More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1322 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_1322  inositol monophosphatase  100 
 
 
246 aa  493  1e-139  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3350  inositol monophosphatase  60.67 
 
 
250 aa  286  2e-76  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.989567  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3769  inositol monophosphatase  49.13 
 
 
248 aa  225  5.0000000000000005e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0384562  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3343  inositol monophosphatase  48.93 
 
 
244 aa  219  3e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.685113 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18520  3'-phosphoadenosine 5'-phosphosulfate (PAPS) 3'-phosphatase  51.02 
 
 
250 aa  216  2.9999999999999998e-55  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.748791  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6391  inositol monophosphatase  52.28 
 
 
261 aa  211  7e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.597249  normal  0.139481 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1340  inositol monophosphatase  50.43 
 
 
270 aa  206  2e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.758603  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3047  inositol monophosphatase  50.86 
 
 
262 aa  205  5e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.365425  normal  0.892025 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3479  inositol monophosphatase  50.88 
 
 
257 aa  203  2e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.647629  normal  0.529394 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3166  inositol monophosphatase  54.88 
 
 
252 aa  200  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3980  inositol monophosphatase  47.58 
 
 
263 aa  200  1.9999999999999998e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3154  inositol monophosphatase  54.88 
 
 
252 aa  200  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0435159  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3216  inositol monophosphatase  54.88 
 
 
252 aa  200  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0934  inositol monophosphatase  48.57 
 
 
253 aa  199  5e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4224  inositol monophosphatase  52.63 
 
 
237 aa  196  4.0000000000000005e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206669  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0418  3'-phosphoadenosine 5'-phosphosulfate (PAPS) 3'-phosphatase  47.97 
 
 
265 aa  192  5e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12162  monophosphatase cysQ  49.17 
 
 
267 aa  191  7e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.309321 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1294  inositol monophosphatase  50.42 
 
 
282 aa  188  8e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0736  inositol monophosphatase  47.01 
 
 
277 aa  183  2.0000000000000003e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0207527 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1525  inositol monophosphatase  48.57 
 
 
248 aa  183  3e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.93578 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5170  inositol monophosphatase  44.24 
 
 
297 aa  182  5.0000000000000004e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0144285  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0913  inositol monophosphatase  47.72 
 
 
259 aa  177  2e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0792  inositol monophosphatase  45.86 
 
 
275 aa  175  5e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3932  inositol monophosphatase  46.91 
 
 
242 aa  174  9e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.123025 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1002  inositol monophosphatase  46.99 
 
 
275 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3917  inositol monophosphatase  47.3 
 
 
242 aa  173  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3991  inositol monophosphatase  47.3 
 
 
242 aa  173  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4421  inositol monophosphatase  47.33 
 
 
248 aa  169  4e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3150  inositol monophosphatase  49.36 
 
 
258 aa  167  2e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.956906 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2273  inositol monophosphatase  50.24 
 
 
248 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4660  inositol monophosphatase  53.94 
 
 
249 aa  162  5.0000000000000005e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.758546  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8602  inositol monophosphatase family protein  46.15 
 
 
255 aa  159  3e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3118  inositol monophosphatase  40.57 
 
 
263 aa  139  4.999999999999999e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.940535  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0795  inositol monophosphatase  36.56 
 
 
402 aa  94.4  1e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2912  protein CysQ  30.61 
 
 
272 aa  92.8  4e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0130  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  31.85 
 
 
270 aa  92.4  5e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.835537 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00612  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  31.15 
 
 
275 aa  90.9  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001881  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  30.74 
 
 
275 aa  89  6e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3283  inositol monophosphatase  29.17 
 
 
274 aa  88.6  9e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000172792  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2295  cysQ protein  29.92 
 
 
275 aa  86.7  3e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0157  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  32.38 
 
 
269 aa  86.3  4e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00114057  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3050  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  34.13 
 
 
265 aa  84.7  0.000000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.213338  normal  0.39699 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03972  3-Phosphoadenosine 5-phosphosulfate (PAPS) 3-phosphatase  28.63 
 
 
281 aa  84.7  0.000000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00312866  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0118  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  31.28 
 
 
269 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1485  inositol monophosphatase  34.97 
 
 
278 aa  83.2  0.000000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.208921  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0170  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  31.28 
 
 
270 aa  83.2  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0165  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  31.28 
 
 
270 aa  82.8  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.462598 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0170  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  31.28 
 
 
270 aa  82.8  0.000000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0125589  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4187  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  31.28 
 
