84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_0320 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_0320  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  100 
 
 		 277 aa  561  1.0000000000000001e-159  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4393  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  68.68 
 
 		 271 aa  392  1e-108  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.52242  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4380  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  49.82 
 
 		 267 aa  261  6e-69  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0301241  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5008  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  38.46 
 
 		 282 aa  75.9  0.0000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1696  Myo-inosose-2 dehydratase  35.98 
 
 		 308 aa  73.2  0.000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1521  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.99 
 
 		 294 aa  70.9  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1577  myo-inositol catabolism protein  25.17 
 
 		 298 aa  67  0.0000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.357804  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1620  hypothetical protein  26.16 
 
 		 298 aa  66.2  0.0000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1615  hypothetical protein  25.81 
 
 		 298 aa  65.5  0.000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0303  myo-inositol catabolism protein  25.77 
 
 		 298 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2255  myo-inositol catabolism protein  25.38 
 
 		 298 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2531  putative IolE protein  25.38 
 
 		 298 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.32551e-17 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0043  xylose isomerase domain-containing protein  30.31 
 
 		 308 aa  63.9  0.000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2299  myo-inositol catabolism protein  24.51 
 
 		 298 aa  63.5  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4656  xylose isomerase domain-containing protein  25.58 
 
 		 298 aa  62.8  0.000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.335563 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1602  xylose isomerase domain-containing protein  29.17 
 
 		 306 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.334485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1324  putative myo-inositol catabolism LolE protein  28.63 
 
 		 308 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3273  AP endonuclease  28.77 
 
 		 301 aa  62  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0853475  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2414  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  35.03 
 
 		 924 aa  59.7  0.00000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0086  myo-inositol catabolism protein IolE  25.29 
 
 		 297 aa  59.7  0.00000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2811  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.63 
 
 		 305 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.279544  normal  0.182339 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50050  2-keto-myo-inositol dehydratase  27.56 
 
 		 303 aa  57.8  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.602375  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1422  xylose isomerase-like  27.51 
 
 		 297 aa  57.4  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0452084  normal  0.457038 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1133  Myo-inosose-2 dehydratase  30.52 
 
 		 305 aa  57  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.459716  normal  0.18483 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2649  hypothetical protein  29.77 
 
 		 306 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0432409  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3316  xylose isomerase domain-containing protein  34.33 
 
 		 309 aa  56.2  0.0000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2835  xylose isomerase domain-containing protein  32.24 
 
 		 310 aa  55.8  0.0000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.840707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1596  xylose isomerase domain-containing protein  25.45 
 
 		 310 aa  55.1  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0939  xylose isomerase-like TIM barrel  35.07 
 
 		 309 aa  54.7  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00907131  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0273  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.47 
 
 		 278 aa  55.5  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2932  xylose isomerase domain-containing protein  35.82 
 
 		 308 aa  55.1  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.688703 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3138  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.99 
 
 		 359 aa  55.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2981  Myo-inosose-2 dehydratase  25.99 
 
 		 359 aa  55.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.833328 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1421  xylose isomerase domain-containing protein  35.07 
 
 		 309 aa  54.7  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1399  xylose isomerase domain-containing protein  35.07 
 
 		 309 aa  54.3  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0980  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.87 
 
 		 305 aa  54.3  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3499  iolE protein  27.87 
 
 		 301 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1816  xylose isomerase domain-containing protein  28.41 
 
 		 304 aa  54.7  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.670883 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2325  xylose isomerase domain-containing protein  31.48 
 
 		 303 aa  54.7  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4013  Myo-inosose-2 dehydratase  23.13 
 
 		 297 aa  54.3  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0438  hypothetical protein  27.59 
 
 		 306 aa  53.9  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1442  AP endonuclease  27.59 
 
 		 306 aa  53.9  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.609184  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1238  putative myo-inositol catabolism protein  33.58 
 
 		 309 aa  53.5  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2336  hypothetical protein  25.13 
 
