110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5416 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5416  FrnE protein  100 
 
 		 92 aa  179  1e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5431  DSBA oxidoreductase  90.22 
 
 		 213 aa  138  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.144454 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1267  frnE protein  50 
 
 		 223 aa  89.4  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.454512  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3550  DSBA oxidoreductase  48.81 
 
 		 220 aa  85.1  3e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.916573  normal  0.901837 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4436  DSBA oxidoreductase  52.33 
 
 		 239 aa  84.7  4e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.106658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1261  DSBA oxidoreductase  50 
 
 		 235 aa  84  7e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.432726  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2174  DSBA oxidoreductase  48.84 
 
 		 209 aa  82  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0132146  hitchhiker  0.0000045366 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2594  DSBA oxidoreductase  46.59 
 
 		 212 aa  80.5  0.000000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0177  DSBA oxidoreductase  40.62 
 
 		 236 aa  77.8  0.00000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2718  DSBA oxidoreductase  41.38 
 
 		 209 aa  77  0.00000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0752849  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1488  DSBA oxidoreductase  39.77 
 
 		 234 aa  72.4  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0767657  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2073  DSBA oxidoreductase  44.58 
 
 		 256 aa  72.4  0.000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.232317  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5000  DSBA oxidoreductase  39.53 
 
 		 233 aa  72  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.324442  normal  0.0420894 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22650  predicted dithiol-disulfide isomerase involved in polyketide biosynthesis  43.53 
 
 		 228 aa  71.6  0.000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.483834 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0704  DSBA oxidoreductase  42.68 
 
 		 235 aa  70.5  0.000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03790  predicted dithiol-disulfide isomerase involved in polyketide biosynthesis  44.32 
 
 		 230 aa  70.1  0.000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.288103  normal  0.160551 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3389  DSBA oxidoreductase  44.09 
 
 		 235 aa  69.7  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.354876  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2493  dithiol-disulfide isomerase  36.05 
 
 		 242 aa  68.9  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.138653 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2694  DSBA oxidoreductase  38.37 
 
 		 235 aa  68.6  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.268772 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1893  DSBA oxidoreductase  42.05 
 
 		 238 aa  67.8  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0258  DSBA oxidoreductase  38.37 
 
 		 208 aa  67  0.00000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.494343  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4882  DSBA oxidoreductase  40.91 
 
 		 229 aa  66.6  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0329  protein disulfide isomerase  39.53 
 
 		 243 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00387004  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0308  FrnE protein  39.53 
 
 		 243 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00686429  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0246  protein disulfide isomerase (S-S rearrangase)  39.53 
 
 		 243 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3441  DSBA oxidoreductase  42.39 
 
 		 215 aa  65.5  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.486771  normal  0.667437 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2136  DSBA oxidoreductase  36.67 
 
 		 213 aa  65.5  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.883465  normal  0.0421817 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0249  protein disulfide isomerase (S-S rearrangase)  39.53 
 
 		 243 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0768855  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0252  DSBA oxidoreductase  39.53 
 
 		 243 aa  65.1  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5014  FrnE protein  38.37 
 
 		 243 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0127936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0301  protein disulfide isomerase  39.53 
 
 		 243 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2508  DSBA oxidoreductase  36.36 
 
 		 225 aa  64.3  0.0000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00396553  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0567  DSBA oxidoreductase  39.02 
 
 		 244 aa  63.9  0.0000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0326  DSBA oxidoreductase  45.83 
 
 		 237 aa  63.9  0.0000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2369  polyketide biosynthesis associated protein  36.9 
 
 		 223 aa  62.4  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2343  DSBA oxidoreductase  36.9 
 
 		 234 aa  61.2  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.590857  normal  0.036783 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22550  predicted dithiol-disulfide isomerase involved in polyketide biosynthesis  48.1 
 
 		 227 aa  60.8  0.000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0941  DSBA oxidoreductase  38.37 
 
 		 240 aa  60.1  0.000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.203124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1174  DSBA oxidoreductase  39.56 
 
 		 239 aa  60.1  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.196548 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18220  predicted dithiol-disulfide isomerase involved in polyketide biosynthesis  40.91 
 
 		 218 aa  59.7  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0979  DSBA oxidoreductase  28.57 
 
 		 215 aa  57  0.00000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00033798  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1583  DSBA oxidoreductase  34.52 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0550  polyketide biosynthesis associated protein  33.33 
 
 		 233 aa  55.5  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.682486  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1200  DSBA oxidoreductase  39.29 
 
 		 237 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.153386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0721  DSBA oxidoreductase  36.47 
 
 		 244 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.874736  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0738  DSBA oxidoreductase  36.47 
 
 		 244 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.122622 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1057  DSBA oxidoreductase  43.18 
 
 		 235 aa  55.1  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1398  DSBA oxidoreductase  37.36 
 
 		 237 aa  54.3  0.0000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.394424  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4148  DSBA oxidoreductase  42.67 
 
