111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_3532 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_3532  DSBA oxidoreductase  100 
 
 
179 aa  366  1e-100  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3008  DSBA oxidoreductase  31.02 
 
 
248 aa  72.4  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.533985  normal  0.21554 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2002  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase family protein  30.51 
 
 
216 aa  69.7  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.126536  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1780  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase family protein  28.33 
 
 
216 aa  69.7  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00151932  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1267  frnE protein  33.55 
 
 
223 aa  69.7  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.454512  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1918  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase family protein  28.33 
 
 
216 aa  69.7  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.017598  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1954  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase family protein  28.33 
 
 
216 aa  69.7  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000322125 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1759  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase family protein  28.33 
 
 
216 aa  69.3  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1737  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase family protein  28.33 
 
 
216 aa  68.9  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.563102  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1564  DsbA oxidoreductase  29.61 
 
 
212 aa  69.3  0.00000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0406976  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3451  DSBA oxidoreductase  29.38 
 
 
201 aa  68.9  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3421  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase family protein  28.33 
 
 
216 aa  68.9  0.00000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000359947 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1792  DSBA oxidoreductase  35.78 
 
 
216 aa  67  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000899943  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2023  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase family protein  27.78 
 
 
216 aa  67  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000252157  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0970  DSBA oxidoreductase  27.33 
 
 
216 aa  65.9  0.0000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00227612 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1922  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase family protein  27.78 
 
 
216 aa  65.9  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.457007  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03790  predicted dithiol-disulfide isomerase involved in polyketide biosynthesis  32.21 
 
 
230 aa  65.9  0.0000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.288103  normal  0.160551 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3550  DSBA oxidoreductase  31.76 
 
 
220 aa  65.1  0.0000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.916573  normal  0.901837 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1083  DSBA oxidoreductase  29.48 
 
 
216 aa  64.7  0.0000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.979731  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0622  DSBA oxidoreductase  26.74 
 
 
217 aa  64.3  0.0000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1148  DSBA oxidoreductase  27.84 
 
 
237 aa  62.8  0.000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1375  DSBA oxidoreductase  29.82 
 
 
215 aa  62.4  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000103023  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1398  DSBA oxidoreductase  27.5 
 
 
237 aa  62  0.000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.394424  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2073  DSBA oxidoreductase  30.97 
 
 
256 aa  61.6  0.000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.232317  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4753  DSBA oxidoreductase  31.25 
 
 
219 aa  61.2  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.803331  normal  0.448098 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2316  DSBA oxidoreductase  29.94 
 
 
221 aa  60.8  0.000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.132325  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1937  DSBA oxidoreductase  25.14 
 
 
222 aa  60.5  0.00000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2061  DSBA oxidoreductase  30.29 
 
 
215 aa  60.5  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.16033  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2832  DSBA oxidoreductase  25.45 
 
 
213 aa  59.7  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.84064  normal  0.0678708 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01056  probable DSBA oxidoreductase  28.75 
 
 
211 aa  59.7  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8164  hypothetical protein  30.99 
 
 
213 aa  59.7  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.170702 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1605  DSBA oxidoreductase  27.22 
 
 
215 aa  59.3  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6424  DSBA oxidoreductase  27.37 
 
 
217 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.450496 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7204  DSBA oxidoreductase  28.09 
 
 
221 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3756  DSBA oxidoreductase  30 
 
 
221 aa  57.8  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.734213  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4106  DSBA oxidoreductase  29.7 
 
 
229 aa  57.4  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0416  putative dithiol-disulfide isomerase  28.05 
 
 
221 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0326  DSBA oxidoreductase  28.95 
 
 
237 aa  56.2  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2656  polyketide biosynthesis dithiol-disulfide isomerase-like protein  21.15 
 
 
172 aa  55.8  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1557  putative DSBA oxidoreductase  27.59 
 
 
222 aa  55.8  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.455666  normal  0.262117 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2296  DSBA oxidoreductase  27.51 
 
 
221 aa  55.5  0.0000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00720993  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0024  DSBA oxidoreductase  30.97 
 
 
211 aa  55.5  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3389  DSBA oxidoreductase  31.13 
 
 
235 aa  55.1  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.354876  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2694  DSBA oxidoreductase  25 
 
 
235 aa  55.1  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.268772 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2720  thiol:disulfide interchange protein DsbA  25.48 
 
 
219 aa  54.7  0.0000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.162153 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3914  DSBA oxidoreductase  27.78 
 
 
215 aa  54.7  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.216529 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5788  DSBA oxidoreductase  25.7 
 
 
215 aa  53.9  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0487063 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2368  DSBA oxidoreductase  29.63 
 
 
203 aa  53.9  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.919583  normal  0.0250813 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5431  DSBA oxidoreductase  30.32 
 
 
213 aa  53.9  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.144454 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2795  DSBA oxidoreductase  28.47 
 
