More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3769 on replicon NC_009427
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009427  Saro_3769  inositol monophosphatase  100 
 
 
248 aa  502  1e-141  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0384562  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3343  inositol monophosphatase  77.83 
 
 
244 aa  370  1e-102  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.685113 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1525  inositol monophosphatase  66.51 
 
 
248 aa  268  5e-71  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.93578 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0934  inositol monophosphatase  55.74 
 
 
253 aa  254  9e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6391  inositol monophosphatase  56.72 
 
 
261 aa  240  2e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.597249  normal  0.139481 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3980  inositol monophosphatase  53.5 
 
 
263 aa  233  2.0000000000000002e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1322  inositol monophosphatase  49.13 
 
 
246 aa  225  5.0000000000000005e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3350  inositol monophosphatase  46.61 
 
 
250 aa  223  2e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.989567  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4224  inositol monophosphatase  55.46 
 
 
237 aa  223  2e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206669  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1340  inositol monophosphatase  53.53 
 
 
270 aa  222  4e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.758603  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3932  inositol monophosphatase  54.17 
 
 
242 aa  220  9.999999999999999e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.123025 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3917  inositol monophosphatase  54.17 
 
 
242 aa  219  3e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3991  inositol monophosphatase  54.17 
 
 
242 aa  219  3e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0418  3'-phosphoadenosine 5'-phosphosulfate (PAPS) 3'-phosphatase  52.44 
 
 
265 aa  219  3.9999999999999997e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1294  inositol monophosphatase  52.61 
 
 
282 aa  218  8.999999999999998e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18520  3'-phosphoadenosine 5'-phosphosulfate (PAPS) 3'-phosphatase  49.19 
 
 
250 aa  209  4e-53  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.748791  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0913  inositol monophosphatase  51.9 
 
 
259 aa  207  1e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4421  inositol monophosphatase  52.7 
 
 
248 aa  207  1e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5170  inositol monophosphatase  48.51 
 
 
297 aa  207  2e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0144285  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3047  inositol monophosphatase  49.57 
 
 
262 aa  206  2e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.365425  normal  0.892025 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3479  inositol monophosphatase  47.92 
 
 
257 aa  203  2e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.647629  normal  0.529394 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12162  monophosphatase cysQ  51.48 
 
 
267 aa  202  4e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.309321 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2273  inositol monophosphatase  54.73 
 
 
248 aa  201  9e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3150  inositol monophosphatase  51.85 
 
 
258 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.956906 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3166  inositol monophosphatase  49.58 
 
 
252 aa  192  5e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3154  inositol monophosphatase  49.58 
 
 
252 aa  192  5e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0435159  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3216  inositol monophosphatase  49.58 
 
 
252 aa  192  5e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8602  inositol monophosphatase family protein  51.2 
 
 
255 aa  189  2.9999999999999997e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0736  inositol monophosphatase  46.18 
 
 
277 aa  187  1e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0207527 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1002  inositol monophosphatase  48.56 
 
 
275 aa  185  7e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0792  inositol monophosphatase  45.42 
 
 
275 aa  175  5e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4660  inositol monophosphatase  54.03 
 
 
249 aa  169  4e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.758546  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3118  inositol monophosphatase  43.16 
 
 
263 aa  143  2e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.940535  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5057  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  34.63 
 
 
287 aa  95.9  5e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1246  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  35.86 
 
 
273 aa  93.2  3e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.757598  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0795  inositol monophosphatase  32.2 
 
 
402 aa  91.7  9e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2295  cysQ protein  30.54 
 
 
275 aa  87  2e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3728  inositol monophosphatase  29.02 
 
 
292 aa  86.7  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.275945  normal  0.190022 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3674  inositol monophosphatase  29.02 
 
 
292 aa  86.7  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3050  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  35.19 
 
 
265 aa  86.3  5e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.213338  normal  0.39699 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4200  inositol monophosphatase  30.5 
 
 
277 aa  84.3  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0701939  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03972  3-Phosphoadenosine 5-phosphosulfate (PAPS) 3-phosphatase  26.21 
 
 
281 aa  83.6  0.000000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00312866  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1485  inositol monophosphatase  32.13 
 
 
278 aa  82.8  0.000000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.208921  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3283  inositol monophosphatase  31.12 
 
 
274 aa  82.4  0.000000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000172792  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2417  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  31.35 
 
 
277 aa  82  0.000000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.620864  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0137  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  24.9 
 
