85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_0118 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_0118  hypothetical protein  100 
 
 		 102 aa  208  2e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1169  putative cytochrome c  63.64 
 
 		 174 aa  106  9.000000000000001e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0164  cytochrome c class I  43.28 
 
 		 295 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0151  cytochrome c, class I  43.28 
 
 		 295 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0147  cytochrome c class I  40.26 
 
 		 297 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.206313  normal  0.547254 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2904  cytochrome c, class I  43.28 
 
 		 295 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2786  hypothetical protein  42.31 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2655  hypothetical protein  42.31 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0150  cytochrome c class I  38.96 
 
 		 302 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3330  cytochrome c, class I  43.94 
 
 		 296 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.606623  normal  0.724551 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0264  cytochrome c  38.38 
 
 		 99 aa  54.7  0.0000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0138  cytochrome c, class I  38.96 
 
 		 302 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0263  cytochrome c, class I  40.51 
 
 		 293 aa  52.4  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3990  cytochrome c family protein  37.66 
 
 		 299 aa  51.2  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3918  cytochrome c5  37.66 
 
 		 299 aa  51.2  0.000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00486957  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1534  cytochrome c family protein  37.66 
 
 		 299 aa  51.2  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0120  cytochrome c family protein  37.66 
 
 		 299 aa  51.2  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.830572  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3302  cytochrome c family protein  37.66 
 
 		 299 aa  51.2  0.000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.933009  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3003  cytochrome c family protein  37.66 
 
 		 299 aa  51.2  0.000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3068  cytochrome c family protein  37.66 
 
 		 275 aa  50.8  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3650  cytochrome c class I  32.04 
 
 		 112 aa  50.1  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0061  cytochrome c family protein  39.74 
 
 		 298 aa  50.1  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3261  cytochrome c family protein  37.66 
 
 		 300 aa  50.1  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4286  cytochrome c, class I  40.74 
 
 		 97 aa  50.1  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000419984 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3859  cytochrome c5  34.09 
 
 		 206 aa  49.7  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00000764521  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3876  cytochrome c class I  35.05 
 
 		 300 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0229  cytochrome c class I  33.33 
 
 		 99 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000024603  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3726  cytochrome c, class I  37.04 
 
 		 99 aa  49.3  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.334938  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3084  hypothetical protein  39.51 
 
 		 294 aa  49.3  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286797  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4023  cytochrome c class I  33.33 
 
 		 99 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000136046  hitchhiker  0.0000237935 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0229  cytochrome c class I  33.33 
 
 		 99 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000537114  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4983  cytochrome c, class I  37.8 
 
 		 183 aa  48.9  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4658  cytochrome c, class I  34.34 
 
 		 97 aa  49.3  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000774786 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0232  cytochrome c, class I  34.34 
 
 		 99 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0199425  unclonable  0.0000000000331566 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0227  cytochrome c, class I  34.34 
 
 		 99 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.495989  hitchhiker  0.00493696 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0232  cytochrome c, class I  34.34 
 
 		 99 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00113447  unclonable  0.0000000000238576 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0336  cytochrome c, class I  43.08 
 
 		 288 aa  49.3  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.358353 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3568  cytochrome c, class I  38.27 
 
 		 97 aa  49.3  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.199847  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0180  cytochrome c, class I  39.24 
 
 		 97 aa  48.5  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.245077  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2999  cytochrome c class I  45.61 
 
 		 319 aa  48.1  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0221845 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0246  cytochrome c  34.34 
 
 		 97 aa  47.8  0.00006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00117918  normal  0.0109237 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0216  cytochrome c class I  35.35 
 
 		 97 aa  47.4  0.00006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0309264  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2556  cytochrome c5  38.27 
 
 		 135 aa  47.4  0.00006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000740682  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3020  cytochrome c class I  42.03 
 
 		 298 aa  47.8  0.00006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.731004 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0232  cytochrome c class I  33.33 
 
 		 99 aa  47.4  0.00007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000496502  normal  0.108907 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0315  cytochrome c class I  35.9 
 
 		 179 aa  47  0.00009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.326458  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3473  cytochrome c, class I  39.51 
 
 		 294 aa  47  0.00009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0320  cytochrome c, class I  35.9 
 
 		 180 aa  47  0.00009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.388168 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3367  cytochrome c class I  42.03 
 
 		 297 aa  47  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0033  cytochrome c, class I  39.74 
 
 		 167 aa  46.6  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.198707  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001977  cytochrome c5  39.51 
 
 		 137 aa  47  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000375428  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0029  cytochrome c class I  38.1 
 
 		 163 aa  45.8  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00298904  hitchhiker  0.00000795968 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0093  cytochrome c  35 
 
 		 135 aa  45.4  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0144946  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0996  cytochrome c class I  34.18 
 
 		 103 aa  45.1  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2304  cytochrome c class I  31.48 
 
 		 107 aa  45.4  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000896467  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3322  cytochrome c, class I  43.64 
 
 		 297 aa  45.4  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3877  cytochrome c, class I  35 
 
 		 147 aa  45.1  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0146  cytochrome c5  35.9 
 
 		 266 aa  44.7  0.0004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.821024 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0917  cytochrome c-555  30.49 
 
 		 111 aa  44.3  0.0005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.105307  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2353  cytochrome c class I  29.07 
 
 		 101 aa  44.3  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0385  cytochrome c, class I  36.51 
 
 		 299 aa  44.3  0.0005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4170  cytochrome c class I  38.27 
 
 		 140 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0461  cytochrome c, class I  36.36 
 
 		 137 aa  43.5  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.943206  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4058  cytochrome c class I  38.27 
 
 		 140 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.435905  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1307  cytochrome c class I  35.11 
 
 		 174 aa  43.5  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.466199 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0205  cytochrome c, class I  40.26 
 
 		 185 aa  43.5  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.641753  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0191  cytochrome c, class I  37.66 
 
 		 97 aa  42.7  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000235852  hitchhiker  0.00582407 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4130  cytochrome c class I  38.46 
 
 		 350 aa  42.4  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00484  cb-type cytochrome oxidase subunit III  37.04 
 
 		 131 aa  42.7  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0106  cytochrome c5  33.01 
 
 		 107 aa  42.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0072  cytochrome c, class I  36.76 
 
 		 136 aa  42.4  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.663637  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3542  putative cytochrome  42.62 
 
 		 181 aa  42.7  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.510228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0498  cytochrome c class I  35.44 
 
 		 180 aa  42.4  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2963  hypothetical protein  29.21 
 
 		 537 aa  42  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2812  hypothetical protein  29.21 
 
 		 537 aa  42  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2118  cytochrome c class I  30.34 
 
 		 123 aa  42  0.003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000000343097  normal  0.41454 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00078  cytochrome c5  37.88 
 
 		 135 aa  42  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0149  cytochrome c class I  38.18 
 
 		 287 aa  41.2  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.481052  normal  0.118184 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0208  cytochrome c, class I  33.33 
 
 		 180 aa  41.6  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6074  cytochrome c5  37.31 
 
 		 142 aa  41.2  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0095  cytochrome c family protein  40.43 
 
 		 129 aa  41.2  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69970  cytochrome c5  37.31 
 
 		 136 aa  40.8  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0239  cytochrome c5  29.13 
 
 		 107 aa  40.8  0.007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02091  lipoprotein  40.58 
 
 		 135 aa  40.8  0.007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0050  cytochrome c class I  33.33 
 
 		 232 aa  40.4  0.008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>