83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3641 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3641  DNA mismatch endonuclease vsr  100 
 
 		 143 aa  279  8.000000000000001e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0348  DNA mismatch endonuclease Vsr  46.76 
 
 		 161 aa  103  6e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1087  DNA mismatch endonuclease vsr  41.22 
 
 		 164 aa  84.7  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.603393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0758  DNA mismatch endonuclease Vsr  44.26 
 
 		 136 aa  81.6  0.000000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00181018  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4414  DNA mismatch endonuclease vsr  45.3 
 
 		 152 aa  75.9  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0927336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1051  DNA mismatch endonuclease Vsr  41.04 
 
 		 141 aa  74.7  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.080129  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8537  DNA mismatch endonuclease Vsr  42.61 
 
 		 131 aa  74.3  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00124177  hitchhiker  0.000481782 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1616  DNA mismatch endonuclease Vsr  41.13 
 
 		 165 aa  74.3  0.0000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000954953 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4450  putative very short patch repair protein  36.43 
 
 		 138 aa  71.6  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.0000172417  hitchhiker  0.000789657 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4864  DNA mismatch endonuclease Vsr  39.16 
 
 		 167 aa  71.2  0.000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0234649  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1415  DNA mismatch endonuclease Vsr  40.87 
 
 		 124 aa  70.9  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0184056  normal  0.0884677 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0818  DNA mismatch endonuclease vsr  39.67 
 
 		 133 aa  70.5  0.000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.824711  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0834  DNA mismatch endonuclease vsr  39.67 
 
 		 133 aa  70.5  0.000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0533  DNA mismatch endonuclease Vsr  43.64 
 
 		 155 aa  68.2  0.00000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0160507  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2284  DNA mismatch endonuclease Vsr  36.05 
 
 		 147 aa  67  0.00000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0823  DNA mismatch endonuclease vsr  40 
 
 		 131 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2197  putative very short patch repair protein  33.33 
 
 		 152 aa  62.8  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0715413  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2283  T/G mismatch-specific endonuclease  36.84 
 
 		 153 aa  63.2  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0930  DNA mismatch endonuclease Vsr  29.85 
 
 		 140 aa  60.8  0.000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.202867  hitchhiker  0.0000000000699744 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3762  T/G mismatch-specific endonuclease  36.07 
 
 		 142 aa  59.7  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00377311  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3323  DNA mismatch endonuclease vsr  36.29 
 
 		 140 aa  59.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.116572 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2315  T/G mismatch-specific endonuclease  31.36 
 
 		 144 aa  59.3  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1176  putative very short patch repair protein  30.94 
 
 		 152 aa  56.2  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.411245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4758  DNA mismatch endonuclease Vsr  39.81 
 
 		 157 aa  54.7  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.145292 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2561  DNA mismatch endonuclease Vsr  29.31 
 
 		 140 aa  53.5  0.0000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0683  DNA mismatch endonuclease Vsr  30.95 
 
 		 167 aa  52.8  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000492028 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2144  DNA mismatch endonuclease Vsr  31.65 
 
 		 190 aa  52.4  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.384099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1846  DNA mismatch endonuclease Vsr  32.81 
 
 		 131 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.682693  normal  0.535542 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2857  T/G mismatch-specific endonuclease  32.33 
 
 		 156 aa  51.6  0.000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.744208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1156  T/G mismatch-specific endonuclease  32.14 
 
 		 147 aa  51.2  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.505674  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0413  DNA mismatch endonuclease vsr  38.54 
 
 		 167 aa  50.8  0.000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.23201  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4747  DNA mismatch endonuclease Vsr  32.14 
 
 		 158 aa  50.4  0.000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.727283  normal  0.973977 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1452  DNA mismatch endonuclease Vsr  32.03 
 
 		 144 aa  50.4  0.000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.68518  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3385  DNA mismatch endonuclease vsr  31.67 
 
 		 144 aa  49.7  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.48656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1715  DNA mismatch endonuclease vsr  35 
 
 		 137 aa  49.7  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.301273  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2550  T/G mismatch-specific endonuclease  35.83 
 
 		 163 aa  49.7  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.242916  normal  0.437604 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1747  T/G mismatch-specific endonuclease  27.13 
 
 		 138 aa  48.5  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000813449  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1128  T/G mismatch-specific endonuclease  34.51 
 
 		 135 aa  48.5  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00000897003  unclonable  0.00000721328 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3854  DNA mismatch endonuclease vsr  30.6 
 
 		 165 aa  48.9  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.151081  normal  0.0341159 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1536  DNA mismatch endonuclease Vsr  31.09 
 