 
278 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2343  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  32.27 
 
 
269 aa  81.6  0.00000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.847006  normal  0.982736 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1427  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  30.24 
 
 
264 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.839377  normal  0.0817385 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0638  sulfite synthesis pathway protein  30.62 
 
 
261 aa  80.9  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.162626  normal  0.297476 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2373  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  34.08 
 
 
274 aa  80.9  0.00000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000809688 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0118  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  30.24 
 
 
269 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2912  protein CysQ  26.69 
 
 
272 aa  80.5  0.00000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00612  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  28.39 
 
 
275 aa  80.1  0.00000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001881  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  27.97 
 
 
275 aa  80.1  0.00000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0170  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  30.52 
 
 
270 aa  80.1  0.00000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0125589  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2651  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  30.29 
 
 
255 aa  79.3  0.00000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0131852  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1688  putative inositol monophosphatase family protein  30.18 
 
 
248 aa  79.3  0.00000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.719108 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2932  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  29.34 
 
 
276 aa  78.6  0.00000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0165  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  30.05 
 
 
270 aa  78.6  0.00000000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.462598 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0184  cysQ protein  29.13 
 
 
270 aa  78.6  0.00000000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.39498 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2983  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  28.4 
 
 
272 aa  78.2  0.0000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4086  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  30.05 
 
 
237 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0172  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  30.05 
 
 
270 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.126779 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3079  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  29.29 
 
 
267 aa  78.2  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.955512  normal  0.146512 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0170  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  30.05 
 
 
270 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3548  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  30.05 
 
 
270 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0168  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  30.05 
 
 
270 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3171  inositol monophosphatase  30.85 
 
 
258 aa  77.4  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1203  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  31.2 
 
 
256 aa  77.4  0.0000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4187  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  29.58 
 
 
270 aa  77  0.0000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1501  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  29.86 
 
 
267 aa  77  0.0000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0157  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  28.3 
 
 
269 aa  75.9  0.0000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00114057  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0191  cysQ protein  30.05 
 
 
270 aa  75.5  0.0000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1985  inositol monophosphatase  28.99 
 
 
290 aa  75.5  0.0000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.838762 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4345  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  27.63 
 
 
270 aa  75.1  0.0000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0764752  normal  0.270175 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0817  adenosine-3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  29.35 
 
 
246 aa  75.1  0.0000000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1853  inositol-1(or 4)-monophosphatase  29.34 
 
 
253 aa  74.3  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0604801  decreased coverage  0.000548461 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2419  3(2),5 -bisphosphate nucleotidase  30.62 
 
 
284 aa  74.3  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0530  inositol monophosphatase  30.61 
 
 
269 aa  73.9  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.428745 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4717  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  27.08 
 
 
270 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.957777  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2640  inositol monophosphatase  27.06 
 
 
266 aa  74.3  0.000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.727914  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0630  inositol-phosphate phosphatase  27.53 
 
 
268 aa  74.3  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0140  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  28.57 
 
 
266 aa  73.9  0.000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2288  inositol monophosphatase  35.23 
 
 
265 aa  73.2  0.000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.690009  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0130  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  27.06 
 
 
270 aa  72.4  0.000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.835537 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3181  inositol monophosphatase  31.58 
 
 
271 aa  72  0.000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.717976  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1795  CysQ protein-like  31.33 
 
 
305 aa  72  0.000000000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0811  3'-phosphoadenosine-5'-phosphosulfate (PAPS) 3'-phosphatase  26.58 
 
 
304 aa  71.2  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.989913  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0159  sulfite synthesis pathway protein  27.88 
 
 
272 aa  71.2  0.00000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2172  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  28.64 
 
 
269 aa  71.6  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.244558  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0225  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  28.17 
 
 
269 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.453654  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06011  CysQ  30.08 
 
 
334 aa  71.6  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.224612 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2303  inositol monophosphatase  25.24 
 
 
293 aa  71.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000171915 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5401  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  28.57 
 
 
269 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4940  3(2),5 -bisphosphate nucleotidase  28.05 
 
 
280 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4111  inositol-1(or 4)-monophosphatase  29.22 
 
 
271 aa  70.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0435  inositol monophosphatase  39.08 
 
 
264 aa  70.5  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1469  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  29.22 
 
 
268 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16661  CysQ  25.66 
 
 
304 aa  70.5  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.385799  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0568  inositol monophosphatase  29.84 
 
 
263 aa  70.1  0.00000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.437406 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>