 		 241 aa  53.9  0.0000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0818  DSBA oxidoreductase  36.47 
 
 		 243 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.115857  normal  0.905369 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2969  DSBA oxidoreductase  35.29 
 
 		 231 aa  53.5  0.0000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0234378  hitchhiker  0.0000221384 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0363  DSBA oxidoreductase  36.47 
 
 		 243 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0846  DSBA oxidoreductase  36.47 
 
 		 243 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.96876  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5788  DSBA oxidoreductase  36.71 
 
 		 215 aa  52  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0487063 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6638  DsbA oxidoreductase  36.14 
 
 		 231 aa  52.4  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3008  DSBA oxidoreductase  35.29 
 
 		 248 aa  52  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.533985  normal  0.21554 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4753  DSBA oxidoreductase  39.29 
 
 		 219 aa  51.2  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.803331  normal  0.448098 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0416  putative dithiol-disulfide isomerase  32.94 
 
 		 221 aa  50.8  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2795  DSBA oxidoreductase  33.73 
 
 		 207 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1278  DSBA oxidoreductase  31.11 
 
 		 222 aa  50.8  0.000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000336164  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0301  DSBA oxidoreductase  36.47 
 
 		 214 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.220851  normal  0.256868 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0591  DSBA oxidoreductase  39.74 
 
 		 238 aa  50.1  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.699138  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7204  DSBA oxidoreductase  34.12 
 
 		 221 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1732  DSBA oxidoreductase  32.14 
 
 		 223 aa  50.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.474005 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3318  DSBA oxidoreductase  38.27 
 
 		 227 aa  49.7  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4106  DSBA oxidoreductase  40.51 
 
 		 229 aa  49.3  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1564  DsbA oxidoreductase  35.71 
 
 		 212 aa  49.7  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0406976  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1916  DSBA oxidoreductase  30.95 
 
 		 223 aa  48.9  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.093015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5468  hypothetical protein  32.22 
 
 		 221 aa  48.5  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1948  DSBA oxidoreductase  38.36 
 
 		 216 aa  48.1  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1398  DSBA oxidoreductase  29.41 
 
 		 221 aa  47.8  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.928742 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2061  DSBA oxidoreductase  34.12 
 
 		 215 aa  47.8  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.16033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0261  DSBA oxidoreductase  34.52 
 
 		 213 aa  47.8  0.00005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0132035 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1100  hypothetical protein  30.23 
 
 		 217 aa  47.4  0.00007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2541  DSBA oxidoreductase  32.94 
 
 		 247 aa  47.4  0.00007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3936  DSBA oxidoreductase  32.94 
 
 		 270 aa  47  0.00009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.763999  hitchhiker  0.00370443 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1639  DSBA oxidoreductase  42 
 
 		 250 aa  46.6  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0762303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0641  DSBA oxidoreductase  35.71 
 
 		 220 aa  45.8  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.109842 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2296  DSBA oxidoreductase  34.12 
 
 		 221 aa  45.8  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00720993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1557  putative DSBA oxidoreductase  38.36 
 
 		 222 aa  45.4  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.455666  normal  0.262117 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6424  DSBA oxidoreductase  30.59 
 
 		 217 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.450496 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4389  DSBA oxidoreductase  34.09 
 
 		 221 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0887682  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01056  probable DSBA oxidoreductase  34.88 
 
 		 211 aa  45.8  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46509  predicted protein  33.67 
 
 		 211 aa  45.8  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.0027  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0024  DSBA oxidoreductase  34.15 
 
 		 211 aa  45.4  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3451  DSBA oxidoreductase  35.37 
 
 		 201 aa  44.7  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3532  DSBA oxidoreductase  44.07 
 
 		 179 aa  44.3  0.0006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1922  DSBA oxidoreductase  36.49 
 
 		 218 aa  43.5  0.0009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.65395  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1148  DSBA oxidoreductase  30.95 
 
 		 237 aa  43.5  0.0009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_10641  DSBA-like thioredoxin domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G06250)  32.53 
 
 		 202 aa  43.1  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0577  frnE protein, putative  27.38 
 
 		 224 aa  43.1  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2316  DSBA oxidoreductase  32.5 
 
 		 221 aa  43.1  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.132325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1542  DSBA oxidoreductase  30.68 
 
 		 224 aa  42.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.208286 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1700  DSBA oxidoreductase  27.27 
 
 		 227 aa  43.1  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0543  dsba oxidoreductase  27.38 
 
 		 224 aa  43.1  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3639  DSBA oxidoreductase  27.38 
 
 		 224 aa  43.1  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0904  polyketide biosynthesis dithiol-disulfide isomerase-like protein  35.63 
 
 		 334 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.924628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3082  DSBA oxidoreductase  32.94 
 
 		 216 aa  42.4  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.275459  normal  0.192023 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3961  DSBA oxidoreductase  38.36 
 
 		 222 aa  42.7  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2107  DSBA oxidoreductase  31.82 
 
 		 226 aa  42.7  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>