
129 aa  47.8  0.00005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0001138  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>