More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_1012 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_1012  iojap-like protein  100 
 
 		 140 aa  282  1.0000000000000001e-75  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0719  hypothetical protein  67.41 
 
 		 137 aa  186  1e-46  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00101649  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18190  iojap-related protein  51.59 
 
 		 125 aa  114  6e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.131232  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1821  iojap-like protein  50.85 
 
 		 127 aa  113  7.999999999999999e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.383706  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10180  iojap-related protein  47.83 
 
 		 141 aa  113  8.999999999999998e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.168082  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2170  Iojap-related protein  48.55 
 
 		 134 aa  112  1.0000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.186283  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2452  iojap-like protein  54.92 
 
 		 134 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.344945  normal  0.138235 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3359  iojap-like protein  46.77 
 
 		 132 aa  110  8.000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.573704  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1555  iojap-like protein  50 
 
 		 139 aa  108  3e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.116764  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2006  iojap-like protein  50.94 
 
 		 142 aa  106  8.000000000000001e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0014366  hitchhiker  0.0000000000365534 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1641  iojap-like protein  47.58 
 
 		 141 aa  106  1e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00660201 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2250  iojap-like protein  44.92 
 
 		 130 aa  105  2e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2137  iojap-like protein  46.92 
 
 		 129 aa  105  2e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000149501 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3449  iojap-like protein  53.4 
 
 		 138 aa  104  4e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.467632  normal  0.645308 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7260  hypothetical protein  50 
 
 		 135 aa  103  9e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00000500377  normal  0.434149 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2274  iojap-like protein  47.27 
 
 		 127 aa  100  5e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.0000201224  hitchhiker  0.000438261 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2383  iojap-like protein  47.2 
 
 		 133 aa  100  7e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00906189  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3534  iojap-like protein  41.48 
 
 		 133 aa  99.8  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.667747 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11590  iojap-related protein  51.55 
 
 		 151 aa  99.8  1e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.633601 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3602  iojap-like protein  42.5 
 
 		 122 aa  97.4  5e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.158813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3529  Iojap-related protein  42.5 
 
 		 122 aa  97.4  5e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3193  iojap-like protein  47.46 
 
 		 120 aa  97.4  6e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0764  iojap-like protein  54.95 
 
 		 132 aa  97.4  6e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.589269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3853  iojap-like protein  52.27 
 
 		 133 aa  96.3  1e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.782657  hitchhiker  0.00260799 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1509  iojap-like protein  47.46 
 
 		 137 aa  96.3  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0462296  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12550  iojap-related protein  44.04 
 
 		 135 aa  96.3  1e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.679587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3473  iojap-like protein  51.14 
 
 		 132 aa  94.7  3e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1637  iojap-like protein  48.35 
 
 		 138 aa  95.1  3e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.418914 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11480  iojap-related protein  48.45 
 
 		 148 aa  93.6  8e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.574847  hitchhiker  0.00298358 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2807  iojap-like protein  46.22 
 
 		 135 aa  91.7  3e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.649209  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5246  iojap-like protein  50 
 
 		 144 aa  91.3  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.378223  normal  0.556736 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7257  iojap-like protein  48.35 
 
 		 173 aa  90.5  6e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2654  iojap-like protein  41.35 
 
 		 120 aa  90.1  8e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5475  iojap-like protein  44.44 
 
 		 141 aa  88.2  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.219146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3925  iojap-like protein  44.09 
 
 		 121 aa  87  7e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.436955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3800  iojap-like protein  45.1 
 
 		 122 aa  86.7  9e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.825219  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06010  iojap-related protein  47.78 
 
 		 137 aa  86.7  9e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0403792  hitchhiker  0.0000000000582879 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1607  iojap-like protein  48.18 
 
 		 191 aa  85.9  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.186987  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13060  iojap-related protein  44.44 
 
 		 128 aa  86.3  1e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.691164  normal  0.0908003 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12448  hypothetical protein  39 
 
 		 126 aa  85.9  2e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.873041 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0092  iojap-like protein  40.68 
 
 		 114 aa  84  7e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0192  iojap-like protein  44 
 
 		 118 aa  82.4  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000139024  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2516  iojap-like protein  40.74 
 
 		 118 aa  81.6  0.000000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000207265  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1198  iojap-like protein  48.11 
 
 		 148 aa  81.6  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3646  iojap-like protein  38.46 
 
 		 150 aa  81.3  0.000000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000675973  normal  0.475596 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12030  hypothetical protein  42.57 
 
 		 118 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00879098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0686  iojap-like protein  34.78 
 
 		 158 aa  79  0.00000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000289548  normal  0.0203597 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1104  hypothetical protein  42.57 
 
 		 118 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.793496  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3343  Poly(A) polymerase, PcnB  35.35 
 