 
207 aa  53.9  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0633  DSBA oxidoreductase  27.03 
 
 
220 aa  54.3  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.218426  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22650  predicted dithiol-disulfide isomerase involved in polyketide biosynthesis  28 
 
 
228 aa  54.3  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.483834 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22550  predicted dithiol-disulfide isomerase involved in polyketide biosynthesis  29.07 
 
 
227 aa  53.5  0.000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0301  DSBA oxidoreductase  26.49 
 
 
214 aa  52.4  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.220851  normal  0.256868 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0515  DSBA oxidoreductase  25.41 
 
 
221 aa  52.4  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.727593  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4882  DSBA oxidoreductase  30.41 
 
 
229 aa  52.4  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1261  DSBA oxidoreductase  27.16 
 
 
235 aa  52.8  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.432726  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0796  DSBA oxidoreductase  34.65 
 
 
221 aa  52  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.861655 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0941  DSBA oxidoreductase  35.23 
 
 
240 aa  52  0.000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.203124  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18220  predicted dithiol-disulfide isomerase involved in polyketide biosynthesis  28.74 
 
 
218 aa  51.6  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0485  DSBA oxidoreductase  28.93 
 
 
216 aa  52  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4177  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase family protein  26.67 
 
 
215 aa  51.6  0.000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.743231  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1583  DSBA oxidoreductase  28.82 
 
 
210 aa  51.2  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1717  DSBA oxidoreductase  28.67 
 
 
221 aa  51.2  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1100  hypothetical protein  27.81 
 
 
217 aa  51.2  0.000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0979  DSBA oxidoreductase  24.71 
 
 
215 aa  51.2  0.000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00033798  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1200  DSBA oxidoreductase  32.46 
 
 
237 aa  50.4  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.153386  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0654  DSBA oxidoreductase  26.49 
 
 
220 aa  50.8  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2508  DSBA oxidoreductase  29.33 
 
 
225 aa  50.4  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00396553  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3318  DSBA oxidoreductase  27.59 
 
 
227 aa  49.7  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2594  DSBA oxidoreductase  27.43 
 
 
212 aa  49.7  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1263  hypothetical protein  30.77 
 
 
166 aa  49.3  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.552972  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4389  DSBA oxidoreductase  29.49 
 
 
221 aa  49.3  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0887682  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4948  DSBA oxidoreductase  31.68 
 
 
221 aa  48.5  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.576797 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3785  DSBA oxidoreductase  29.49 
 
 
210 aa  48.1  0.00007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.400426  normal  0.0244722 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0020  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 
211 aa  47.4  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3598  DSBA oxidoreductase  30.73 
 
 
220 aa  47.4  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.432657 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1446  DSBA oxidoreductase  26.95 
 
 
203 aa  47  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.151785 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3441  DSBA oxidoreductase  29.49 
 
 
215 aa  47  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.486771  normal  0.667437 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12093  hypothetical protein  24.86 
 
 
214 aa  47.4  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1034  DSBA oxidoreductase  31.25 
 
 
215 aa  46.6  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1922  DSBA oxidoreductase  29.24 
 
 
218 aa  47  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.65395  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0210  DSBA oxidoreductase  25.73 
 
 
213 aa  46.6  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2493  dithiol-disulfide isomerase  21.71 
 
 
242 aa  46.2  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.138653 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0641  DSBA oxidoreductase  26.35 
 
 
220 aa  46.2  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.109842 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2249  DSBA oxidoreductase  28.05 
 
 
208 aa  47  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.386975  normal  0.508108 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5000  DSBA oxidoreductase  24.57 
 
 
233 aa  45.8  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.324442  normal  0.0420894 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0115  DSBA oxidoreductase  25.14 
 
 
232 aa  45.4  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.133072  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1347  DSBA oxidoreductase  24.85 
 
 
233 aa  45.8  0.0004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1948  DSBA oxidoreductase  26.83 
 
 
216 aa  45.4  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2391  putative DSBA oxidoreductase  30.46 
 
 
217 aa  45.1  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1502  DSBA oxidoreductase  27.5 
 
 
214 aa  45.1  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0283596 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0550  polyketide biosynthesis associated protein  27.03 
 
 
233 aa  45.1  0.0006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.682486  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0177  DSBA oxidoreductase  30.59 
 
 
236 aa  45.1  0.0006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0746  DSBA oxidoreductase  26.29 
 
 
215 aa  44.7  0.0008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5416  FrnE protein  44.07 
 
 
92 aa  44.3  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5500  DSBA oxidoreductase  30.39 
 
 
217 aa  44.3  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.790496  normal  0.0537626 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0273  putative 2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase protein  28.89 
 
 
201 aa  43.1  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.723035  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0728  DSBA oxidoreductase  25.82 
 
 
230 aa  42.7  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.782064 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1441  DSBA oxidoreductase  26.25 
 
 
214 aa  43.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0402577 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>