More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1340 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1340  inositol monophosphatase  100 
 
 		 270 aa  521  1e-147  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.758603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5170  inositol monophosphatase  69.07 
 
 		 297 aa  350  2e-95  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0144285  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3980  inositol monophosphatase  62.86 
 
 		 263 aa  288  5.0000000000000004e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0418  3'-phosphoadenosine 5'-phosphosulfate (PAPS) 3'-phosphatase  61.22 
 
 		 265 aa  266  2e-70  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4421  inositol monophosphatase  62.81 
 
 		 248 aa  255  5e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3932  inositol monophosphatase  61.25 
 
 		 242 aa  254  8e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.123025 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3917  inositol monophosphatase  60.83 
 
 		 242 aa  251  1e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3991  inositol monophosphatase  60.83 
 
 		 242 aa  251  1e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8602  inositol monophosphatase family protein  61.29 
 
 		 255 aa  248  5e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3150  inositol monophosphatase  62.13 
 
 		 258 aa  248  5e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.956906 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2273  inositol monophosphatase  62.4 
 
 		 248 aa  245  4.9999999999999997e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6391  inositol monophosphatase  58.2 
 
 		 261 aa  243  1.9999999999999999e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.597249  normal  0.139481 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0913  inositol monophosphatase  56.72 
 
 		 259 aa  239  4e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1294  inositol monophosphatase  56.28 
 
 		 282 aa  236  3e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0934  inositol monophosphatase  56.73 
 
 		 253 aa  236  4e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18520  3'-phosphoadenosine 5'-phosphosulfate (PAPS) 3'-phosphatase  53.94 
 
 		 250 aa  234  1.0000000000000001e-60  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.748791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12162  monophosphatase cysQ  54.65 
 
 		 267 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.309321 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4224  inositol monophosphatase  58.61 
 
 		 237 aa  230  2e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206669  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3047  inositol monophosphatase  53.22 
 
 		 262 aa  228  1e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.365425  normal  0.892025 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0736  inositol monophosphatase  51.7 
 
 		 277 aa  226  2e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0207527 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3343  inositol monophosphatase  57.76 
 
 		 244 aa  226  4e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.685113 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1002  inositol monophosphatase  56.76 
 
 		 275 aa  225  6e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3769  inositol monophosphatase  52.85 
 
 		 248 aa  223  2e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0384562  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0792  inositol monophosphatase  52.09 
 
 		 275 aa  223  2e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3479  inositol monophosphatase  50.63 
 
 		 257 aa  218  1e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.647629  normal  0.529394 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3166  inositol monophosphatase  53.42 
 
 		 252 aa  213  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3154  inositol monophosphatase  53.42 
 
 		 252 aa  213  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0435159  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3216  inositol monophosphatase  53.42 
 
 		 252 aa  213  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3350  inositol monophosphatase  49.79 
 
 		 250 aa  209  3e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.989567  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1322  inositol monophosphatase  48.76 
 
 		 246 aa  207  2e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1525  inositol monophosphatase  59.53 
 
 		 248 aa  204  9e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.93578 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4660  inositol monophosphatase  59.7 
 
 		 249 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.758546  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3118  inositol monophosphatase  43.03 
 
 		 263 aa  152  5.9999999999999996e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.940535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0795  inositol monophosphatase  33.46 
 
 		 402 aa  95.9  6e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2343  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  39.37 
 
 		 269 aa  95.5  9e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.847006  normal  0.982736 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1501  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  34.08 
 
 		 267 aa  94.4  2e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0817  adenosine-3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  32.62 
 
 		 246 aa  91.7  1e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1320  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  29.67 
 
 		 266 aa  89.4  5e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1427  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  34.86 
 
 		 264 aa  89  7e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.839377  normal  0.0817385 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2983  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  34.47 
 
 		 272 aa  88.2  1e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2295  cysQ protein  31.17 
 
 		 275 aa  87.8  2e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1655  cysQ protein  32.57 
 
 		 253 aa  86.7  3e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4200  inositol monophosphatase  30.59 
 
 		 277 aa  86.7  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0701939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0170  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  31.27 
 
 		 270 aa  87  3e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0125589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3050  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  38 
 
 		 265 aa  87  3e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.213338  normal  0.39699 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2912  protein CysQ  30.12 
 
 		 272 aa  86.7  4e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00612  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  31.17 
 
