More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1233 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1233  Iojap-related protein  100 
 
 		 196 aa  385  1e-106  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.342641 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5246  iojap-like protein  82.2 
 
 		 144 aa  182  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.378223  normal  0.556736 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1821  iojap-like protein  66.38 
 
 		 127 aa  164  5e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.383706  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1555  iojap-like protein  59.44 
 
 		 139 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.116764  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3449  iojap-like protein  72.17 
 
 		 138 aa  158  4e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.467632  normal  0.645308 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3529  Iojap-related protein  60.87 
 
 		 122 aa  158  4e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3534  iojap-like protein  60.87 
 
 		 133 aa  158  4e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.667747 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3602  iojap-like protein  60.87 
 
 		 122 aa  158  4e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.158813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3193  iojap-like protein  64.66 
 
 		 120 aa  157  1e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2170  Iojap-related protein  64.18 
 
 		 134 aa  155  3e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.186283  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2250  iojap-like protein  62.07 
 
 		 130 aa  154  9e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3359  iojap-like protein  60.98 
 
 		 132 aa  153  2e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.573704  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1509  iojap-like protein  61.76 
 
 		 137 aa  152  2.9999999999999998e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0462296  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7257  iojap-like protein  65.55 
 
 		 173 aa  149  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2452  iojap-like protein  64.1 
 
 		 134 aa  144  6e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.344945  normal  0.138235 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3853  iojap-like protein  70 
 
 		 133 aa  144  8.000000000000001e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.782657  hitchhiker  0.00260799 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2274  iojap-like protein  66.67 
 
 		 127 aa  144  9e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.0000201224  hitchhiker  0.000438261 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3473  iojap-like protein  70 
 
 		 132 aa  143  2e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1198  iojap-like protein  60.56 
 
 		 148 aa  142  4e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2654  iojap-like protein  64.84 
 
 		 120 aa  139  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1607  iojap-like protein  64.9 
 
 		 191 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.186987  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12550  iojap-related protein  71.11 
 
 		 135 aa  137  7.999999999999999e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.679587  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7260  hypothetical protein  64.17 
 
 		 135 aa  137  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00000500377  normal  0.434149 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0764  iojap-like protein  64.39 
 
 		 132 aa  137  1e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.589269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12448  hypothetical protein  58.26 
 
 		 126 aa  136  2e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.873041 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11480  iojap-related protein  56.93 
 
 		 148 aa  135  3.0000000000000003e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.574847  hitchhiker  0.00298358 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2807  iojap-like protein  62.28 
 
 		 135 aa  135  4e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.649209  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3925  iojap-like protein  63.74 
 
 		 121 aa  134  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.436955  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1641  iojap-like protein  55.26 
 
 		 141 aa  132  3e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00660201 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5475  iojap-like protein  60 
 
 		 141 aa  131  6e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.219146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2383  iojap-like protein  56.3 
 
 		 133 aa  130  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00906189  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2137  iojap-like protein  59.48 
 
 		 129 aa  127  9.000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000149501 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11590  iojap-related protein  56.14 
 
 		 151 aa  122  3e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.633601 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18190  iojap-related protein  55.46 
 
 		 125 aa  121  8e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.131232  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1637  iojap-like protein  58.89 
 
 		 138 aa  117  9.999999999999999e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.418914 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1866  iojap-like protein  50.88 
 
 		 118 aa  106  2e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000042805  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0192  iojap-like protein  51.79 
 
 		 118 aa  106  3e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000139024  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2006  iojap-like protein  45.76 
 
 		 142 aa  105  4e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0014366  hitchhiker  0.0000000000365534 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10180  iojap-related protein  53.68 
 
 		 141 aa  105  5e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.168082  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0719  hypothetical protein  47.46 
 
 		 137 aa  101  5e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00101649  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2516  iojap-like protein  40.52 
 
 		 118 aa  95.1  6e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000207265  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1012  iojap-like protein  51.11 
 
 		 140 aa  94.7  7e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13060  iojap-related protein  45.16 
 
 		 128 aa  93.2  2e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.691164  normal  0.0908003 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3118  iojap-like protein  43.09 
 
 		 144 aa  91.3  9e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06010  iojap-related protein  45.97 
 
 		 137 aa  90.5  1e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0403792  hitchhiker  0.0000000000582879 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3002  iojap-like protein  42.28 
 
 		 144 aa  89.4  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.404197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0097  Iojap-related protein  39.2 
 
 		 131 aa  89.7  3e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0187008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0022  Iojap-related protein  39.64 
 
 		 163 aa  88.6  5e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.853245 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2577  Iojap-related protein  41.07 
 
 		 119 aa  87  2e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.5603199999999995e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0686  iojap-like protein  43.12 
 
 		 158 aa  86.3  3e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000289548  normal  0.0203597 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3646  iojap-like protein  44.33 
 
