126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2656 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_2656  polyketide biosynthesis dithiol-disulfide isomerase-like protein  100 
 
 		 172 aa  354  3.9999999999999996e-97  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3451  DSBA oxidoreductase  25.29 
 
 		 201 aa  67.4  0.00000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12093  hypothetical protein  27.01 
 
 		 214 aa  62  0.000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22550  predicted dithiol-disulfide isomerase involved in polyketide biosynthesis  23.53 
 
 		 227 aa  61.6  0.000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0177  DSBA oxidoreductase  28.47 
 
 		 236 aa  61.2  0.000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4106  DSBA oxidoreductase  24.4 
 
 		 229 aa  60.8  0.000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0746  DSBA oxidoreductase  24.42 
 
 		 215 aa  60.5  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1174  DSBA oxidoreductase  26.9 
 
 		 239 aa  60.5  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.196548 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2195  DSBA oxidoreductase  25.44 
 
 		 215 aa  60.5  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1583  DSBA oxidoreductase  28.3 
 
 		 210 aa  60.5  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1263  hypothetical protein  26.11 
 
 		 166 aa  59.7  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.552972  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0326  DSBA oxidoreductase  32.58 
 
 		 237 aa  59.3  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2493  dithiol-disulfide isomerase  24.29 
 
 		 242 aa  59.3  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.138653 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0485  DSBA oxidoreductase  25.86 
 
 		 216 aa  59.3  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2316  DSBA oxidoreductase  24.86 
 
 		 221 aa  58.9  0.00000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.132325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1398  DSBA oxidoreductase  28.42 
 
 		 221 aa  59.3  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.928742 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1557  putative DSBA oxidoreductase  23.7 
 
 		 222 aa  58.2  0.00000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.455666  normal  0.262117 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2369  polyketide biosynthesis associated protein  29.48 
 
 		 223 aa  58.2  0.00000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0210  DSBA oxidoreductase  26.32 
 
 		 213 aa  57.8  0.00000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1057  DSBA oxidoreductase  31.19 
 
 		 235 aa  57.8  0.00000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1922  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase family protein  26.19 
 
 		 216 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.457007  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1759  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase family protein  26.06 
 
 		 216 aa  55.5  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3532  DSBA oxidoreductase  21.15 
 
 		 179 aa  55.8  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0577  frnE protein, putative  28.07 
 
 		 224 aa  55.5  0.0000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0543  dsba oxidoreductase  28.07 
 
 		 224 aa  55.5  0.0000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00950  predicted dithiol-disulfide isomerase involved in polyketide biosynthesis  23.53 
 
 		 207 aa  54.7  0.0000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0967  DSBA oxidoreductase  27.64 
 
 		 220 aa  54.7  0.0000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.431519  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2002  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase family protein  26.06 
 
 		 216 aa  54.7  0.0000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.126536  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1780  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase family protein  26.06 
 
 		 216 aa  54.7  0.0000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00151932  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1737  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase family protein  26.06 
 
 		 216 aa  54.7  0.0000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.563102  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1200  DSBA oxidoreductase  25.44 
 
 		 237 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.153386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1918  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase family protein  26.06 
 
 		 216 aa  54.7  0.0000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.017598  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3389  DSBA oxidoreductase  22.91 
 
 		 235 aa  54.7  0.0000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.354876  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2023  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase family protein  26.06 
 
 		 216 aa  54.7  0.0000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000252157  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1954  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase family protein  26.06 
 
 		 216 aa  54.7  0.0000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000322125 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4753  DSBA oxidoreductase  24.22 
 
 		 219 aa  54.3  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.803331  normal  0.448098 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2832  DSBA oxidoreductase  24.16 
 
 		 213 aa  54.3  0.0000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.84064  normal  0.0678708 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3598  DSBA oxidoreductase  28.57 
 
 		 220 aa  53.9  0.0000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.432657 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0249  protein disulfide isomerase (S-S rearrangase)  29.6 
 
 		 243 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0768855  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2694  DSBA oxidoreductase  25 
 
 		 235 aa  53.9  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.268772 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1502  DSBA oxidoreductase  24.14 
 
 		 214 aa  53.9  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0283596 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3639  DSBA oxidoreductase  23.39 
 
 		 224 aa  53.9  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2073  DSBA oxidoreductase  25.69 
 
 		 256 aa  53.1  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.232317  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3421  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase family protein  25.45 
 
 		 216 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000359947 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0301  protein disulfide isomerase  29.6 
 
 		 243 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3550  DSBA oxidoreductase  25 
 
 		 220 aa  52.4  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.916573  normal  0.901837 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0641  DSBA oxidoreductase  25.68 
 
 		 220 aa  52.4  0.000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.109842 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1792  DSBA oxidoreductase  25.45 
 
 		 216 aa  52.4  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000899943  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1488  DSBA oxidoreductase  22.41 
 
 		 234 aa  52  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0767657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0515  DSBA oxidoreductase  22.47 
 