 
270 aa  82.4  0.000000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0172  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  31.28 
 
 
270 aa  82.4  0.000000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.126779 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0168  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  31.28 
 
 
270 aa  82  0.000000000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4086  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  31.28 
 
 
237 aa  82  0.000000000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5401  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  33.33 
 
 
269 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3674  inositol monophosphatase  31.15 
 
 
292 aa  80.9  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0191  cysQ protein  31.28 
 
 
270 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4940  3(2),5 -bisphosphate nucleotidase  31.75 
 
 
280 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1688  putative inositol monophosphatase family protein  34.88 
 
 
248 aa  80.9  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.719108 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3728  inositol monophosphatase  31.15 
 
 
292 aa  80.9  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.275945  normal  0.190022 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0638  sulfite synthesis pathway protein  28.79 
 
 
261 aa  80.1  0.00000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.162626  normal  0.297476 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3548  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  30.81 
 
 
270 aa  80.1  0.00000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6775  inositol-1(or 4)-monophosphatase  34.31 
 
 
264 aa  79.7  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1501  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  30.33 
 
 
267 aa  79.3  0.00000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0184  cysQ protein  30.84 
 
 
270 aa  79.3  0.00000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.39498 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0917  inositol monophosphatase  31.07 
 
 
258 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.018726  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4345  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  30.05 
 
 
270 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0764752  normal  0.270175 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3079  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  33.94 
 
 
267 aa  77.4  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.955512  normal  0.146512 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2983  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  32.5 
 
 
272 aa  76.6  0.0000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16661  CysQ  28.42 
 
 
304 aa  77  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.385799  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5057  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  30.26 
 
 
287 aa  77  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13851  CysQ  29.51 
 
 
300 aa  76.6  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.490576  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0137  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  25.81 
 
 
278 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4717  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  26.54 
 
 
270 aa  76.3  0.0000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.957777  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0811  3'-phosphoadenosine-5'-phosphosulfate (PAPS) 3'-phosphatase  28.49 
 
 
304 aa  75.9  0.0000000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.989913  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0225  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  30.59 
 
 
269 aa  75.5  0.0000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.453654  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0276  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  31.63 
 
 
272 aa  75.5  0.0000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1716  inositol monophosphatase  32.34 
 
 
317 aa  75.5  0.0000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13931  CysQ-like protein  26.03 
 
 
300 aa  75.5  0.0000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.886822  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0435  inositol monophosphatase  30.04 
 
 
264 aa  75.5  0.0000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2303  inositol monophosphatase  31.11 
 
 
293 aa  75.5  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000171915 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0285  3(2),5 -bisphosphate nucleotidase  33.33 
 
 
275 aa  75.1  0.0000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.736808  normal  0.186068 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0394  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  29.59 
 
 
272 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.861992  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1912  inositol monophosphatase  32.96 
 
 
284 aa  74.3  0.000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06011  CysQ  31.91 
 
 
334 aa  73.9  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.224612 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0630  inositol-phosphate phosphatase  26.85 
 
 
268 aa  74.3  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4949  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  29.29 
 
 
275 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.19378  hitchhiker  0.0000193333 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0261  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  31.72 
 
 
266 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.014346 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3486  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  31.53 
 
 
280 aa  73.6  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.174381 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0569  CysQ protein-like  30.58 
 
 
305 aa  73.6  0.000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.466541  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1058  inositol monophosphatase  32.02 
 
 
281 aa  73.2  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000501091 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3002  inositol-phosphate phosphatase  29.8 
 
 
258 aa  72.8  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.867462  normal  0.136891 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0422  inositol monophosphatase  28.22 
 
 
272 aa  72.4  0.000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2419  3(2),5 -bisphosphate nucleotidase  26.14 
 
 
284 aa  72.4  0.000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0286  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  30.88 
 
 
272 aa  72.4  0.000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2576  inositol monophosphatase  29.61 
 
 
258 aa  72  0.000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.635906 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0173  3'-phosphoadenosine 5'-phosphosulfate (PAPS) 3'-phosphatase-like  34.97 
 
 
289 aa  72.4  0.000000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.82997  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0530  inositol monophosphatase  27.86 
 
 
269 aa  72.4  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.428745 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1985  inositol monophosphatase  29.88 
 
 
290 aa  72  0.000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.838762 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1795  CysQ protein-like  31.94 
 
 
305 aa  72  0.000000000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1898  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  28.41 
 
 
265 aa  71.2  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00288837  normal  0.0251034 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1320  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  29.15 
 
 
266 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>