112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1169 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_1169  putative cytochrome c  100 
 
 		 174 aa  347  3e-95  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0118  hypothetical protein  63.64 
 
 		 102 aa  107  8.000000000000001e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2000  cytochrome c, class I  29.51 
 
 		 192 aa  61.6  0.000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0804521  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3003  cytochrome c family protein  38.2 
 
 		 299 aa  61.2  0.000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0120  cytochrome c family protein  38.2 
 
 		 299 aa  61.2  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.830572  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3261  cytochrome c family protein  38.2 
 
 		 300 aa  61.2  0.000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3302  cytochrome c family protein  38.2 
 
 		 299 aa  61.2  0.000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.933009  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1534  cytochrome c family protein  38.2 
 
 		 299 aa  61.2  0.000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3990  cytochrome c family protein  38.2 
 
 		 299 aa  61.2  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3918  cytochrome c5  38.2 
 
 		 299 aa  61.2  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00486957  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3068  cytochrome c family protein  38.2 
 
 		 275 aa  60.8  0.000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0150  cytochrome c class I  38.46 
 
 		 302 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0138  cytochrome c, class I  38.46 
 
 		 302 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3330  cytochrome c, class I  39.22 
 
 		 296 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.606623  normal  0.724551 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2904  cytochrome c, class I  38.24 
 
 		 295 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0151  cytochrome c, class I  38.24 
 
 		 295 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0164  cytochrome c class I  38.24 
 
 		 295 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0083  putative cytochrome c  47.76 
 
 		 184 aa  58.2  0.00000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3876  cytochrome c class I  36.28 
 
 		 300 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0061  cytochrome c family protein  35.4 
 
 		 298 aa  58.2  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0147  cytochrome c class I  36.75 
 
 		 297 aa  57  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.206313  normal  0.547254 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0263  cytochrome c, class I  40 
 
 		 293 aa  56.6  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0336  cytochrome c, class I  43.94 
 
 		 288 aa  55.5  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.358353 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0029  cytochrome c class I  34.51 
 
 		 163 aa  53.5  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00298904  hitchhiker  0.00000795968 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3084  hypothetical protein  33.61 
 
 		 294 aa  53.5  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3473  cytochrome c, class I  44.44 
 
 		 294 aa  53.1  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0385  cytochrome c, class I  43.75 
 
 		 299 aa  53.1  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4983  cytochrome c, class I  40.91 
 
 		 183 aa  52.8  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0033  cytochrome c, class I  34.48 
 
 		 167 aa  53.1  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.198707  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2786  hypothetical protein  39.08 
 
 		 142 aa  52.8  0.000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2655  hypothetical protein  39.08 
 
 		 142 aa  52.8  0.000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3020  cytochrome c class I  34.62 
 
 		 298 aa  52.4  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.731004 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0205  cytochrome c, class I  41.79 
 
 		 185 aa  52.8  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.641753  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3367  cytochrome c class I  34.62 
 
 		 297 aa  52.4  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2999  cytochrome c class I  33.33 
 
 		 319 aa  52.4  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0221845 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2556  cytochrome c5  41.18 
 
 		 135 aa  50.8  0.000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000740682  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4170  cytochrome c class I  41.77 
 
 		 140 aa  50.1  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3091  cytochrome c class I  38.67 
 
 		 273 aa  50.8  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.994793  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1307  cytochrome c class I  42.86 
 
 		 174 aa  50.8  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.466199 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4130  cytochrome c class I  43.59 
 
 		 350 aa  50.8  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4058  cytochrome c class I  41.77 
 
 		 140 aa  50.1  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.435905  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0093  cytochrome c  42.03 
 
 		 135 aa  50.4  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0144946  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0315  cytochrome c class I  34 
 
 		 179 aa  50.1  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.326458  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0461  cytochrome c, class I  40 
 
 		 137 aa  50.1  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.943206  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0320  cytochrome c, class I  34 
 
 		 180 aa  50.1  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.388168 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2304  cytochrome c class I  34.41 
 
 		 107 aa  49.7  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000896467  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0146  cytochrome c5  37.18 
 
 		 266 aa  48.5  0.00004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.821024 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0208  cytochrome c, class I  40 
 
 		 180 aa  48.5  0.00005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3650  cytochrome c class I  42.42 
 
 		 112 aa  48.5  0.00005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0149  cytochrome c class I  42.42 
 
 		 287 aa  48.5  0.00005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.481052  normal  0.118184 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0996  cytochrome c class I  34.57 
 
 		 103 aa  48.5  0.00005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0917  cytochrome c-555  37.14 
 