 		 221 aa  51.2  0.000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.727593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1347  DSBA oxidoreductase  25.57 
 
 		 233 aa  50.8  0.000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4436  DSBA oxidoreductase  24.72 
 
 		 239 aa  51.2  0.000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.106658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2718  DSBA oxidoreductase  27.1 
 
 		 209 aa  50.8  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0752849  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0252  DSBA oxidoreductase  28 
 
 		 243 aa  50.4  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2795  DSBA oxidoreductase  24.85 
 
 		 207 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01681  hypothetical protein  25.88 
 
 		 222 aa  49.7  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.793044 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0622  DSBA oxidoreductase  23.12 
 
 		 217 aa  49.7  0.00002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1398  DSBA oxidoreductase  25.29 
 
 		 237 aa  49.3  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.394424  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18220  predicted dithiol-disulfide isomerase involved in polyketide biosynthesis  24.71 
 
 		 218 aa  49.7  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01056  probable DSBA oxidoreductase  27.16 
 
 		 211 aa  49.7  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0329  protein disulfide isomerase  28 
 
 		 243 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00387004  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1261  DSBA oxidoreductase  21.91 
 
 		 235 aa  49.7  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.432726  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0246  protein disulfide isomerase (S-S rearrangase)  28 
 
 		 243 aa  49.3  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0639  DSBA oxidoreductase  30.63 
 
 		 220 aa  48.9  0.00003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2709  DSBA oxidoreductase  26.19 
 
 		 214 aa  48.9  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.111017  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1732  DSBA oxidoreductase  26.23 
 
 		 223 aa  49.3  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.474005 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0970  DSBA oxidoreductase  23.84 
 
 		 216 aa  48.5  0.00004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00227612 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1916  DSBA oxidoreductase  26.11 
 
 		 223 aa  48.5  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.093015  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0308  FrnE protein  28 
 
 		 243 aa  48.5  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00686429  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4223  DSBA oxidoreductase  30.3 
 
 		 201 aa  48.5  0.00005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.285896 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2594  DSBA oxidoreductase  26.12 
 
 		 212 aa  47.8  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5500  DSBA oxidoreductase  31.25 
 
 		 217 aa  47.8  0.00008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.790496  normal  0.0537626 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1100  hypothetical protein  24.58 
 
 		 217 aa  47.4  0.00009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1148  DSBA oxidoreductase  24.86 
 
 		 237 aa  47.8  0.00009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1658  DSBA oxidoreductase  29.31 
 
 		 263 aa  47.4  0.00009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4089  hypothetical protein  27.64 
 
 		 211 aa  47  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2852  polyketide biosynthesis associated protein  24.71 
 
 		 214 aa  47  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.456513  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1430  hypothetical protein  24.52 
 
 		 166 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.717184  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0721  DSBA oxidoreductase  23.43 
 
 		 244 aa  47  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.874736  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0654  DSBA oxidoreductase  23.73 
 
 		 220 aa  47  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1441  DSBA oxidoreductase  24.71 
 
 		 214 aa  47.4  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0402577 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0738  DSBA oxidoreductase  23.43 
 
 		 244 aa  47.4  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.122622 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8164  hypothetical protein  25 
 
 		 213 aa  47.4  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.170702 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5014  FrnE protein  28 
 
 		 243 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0127936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0633  DSBA oxidoreductase  24.02 
 
 		 220 aa  47  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.218426  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3785  DSBA oxidoreductase  24.29 
 
 		 210 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.400426  normal  0.0244722 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0728  DSBA oxidoreductase  28.24 
 
 		 230 aa  46.6  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.782064 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5000  DSBA oxidoreductase  21.64 
 
 		 233 aa  46.6  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.324442  normal  0.0420894 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03790  predicted dithiol-disulfide isomerase involved in polyketide biosynthesis  23.43 
 
 		 230 aa  46.6  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.288103  normal  0.160551 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2430  hypothetical protein  25.16 
 
 		 166 aa  46.6  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0873533  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2517  hypothetical protein  25.16 
 
 		 166 aa  46.6  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2136  DSBA oxidoreductase  25.4 
 
 		 213 aa  45.8  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.883465  normal  0.0421817 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3751  DSBA oxidoreductase  22.16 
 
 		 222 aa  45.4  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.395106  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0361  DSBA oxidoreductase  23.73 
 
 		 219 aa  45.4  0.0004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.843248 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2541  DSBA oxidoreductase  24 
 
 		 247 aa  45.1  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6424  DSBA oxidoreductase  20.99 
 
 		 217 aa  45.4  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.450496 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1375  DSBA oxidoreductase  26.67 
 
 		 215 aa  45.4  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000103023  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3008  DSBA oxidoreductase  28.57 
 
 		 248 aa  45.1  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.533985  normal  0.21554 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0979  DSBA oxidoreductase  29.07 
 
 		 215 aa  45.1  0.0005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00033798  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0261  DSBA oxidoreductase  31.71 
 
 		 213 aa  45.1  0.0005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0132035 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>