More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1688 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_1688  putative inositol monophosphatase family protein  100 
 
 
248 aa  501  1e-141  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.719108 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4707  inositol monophosphatase  68.31 
 
 
270 aa  338  5.9999999999999996e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.977346  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1853  inositol-1(or 4)-monophosphatase  68.83 
 
 
253 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0604801  decreased coverage  0.000548461 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4111  inositol-1(or 4)-monophosphatase  68.44 
 
 
271 aa  334  7.999999999999999e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1347  inositol monophosphatase  68.67 
 
 
271 aa  332  2e-90  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0596677  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3181  inositol monophosphatase  67.89 
 
 
271 aa  330  1e-89  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.717976  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2559  inositol monophosphatase  69.14 
 
 
275 aa  327  8e-89  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.38703  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1485  inositol monophosphatase  52.97 
 
 
278 aa  226  4e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.208921  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0821  inositol monophosphatase  47.28 
 
 
272 aa  207  2e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.272919 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0855  inositol monophosphatase  46.86 
 
 
272 aa  205  5e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0786662  normal  0.150631 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0895  inositol monophosphatase  46.86 
 
 
272 aa  204  8e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.632992 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0915  inositol monophosphatase  45.87 
 
 
273 aa  201  7e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.208619 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0630  inositol-phosphate phosphatase  46.15 
 
 
268 aa  198  6e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5380  inositol monophosphatase  44.49 
 
 
271 aa  198  7e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.297931 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0361  inositol monophosphatase  46.06 
 
 
270 aa  198  7e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.186566  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2248  inositol monophosphatase  44.88 
 
 
270 aa  192  5e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.041874  normal  0.100685 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0530  inositol monophosphatase  43.62 
 
 
269 aa  188  8e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.428745 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0486  inositol monophosphatase  42.8 
 
 
269 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0479273 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0070  inositol monophosphatase  43.83 
 
 
273 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.207628 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0422  inositol monophosphatase  42.86 
 
 
272 aa  175  5e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2640  inositol monophosphatase  42.74 
 
 
266 aa  176  5e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.727914  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0902  inositol monophosphatase family protein  46.96 
 
 
270 aa  174  9e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3043  inositol monophosphatase  40.34 
 
 
265 aa  170  2e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0435  inositol monophosphatase  41.49 
 
 
264 aa  168  6e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0192  inositol monophosphatase family protein  39.57 
 
 
269 aa  168  9e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0212  inositol monophosphatase family protein  39.57 
 
 
254 aa  166  2.9999999999999998e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4535  inositol-phosphate phosphatase  40.24 
 
 
261 aa  161  1e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.196766 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3283  inositol monophosphatase  37.12 
 
 
274 aa  157  1e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000172792  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0063  inositol-phosphate phosphatase  38.11 
 
 
264 aa  149  3e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.695366  hitchhiker  0.0000489388 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0917  inositol monophosphatase  40.56 
 
 
258 aa  145  5e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.018726  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0402  inositol-1(or 4)-monophosphatase  36.36 
 
 
260 aa  144  2e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.126302  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3002  inositol-phosphate phosphatase  36.82 
 
 
258 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.867462  normal  0.136891 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2576  inositol monophosphatase  39.76 
 
 
258 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.635906 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0795  inositol monophosphatase  38.98 
 
 
402 aa  136  3.0000000000000003e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3171  inositol monophosphatase  38.03 
 
 
258 aa  135  8e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0024  inositol monophosphatase  33.07 
 
 
271 aa  132  3.9999999999999996e-30  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2360  inositol monophosphatase  39.81 
 
 
259 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0568  inositol monophosphatase  36.89 
 
 
263 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.437406 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2288  inositol monophosphatase  34.36 
 
 
265 aa  127  1.0000000000000001e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.690009  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2688  inositol monophosphatase  38.3 
 
 
273 aa  127  2.0000000000000002e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0157  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  37.44 
 
 
269 aa  126  3e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00114057  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00612  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  32.78 
 
 
275 aa  124  1e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001881  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  32.78 
 
 
275 aa  124  2e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0225  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  36.07 
 
 
269 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.453654  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2912  protein CysQ  32.92 
 
 
272 aa  120  1.9999999999999998e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2295  cysQ protein  33.19 
 
 
275 aa  120  3e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2983  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  35.68 
 
 
272 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4717  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  35.16 
 
 
270 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.957777  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0170  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  35.62 
 