 		 111 aa  48.1  0.00006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.105307  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2117  cytochrome c class I  34.31 
 
 		 141 aa  48.1  0.00006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000139618  normal  0.419433 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3877  cytochrome c, class I  34.58 
 
 		 147 aa  47.8  0.00008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0605  cytochrome c, class I  35.96 
 
 		 216 aa  47.8  0.00008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00227735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6074  cytochrome c5  38.16 
 
 		 142 aa  47.8  0.00008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69970  cytochrome c5  38.16 
 
 		 136 aa  47.8  0.00009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00484  cb-type cytochrome oxidase subunit III  37.5 
 
 		 131 aa  47.8  0.00009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02091  lipoprotein  43.48 
 
 		 135 aa  47  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3859  cytochrome c5  26.92 
 
 		 206 aa  47  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00000764521  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3322  cytochrome c, class I  34.51 
 
 		 297 aa  47  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2353  cytochrome c class I  38.89 
 
 		 101 aa  47  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2464  cytochrome c, class I  37.14 
 
 		 112 aa  47  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.182087  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4286  cytochrome c, class I  40.79 
 
 		 97 aa  46.6  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000419984 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001977  cytochrome c5  39.71 
 
 		 137 aa  46.2  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000375428  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2963  hypothetical protein  27.81 
 
 		 537 aa  45.8  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2812  hypothetical protein  27.81 
 
 		 537 aa  45.8  0.0003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0250  cytochrome c class I  33.94 
 
 		 148 aa  45.8  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000000296226  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00078  cytochrome c5  37.33 
 
 		 135 aa  45.4  0.0004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0654  cytochrome c class I  35.62 
 
 		 148 aa  45.1  0.0005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3726  cytochrome c, class I  37.84 
 
 		 99 aa  45.1  0.0005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.334938  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2463  cytochrome c, class I  35.37 
 
 		 140 aa  44.7  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.480155  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0362  cytochrome c5-like protein  37.5 
 
 		 195 aa  44.7  0.0006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000104978  hitchhiker  0.00044408 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0213  hypothetical protein  31.34 
 
 		 173 aa  44.7  0.0007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000412444  hitchhiker  0.00201322 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4918  putative cytochrome c family protein  42.65 
 
 		 137 aa  44.7  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.840892  hitchhiker  0.00914524 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1062  cytochrome c class I  35.71 
 
 		 159 aa  44.7  0.0007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1141  cytochrome c, class I  35.71 
 
 		 159 aa  44.7  0.0007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.828692  normal  0.616371 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0239  cytochrome c5  37.14 
 
 		 107 aa  43.9  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0233  cytochrome c, class I  31.17 
 
 		 171 aa  43.9  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0215738  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4834  cytochrome c class I  39.47 
 
 		 202 aa  44.3  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.62683  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0095  cytochrome c family protein  34.72 
 
 		 129 aa  43.9  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0213  cytochrome c class I  38.03 
 
 		 111 aa  43.5  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0264  cytochrome c  36.49 
 
 		 99 aa  43.1  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0152  cytochrome c-555  35.71 
 
 		 110 aa  43.5  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000000110389  normal  0.576701 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1443  cytochrome c-555, membrane-bound  32.05 
 
 		 116 aa  43.1  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000000888982  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0498  cytochrome c class I  36.51 
 
 		 180 aa  43.1  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0203  cytochrome c5  40 
 
 		 140 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.768078  hitchhiker  0.00155687 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3542  putative cytochrome  38.1 
 
 		 181 aa  42.4  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.510228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0249  cytochrome c5-like protein  41.43 
 
 		 136 aa  42.7  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4658  cytochrome c, class I  36.84 
 
 		 97 aa  42.7  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000774786 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0106  cytochrome c5  39.13 
 
 		 107 aa  42  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1247  Caa(3)-type oxidase, subunit IV  31.34 
 
 		 230 aa  42  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0103  cytochrome c-555, membrane-bound  34.78 
 
 		 140 aa  42  0.004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0151549  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0459  cytochrome c, class I  32 
 
 		 225 aa  42  0.004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0133127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0072  cytochrome c, class I  40.58 
 
 		 136 aa  42  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.663637  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70340  putative cytochrome c(mono-heme type)  35.38 
 
 		 129 aa  42  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5319  cytochrome c5  40 
 
 		 140 aa  42.4  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.241325 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0760  cytochrome c, class I  30.49 
 
 		 101 aa  41.6  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.957716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4023  cytochrome c class I  36.92 
 
 		 99 aa  41.6  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000136046  hitchhiker  0.0000237935 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0229  cytochrome c class I  36.92 
 
 		 99 aa  41.6  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000024603  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>