 		 114 aa  78.6  0.00000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000574363  normal  0.0167921 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1233  Iojap-related protein  51.11 
 
 		 196 aa  77.4  0.00000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.342641 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1543  Iojap-related protein  40 
 
 		 123 aa  77.4  0.00000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0158973  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1736  Iojap family protein  34.26 
 
 		 124 aa  77.4  0.00000000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0213  Iojap-related protein  39.42 
 
 		 107 aa  77  0.00000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.277011  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0910  Iojap family protein  43.27 
 
 		 120 aa  77  0.00000000000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000376688  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0228  iojap-like protein  37.74 
 
 		 191 aa  76.6  0.00000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.689651  normal  0.307872 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2577  Iojap-related protein  34.71 
 
 		 119 aa  76.3  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.5603199999999995e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2013  iojap-like protein  41.82 
 
 		 117 aa  76.3  0.0000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1137  iojap-like protein  42.22 
 
 		 108 aa  75.9  0.0000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.000812131  normal  0.662489 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2674  iojap-like protein  39.47 
 
 		 124 aa  73.6  0.0000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0269937  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1253  iojap-like protein  37.11 
 
 		 110 aa  73.2  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00407148  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1332  hypothetical protein  37.89 
 
 		 112 aa  72.8  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4367  Iojap-related protein  39.05 
 
 		 128 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.480968  normal  0.909341 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4972  hypothetical protein  37 
 
 		 164 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.05158  normal  0.61306 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08370  iojap-related protein  40.59 
 
 		 117 aa  73.2  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0216142  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0022  Iojap-related protein  35.85 
 
 		 163 aa  72.8  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.853245 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4129  iojap-like protein  30.63 
 
 		 128 aa  72  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000489424  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0237  iojap-like protein  35.71 
 
 		 198 aa  72.4  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01659  iojap domain protein  38.71 
 
 		 105 aa  72  0.000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000504193  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0163  Iojap-related protein  40.21 
 
 		 141 aa  72.4  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1562  iojap-like protein  39.56 
 
 		 105 aa  72.4  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.985002  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0405  iojap-like protein  41.76 
 
 		 123 aa  72.4  0.000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.64212  normal  0.310869 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0226  iojap-like protein  35.71 
 
 		 198 aa  72.4  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.499146  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1328  hypothetical protein  37.89 
 
 		 112 aa  71.6  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1366  iojap-like protein  44.59 
 
 		 114 aa  71.6  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0102  iojap-like protein  38.3 
 
 		 131 aa  71.6  0.000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000101684  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3613  iojap-like protein  36.67 
 
 		 135 aa  71.6  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000000208423  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3821  iojap-like protein  34.62 
 
 		 115 aa  71.2  0.000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4552  iojap-like protein  38.18 
 
 		 138 aa  71.2  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.67264  normal  0.570489 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2660  Iojap-related protein  35.51 
 
 		 115 aa  70.9  0.000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00250929  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3201  Iojap-related protein  35.24 
 
 		 131 aa  71.2  0.000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.12867e-19  unclonable  7.41028e-24 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4684  iojap-like protein  33.86 
 
 		 158 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4809  iojap-like protein  33.86 
 
 		 139 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.243454 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4827  iojap-related protein  37.14 
 
 		 123 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.943671  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0567  Iojap-related protein  36.36 
 
 		 115 aa  70.9  0.000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4862  iojap-like protein  33.86 
 
 		 139 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.376874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3483  iojap-like protein  37.76 
 
 		 109 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000176434  unclonable  0.0000000000377675 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3263  Iojap-related protein  31.25 
 
 		 151 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.874451 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3776  iojap-like protein  30.97 
 
 		 128 aa  70.9  0.000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000000307395  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1159  iojap-related protein  33.65 
 
 		 117 aa  70.5  0.000000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1297  iojap-like protein  31.25 
 
 		 154 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.605705  normal  0.0750793 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2933  iojap-like protein  36.73 
 
 		 115 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000045875  decreased coverage  0.00669714 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3860  iojap-like protein  30.97 
 
 		 128 aa  70.1  0.000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.152757 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3013  iojap-like protein  33.02 
 
 		 166 aa  69.7  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0357309  normal  0.915296 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1241  iojap-like protein  31.73 
 
 		 130 aa  69.3  0.00000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2544  iojap-like protein  31.58 
 
 		 120 aa  69.7  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00643892  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0087  Iojap-related protein  38.74 
 
 		 129 aa  69.7  0.00000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.755827  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2908  iojap-like protein  38.95 
 
 		 137 aa  69.7  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0432  iojap-like protein  33.06 
 
 		 166 aa  70.1  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.121875 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0095  iojap-like protein  36.45 
 
 		 131 aa  69.7  0.00000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.000000027247  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2664  iojap-like protein  34.91 
 
 		 131 aa  69.7  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000901507  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>