 		 237 aa  53.9  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0911  hypothetical protein  27.59 
 
 		 306 aa  53.9  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1829  hypothetical protein  27.2 
 
 		 306 aa  53.9  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0766527  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0724  AP endonuclease  27.59 
 
 		 306 aa  53.9  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.367793  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1675  AP endonuclease  27.2 
 
 		 306 aa  53.9  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.173299  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1653  AP endonuclease  27.59 
 
 		 306 aa  53.9  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.959785  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1894  xylose isomerase domain-containing protein  34.33 
 
 		 309 aa  53.1  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.21993 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1301  xylose isomerase domain-containing protein  33.58 
 
 		 309 aa  53.1  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1340  xylose isomerase domain-containing protein  33.58 
 
 		 309 aa  52.8  0.000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4706  inosose dehydratase  29.3 
 
 		 301 aa  52  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000727756  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2490  xylose isomerase domain-containing protein  37.36 
 
 		 292 aa  50.8  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00709656 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2054  xylose isomerase domain-containing protein  30.43 
 
 		 308 aa  50.8  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0730  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  31.25 
 
 		 295 aa  50.4  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.200556  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0439  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25 
 
 		 308 aa  50.1  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00988774  normal  0.647818 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4565  xylose isomerase-like TIM barrel  33.58 
 
 		 309 aa  50.1  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0833957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4190  xylose isomerase-like TIM barrel  28.21 
 
 		 371 aa  50.1  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.720259  hitchhiker  0.00898811 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0486  putative myo-inositol catabolism protein  26.99 
 
 		 297 aa  48.5  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.425956  normal  0.198393 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0067  xylose isomerase domain-containing protein  31.34 
 
 		 318 aa  48.9  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0290166  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0657  Myo-inosose-2 dehydratase  30.82 
 
 		 303 aa  47.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.700284  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5694  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.39 
 
 		 300 aa  47.8  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.986609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1674  xylose isomerase domain-containing protein  30.54 
 
 		 298 aa  47.8  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0234  AMP-dependent synthetase and ligase  27.75 
 
 		 843 aa  47  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000591284  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3285  sugar phosphate isomerase/epimerase, IolE  29.49 
 
 		 302 aa  47  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4017  xylose isomerase domain-containing protein  29.49 
 
 		 302 aa  47  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7455  hypothetical protein  27.81 
 
 		 292 aa  46.6  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.652021  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3018  hypothetical protein  25.9 
 
 		 307 aa  46.2  0.0007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.130345  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1717  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  32.61 
 
 		 275 aa  45.8  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.393807 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4781  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.63 
 
 		 270 aa  45.4  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.269917  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1342  Myo-inosose-2 dehydratase  23.78 
 
 		 296 aa  45.1  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.606088  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2995  Myo-inosose-2 dehydratase  23.43 
 
 		 296 aa  43.5  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4487  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.14 
 
 		 289 aa  43.5  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.411638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3346  xylose isomerase-like TIM barrel  25.87 
 
 		 297 aa  44.3  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0217845  normal  0.180586 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1886  xylose isomerase domain-containing protein  26.67 
 
 		 308 aa  43.1  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.206917 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1271  xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.77 
 
 		 298 aa  43.1  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.713181 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2681  xylose isomerase domain-containing protein  25.79 
 
 		 352 aa  43.1  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.586843  normal  0.71626 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3333  Myo-inosose-2 dehydratase  23.76 
 
 		 296 aa  43.1  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1346  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  22.69 
 
 		 301 aa  42.7  0.006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3763  xylose isomerase domain-containing protein  28.49 
 
 		 278 aa  42.7  0.007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.189394 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1722  xylose isomerase-like TIM barrel  29.29 
 
 		 299 aa  42.7  0.007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.688264  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1912  xylose isomerase domain-containing protein  25 
 
 		 271 aa  42.4  0.008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.193983  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2968  AP endonuclease  24.83 
 
 		 306 aa  42  0.01  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>