 		 150 aa  85.9  3e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000675973  normal  0.475596 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2013  iojap-like protein  42.48 
 
 		 117 aa  85.9  4e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0228  iojap-like protein  41.18 
 
 		 191 aa  85.9  4e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.689651  normal  0.307872 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4329  iojap-like protein  40.2 
 
 		 112 aa  85.5  4e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.9777e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0213  Iojap-related protein  42.57 
 
 		 107 aa  84.7  7e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.277011  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1581  hypothetical protein  38.32 
 
 		 117 aa  84  0.000000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000000588564  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1253  iojap-like protein  43.48 
 
 		 110 aa  83.2  0.000000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00407148  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0735  Iojap-related protein  38.53 
 
 		 152 aa  83.6  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0130458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0124  iojap-like protein  42.72 
 
 		 143 aa  83.6  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000225979  hitchhiker  0.00822144 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1313  iojap-like protein  37.93 
 
 		 148 aa  83.6  0.000000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1159  iojap-related protein  37.04 
 
 		 117 aa  82.8  0.000000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3800  iojap-like protein  40.59 
 
 		 122 aa  82.8  0.000000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.825219  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1380  hypothetical protein  37.93 
 
 		 148 aa  82.8  0.000000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0593  Iojap-related protein  41 
 
 		 119 aa  82.8  0.000000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.328156 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1923  iojap-like protein  38.05 
 
 		 116 aa  82.8  0.000000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000477061  unclonable  0.00000000896903 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3631  iojap-like protein  39.81 
 
 		 138 aa  82.4  0.000000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000000986152  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0372  iojap-like protein  36.79 
 
 		 114 aa  82.4  0.000000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000445596  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4972  hypothetical protein  39 
 
 		 164 aa  82.4  0.000000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.05158  normal  0.61306 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0095  iojap-like protein  39.25 
 
 		 131 aa  82  0.000000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.000000027247  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1659  iojap-related protein  39.39 
 
 		 118 aa  81.6  0.000000000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.0000807789  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2544  iojap-like protein  39.22 
 
 		 120 aa  81.6  0.000000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00643892  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3201  Iojap-related protein  41.07 
 
 		 131 aa  81.6  0.000000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.12867e-19  unclonable  7.41028e-24 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0237  iojap-like protein  41.05 
 
 		 198 aa  81.6  0.000000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0226  iojap-like protein  41.05 
 
 		 198 aa  81.6  0.000000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.499146  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13380  iojap-like protein  42.86 
 
 		 121 aa  81.3  0.000000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.129259  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0393  iojap-like protein  35.85 
 
 		 114 aa  81.3  0.000000000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00274134  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0136  iojap-like protein  38.4 
 
 		 147 aa  80.9  0.00000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.872852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0567  Iojap-related protein  46.94 
 
 		 115 aa  80.9  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1649  hypothetical protein  37.96 
 
 		 117 aa  80.1  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1684  hypothetical protein  37.96 
 
 		 117 aa  80.1  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0432873  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1601  iojap-related protein  41.18 
 
 		 118 aa  80.1  0.00000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000000667428  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_335  hypothetical protein  34.91 
 
 		 116 aa  79.3  0.00000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000000000000506445  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2110  iojap-like protein  41.05 
 
 		 117 aa  79.3  0.00000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.106455  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2908  iojap-like protein  40.38 
 
 		 137 aa  79  0.00000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004220  hypothetical protein  36 
 
 		 105 aa  79  0.00000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00071389  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12030  hypothetical protein  40.59 
 
 		 118 aa  79  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00879098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3613  iojap-like protein  39.29 
 
 		 135 aa  79  0.00000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000000208423  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0789  Iojap-related protein  43.81 
 
 		 172 aa  78.6  0.00000000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.283554  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2674  iojap-like protein  40.95 
 
 		 124 aa  78.6  0.00000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0269937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4129  iojap-like protein  37.74 
 
 		 128 aa  78.6  0.00000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000489424  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1104  hypothetical protein  40.59 
 
 		 118 aa  78.6  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.793496  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0087  Iojap-related protein  41.32 
 
 		 129 aa  78.2  0.00000000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.755827  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0910  Iojap family protein  40.91 
 
 		 120 aa  78.2  0.00000000000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000376688  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5041  iojap-like protein  33.91 
 
 		 127 aa  78.2  0.00000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0092  iojap-like protein  44.19 
 
 		 114 aa  77.8  0.00000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3209  iojap-related protein  37.61 
 
 		 131 aa  77.8  0.00000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.013969  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1783  iojap-like protein  38.26 
 
 		 144 aa  77  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3307  iojap-like protein  41.51 
 
 		 115 aa  77.4  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000123789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1736  Iojap family protein  35.92 
 
 		 124 aa  77.8  0.0000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4827  iojap-related protein  35.51 
 
 		 123 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.943671  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>