 		 150 aa  48.5  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000110853 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1618  DNA mismatch endonuclease, vsr  41.94 
 
 		 141 aa  48.1  0.00004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.465937  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3443  T/G mismatch-specific endonuclease  35.54 
 
 		 148 aa  47.8  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1080  hypothetical protein  26.09 
 
 		 151 aa  47.8  0.00005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0566  DNA mismatch endonuclease vsr  36.19 
 
 		 177 aa  47.8  0.00006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.892788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3075  DNA mismatch endonuclease vsr  34.19 
 
 		 152 aa  47.4  0.00006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3921  DNA mismatch endonuclease Vsr  32.31 
 
 		 146 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2798  DNA mismatch endonuclease vsr  31.82 
 
 		 129 aa  46.6  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0146615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0471  putative patch repair protein  33.59 
 
 		 139 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.797287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2656  DNA mismatch endonuclease Vsr  35.71 
 
 		 153 aa  46.6  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.902598  normal  0.103187 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4985  DNA mismatch endonuclease Vsr  31.54 
 
 		 146 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7068  DNA mismatch endonuclease Vsr  35.58 
 
 		 137 aa  46.2  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.000952537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2517  patch repair protein  31.86 
 
 		 149 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0753026  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7047  DNA mismatch endonuclease Vsr  31.5 
 
 		 146 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2517  DNA mismatch endonuclease vsr  28.46 
 
 		 147 aa  43.9  0.0007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.654649  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3575  DNA mismatch endonuclease Vsr  32.39 
 
 		 141 aa  43.5  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  hitchhiker  0.0000168268  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3439  patch repair protein  40.82 
 
 		 154 aa  43.5  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0208  DNA mismatch endonuclease Vsr  30.77 
 
 		 131 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.221365  decreased coverage  0.000000121793 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2372  DNA mismatch endonuclease Vsr  32.69 
 
 		 137 aa  43.1  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000182127 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0546  DNA mismatch endonuclease Vsr  42 
 
 		 141 aa  43.5  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1180  T/G mismatch-specific endonuclease  46.34 
 
 		 151 aa  43.5  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.209463  normal  0.125774 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4111  DNA mismatch endonuclease vsr  32.2 
 
 		 136 aa  43.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2141  DNA mismatch endonuclease Vsr  36 
 
 		 148 aa  43.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.396801  hitchhiker  0.000491126 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1524  DNA mismatch endonuclease Vsr  32 
 
 		 141 aa  42.7  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000359719  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0872  T/G mismatch-specific endonuclease  31.53 
 
 		 139 aa  42.4  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_255  Vsr domain protein T:G mismatch repair endonuclease  28.57 
 
 		 138 aa  42.4  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0112407  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08500  T/G mismatch-specific endonuclease  29.92 
 
 		 146 aa  42.4  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.119138 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0528  DNA mismatch endonuclease Vsr  27.88 
 
 		 138 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.027881  normal  0.827941 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0010  DNA mismatch endonuclease Vsr  33.64 
 
 		 155 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.191415  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1412  DNA mismatch endonuclease Vsr  30.39 
 
 		 153 aa  42  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.961068  normal  0.106603 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2741  DNA G:T-mismatch repair endonuclease  31.19 
 
 		 124 aa  41.6  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2062  DNA mismatch endonuclease vsr  35.64 
 
 		 154 aa  41.2  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00023533 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0451  DNA mismatch endonuclease Vsr  43.18 
 
 		 138 aa  41.2  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000180735  decreased coverage  0.00102916 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1917  Very short patch repair (Vsr) endonuclease  30.33 
 
 		 144 aa  40.8  0.006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.715559  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04271  hypothetical protein  24.17 
 
 		 137 aa  40.8  0.006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.300408  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4265  T/G mismatch-specific endonuclease  33 
 
 		 144 aa  40.8  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0146  hypothetical protein  30.84 
 
 		 141 aa  40.8  0.006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0761  DNA mismatch endonuclease Vsr  29.1 
 
 		 137 aa  40.8  0.007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2191  very short patch repair protein  33.04 
 
 		 156 aa  40.8  0.007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000114608  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2062  very short patch repair protein  33.63 
 
 		 156 aa  40.8  0.007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00234153  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0353  DNA mismatch endonuclease Vsr  46.34 
 
 		 138 aa  40.8  0.007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1534  T/G mismatch-specific endonuclease  27.13 
 
 		 150 aa  40.4  0.007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.899719  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0890  DNA mismatch endonuclease Vsr  26.72 
 
 		 154 aa  40.4  0.008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0259609  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0082  T/G mismatch-specific endonuclease  31.9 
 
 		 176 aa  40.4  0.009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.199273  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>