 
270 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0125589  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0130  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  34.45 
 
 
270 aa  116  3e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.835537 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0170  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  35.62 
 
 
270 aa  116  3e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2419  3(2),5 -bisphosphate nucleotidase  34.36 
 
 
284 aa  115  6.9999999999999995e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03972  3-Phosphoadenosine 5-phosphosulfate (PAPS) 3-phosphatase  29.87 
 
 
281 aa  115  6.9999999999999995e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00312866  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0165  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  35.16 
 
 
270 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.462598 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4086  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  34.26 
 
 
237 aa  115  8.999999999999998e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0191  cysQ protein  36.07 
 
 
270 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3548  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  34.26 
 
 
270 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4187  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  34.91 
 
 
270 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0168  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  34.26 
 
 
270 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0172  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  34.26 
 
 
270 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.126779 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4345  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  32.48 
 
 
270 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0764752  normal  0.270175 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1199  inositol-phosphate phosphatase  36.45 
 
 
264 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.339227 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1219  Inositol-phosphate phosphatase  32.31 
 
 
256 aa  113  3e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0118  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  31.93 
 
 
269 aa  113  3e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2747  Inositol-phosphate phosphatase  34.39 
 
 
275 aa  112  4.0000000000000004e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.436852  normal  0.572242 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0603  Inositol-phosphate phosphatase  31.25 
 
 
269 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0712  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  31.02 
 
 
271 aa  111  1.0000000000000001e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1466  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  31.02 
 
 
271 aa  110  2.0000000000000002e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1076  inositol monophosphatase  35.14 
 
 
263 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0543949  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2343  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  34.78 
 
 
269 aa  110  2.0000000000000002e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.847006  normal  0.982736 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0184  cysQ protein  33.03 
 
 
270 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.39498 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1174  inositol-phosphate phosphatase  31.37 
 
 
254 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3950  inositol monophosphatase  33.66 
 
 
570 aa  108  5e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.176149  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1912  inositol monophosphatase  29.66 
 
 
284 aa  108  8.000000000000001e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1798  inositol-phosphate phosphatase  28.69 
 
 
258 aa  108  9.000000000000001e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.186546  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0137  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  29.96 
 
 
278 aa  107  1e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0638  sulfite synthesis pathway protein  29.82 
 
 
261 aa  107  1e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.162626  normal  0.297476 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1698  inositol monophosphatase  37.1 
 
 
261 aa  106  3e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.133457  normal  0.97401 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0186  inositol-phosphate phosphatase  33.62 
 
 
257 aa  107  3e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1246  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  31.49 
 
 
273 aa  107  3e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.757598  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0179  3(2),5-bisphosphate nucleotidase  31.98 
 
 
260 aa  106  3e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00838731  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6932  inositol monophosphatase  33.78 
 
 
263 aa  106  4e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.538744 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3079  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  34.02 
 
 
267 aa  106  4e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.955512  normal  0.146512 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1028  inositol monophosphatase  33.33 
 
 
269 aa  105  6e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00157763  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0525  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  31.25 
 
 
273 aa  105  7e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4971  inositol monophosphatase  35.45 
 
 
268 aa  105  7e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00388  inositol-1-monophosphatase  33.99 
 
 
277 aa  105  8e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.25186  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2471  inositol monophosphatase  31.42 
 
 
261 aa  105  9e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3537  inositol-1(or 4)-monophosphatase  33.03 
 
 
263 aa  104  1e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5057  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  31.6 
 
 
287 aa  103  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0898  Inositol-phosphate phosphatase  29.6 
 
 
265 aa  104  2e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000281614  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2303  inositol monophosphatase  29.28 
 
 
293 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000171915 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2373  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  32.4 
 
 
274 aa  103  2e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000809688 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2588  inositol-phosphate phosphatase  36.57 
 
 
265 aa  104  2e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2321  inositol monophosphatase  33.66 
 
 
267 aa  104  2e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000655872  normal  0.931835 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2651  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  29.63 
 
 
255 aa  103  3e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0131852  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3293  inositol-1(or 4)-monophosphatase  32.88 
 
 
328 aa  103  3e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.657669  normal  0.273671 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1501  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  29.72 
 
 
267 aa  102  4e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3672  extragenic suppressor protein SuhB  32.27 
 
 
266 aa  101  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2101  inositol-phosphate phosphatase  31.78 
 
 
267 aa  101  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0413503  hitchhiker  0.00162908 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>