 		 275 aa  86.7  4e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001881  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  31.17 
 
 		 275 aa  85.9  7e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1246  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  34.5 
 
 		 273 aa  85.9  7e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.757598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0170  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  30.89 
 
 		 270 aa  85.5  8e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0165  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  30.5 
 
 		 270 aa  85.5  9e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.462598 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1440  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  31.98 
 
 		 262 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.022159  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3073  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  32.35 
 
 		 265 aa  85.1  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3329  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  31.51 
 
 		 265 aa  84  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.908736  normal  0.550753 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2373  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  36.53 
 
 		 274 aa  83.6  0.000000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000809688 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0118  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  28.69 
 
 		 269 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2419  3(2),5 -bisphosphate nucleotidase  31.76 
 
 		 284 aa  83.2  0.000000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1485  inositol monophosphatase  38.12 
 
 		 278 aa  83.2  0.000000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.208921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2417  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  34.68 
 
 		 277 aa  82.8  0.000000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.620864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2684  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  30.68 
 
 		 268 aa  82.8  0.000000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000412314 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0130  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  28.69 
 
 		 270 aa  83.2  0.000000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.835537 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0184  cysQ protein  29.46 
 
 		 270 aa  82.8  0.000000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.39498 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1505  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  33.18 
 
 		 268 aa  82.8  0.000000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0191  cysQ protein  31.42 
 
 		 270 aa  82.8  0.000000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2878  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  33.18 
 
 		 268 aa  82.8  0.000000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000434249 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1058  inositol monophosphatase  33.18 
 
 		 281 aa  82  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000501091 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2617  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  31.05 
 
 		 268 aa  82.4  0.000000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000408883 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3548  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  30.23 
 
 		 270 aa  82  0.000000000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1469  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  33.18 
 
 		 268 aa  82  0.000000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0157  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  29.58 
 
 		 269 aa  82  0.00000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00114057  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4187  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  30.23 
 
 		 270 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0172  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  30.23 
 
 		 270 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.126779 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0646  3(2),5 -bisphosphate nucleotidase  25.62 
 
 		 251 aa  81.3  0.00000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12791  CysQ-like protein  33.16 
 
 		 326 aa  81.6  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.386553  normal  0.0458292 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0168  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  30.23 
 
 		 270 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2373  inositol monophosphatase  33.47 
 
 		 259 aa  81.6  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2058  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  31.25 
 
 		 274 aa  81.3  0.00000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0137  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  24.29 
 
 		 278 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0024  inositol monophosphatase  30 
 
 		 271 aa  81.3  0.00000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2932  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  31.56 
 
 		 276 aa  81.3  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1912  inositol monophosphatase  30.99 
 
 		 284 aa  81.3  0.00000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5057  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  31.46 
 
 		 287 aa  80.5  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2651  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  30.2 
 
 		 255 aa  80.5  0.00000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0131852  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1985  inositol monophosphatase  30.59 
 
 		 290 aa  80.1  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.838762 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1474  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  32.72 
 
 		 268 aa  79.7  0.00000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3622  thioredoxin  31.75 
 
 		 271 aa  79.7  0.00000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.359858 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2791  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  30.28 
 
 		 268 aa  79.3  0.00000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0197504 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0712  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  30.39 
 
 		 271 aa  79  0.00000000000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1396  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  37.5 
 
 		 256 aa  79  0.00000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0294905  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4717  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  28.04 
 
 		 270 aa  79  0.00000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.957777  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01649  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  30.33 
 
 		 266 aa  79  0.00000000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.643804  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1466  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  30.39 
 
 		 271 aa  78.6  0.0000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3283  inositol monophosphatase  31.02 
 
 		 274 aa  78.2  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000172792  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0917  inositol monophosphatase  34.76 
 
 		 258 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.018726  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03972  3-Phosphoadenosine 5-phosphosulfate (PAPS) 3-phosphatase  26.89 
 
 		 281 aa  77  0.0000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00312866  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3674  inositol monophosphatase  31.32 
 
 		 292 aa  77  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1203  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  34.6 
 
 		 256 aa  77  0.0000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3171  inositol monophosphatase  35.08 
 
 		 258 aa  77.4  0.0000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3728  inositol monophosphatase  31.32 
 
 		 292 aa  77  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.275945  normal  0.190022 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0140  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  29.96 
 
 		 266 aa  77  0.0000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>