More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3350 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_3350  inositol monophosphatase  100 
 
 
250 aa  501  1e-141  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.989567  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1322  inositol monophosphatase  60.67 
 
 
246 aa  286  2e-76  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3343  inositol monophosphatase  50.22 
 
 
244 aa  224  9e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.685113 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3769  inositol monophosphatase  46.61 
 
 
248 aa  223  2e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0384562  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12162  monophosphatase cysQ  52.97 
 
 
267 aa  213  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.309321 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6391  inositol monophosphatase  54.13 
 
 
261 aa  212  4.9999999999999996e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.597249  normal  0.139481 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1340  inositol monophosphatase  50.21 
 
 
270 aa  207  9e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.758603  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3047  inositol monophosphatase  52.83 
 
 
262 aa  205  5e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.365425  normal  0.892025 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3479  inositol monophosphatase  52.78 
 
 
257 aa  205  5e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.647629  normal  0.529394 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18520  3'-phosphoadenosine 5'-phosphosulfate (PAPS) 3'-phosphatase  49.58 
 
 
250 aa  203  2e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.748791  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3980  inositol monophosphatase  48.98 
 
 
263 aa  203  2e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0934  inositol monophosphatase  47.74 
 
 
253 aa  202  4e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0418  3'-phosphoadenosine 5'-phosphosulfate (PAPS) 3'-phosphatase  50.21 
 
 
265 aa  198  7.999999999999999e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3166  inositol monophosphatase  52.31 
 
 
252 aa  194  1e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3154  inositol monophosphatase  52.31 
 
 
252 aa  194  1e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0435159  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3216  inositol monophosphatase  52.31 
 
 
252 aa  194  1e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1525  inositol monophosphatase  49.52 
 
 
248 aa  190  2e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.93578 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3917  inositol monophosphatase  50.62 
 
 
242 aa  190  2e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3991  inositol monophosphatase  50.62 
 
 
242 aa  190  2e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4224  inositol monophosphatase  54.76 
 
 
237 aa  189  2.9999999999999997e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206669  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3932  inositol monophosphatase  50.62 
 
 
242 aa  189  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.123025 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1294  inositol monophosphatase  48.58 
 
 
282 aa  189  4e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0913  inositol monophosphatase  49.17 
 
 
259 aa  187  1e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5170  inositol monophosphatase  46.1 
 
 
297 aa  183  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0144285  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0736  inositol monophosphatase  47.19 
 
 
277 aa  183  3e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0207527 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3150  inositol monophosphatase  49.4 
 
 
258 aa  182  5.0000000000000004e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.956906 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0792  inositol monophosphatase  45.19 
 
 
275 aa  177  1e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2273  inositol monophosphatase  53.14 
 
 
248 aa  175  5e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4421  inositol monophosphatase  48.97 
 
 
248 aa  175  6e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4660  inositol monophosphatase  52.67 
 
 
249 aa  162  6e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.758546  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8602  inositol monophosphatase family protein  44.86 
 
 
255 aa  156  3e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1002  inositol monophosphatase  44.64 
 
 
275 aa  155  8e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3118  inositol monophosphatase  37.65 
 
 
263 aa  124  1e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.940535  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0795  inositol monophosphatase  31.15 
 
 
402 aa  100  2e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0137  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  28.92 
 
 
278 aa  94.4  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3283  inositol monophosphatase  29.41 
 
 
274 aa  93.2  3e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000172792  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4200  inositol monophosphatase  30.25 
 
 
277 aa  92.4  6e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0701939  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3674  inositol monophosphatase  32.6 
 
 
292 aa  91.3  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3050  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  31.88 
 
 
265 aa  91.3  1e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.213338  normal  0.39699 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3728  inositol monophosphatase  32.6 
 
 
292 aa  91.3  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.275945  normal  0.190022 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2303  inositol monophosphatase  31.49 
 
 
293 aa  89.4  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000171915 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1485  inositol monophosphatase  38.17 
 
 
278 aa  89  8e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.208921  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1985  inositol monophosphatase  28.11 
 
 
290 aa  87  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.838762 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0173  3'-phosphoadenosine 5'-phosphosulfate (PAPS) 3'-phosphatase-like  35.91 
 
 
289 aa  84.7  0.000000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.82997  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1912  inositol monophosphatase  30.39 
 
 
284 aa  84  0.000000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0638  sulfite synthesis pathway protein  28.28 
 
 
261 aa  84  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.162626  normal  0.297476 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13641  CysQ  27.47 
 
 
302 aa  82.8  0.000000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1688  putative inositol monophosphatase family protein  32.26 
 
 
248 aa  82  0.000000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.719108 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03972  3-Phosphoadenosine 5-phosphosulfate (PAPS) 3-phosphatase  27.24 
 
 
281 aa  82  0.000000000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00312866  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2417  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  34.15 
 
 
277 aa  81.3  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.620864  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0157  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  28.69 
 
 
269 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00114057  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2912  protein CysQ  27.04 
 
 
272 aa  80.1  0.00000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0821  inositol monophosphatase  29.33 
 
 
272 aa  79.7  0.00000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.272919 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2419  3(2),5 -bisphosphate nucleotidase  30.33 
 
 
284 aa  79.3  0.00000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0855  inositol monophosphatase  29.33 
 
 
272 aa  79  0.00000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0786662  normal  0.150631 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1501  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  29.13 
 
 
267 aa  78.6  0.00000000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0130  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  28.99 
 
 
270 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.835537 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3171  inositol monophosphatase  32.8 
 
 
258 aa  78.2  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4345  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  27.17 
 
 
270 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0764752  normal  0.270175 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0630  inositol-phosphate phosphatase  30.3 
 
 
268 aa  78.2  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13851  CysQ  26.24 
 
 
300 aa  77  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.490576  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5380  inositol monophosphatase  31.82 
 
 
271 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.297931 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5057  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  33.33 
 
 
287 aa  77.8  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0895  inositol monophosphatase  28.85 
 
 
272 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.632992 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4707  inositol monophosphatase  32.04 
 
 
270 aa  77  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.977346  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0118  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  26.58 
 
 
269 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2288  inositol monophosphatase  30.35 
 
 
265 aa  77  0.0000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.690009  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1347  inositol monophosphatase  32.26 
 
 
271 aa  76.6  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0596677  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0917  inositol monophosphatase  32.12 
 
 
258 aa  76.3  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.018726  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1246  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  25.4 
 
 
273 aa  76.3  0.0000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.757598  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0525  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  34.92 
 
 
273 aa  76.3  0.0000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0646  3(2),5 -bisphosphate nucleotidase  26.12 
 
 
251 aa  76.3  0.0000000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1466  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  30.11 
 
 
271 aa  75.9  0.0000000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2295  cysQ protein  27.71 
 
 
275 aa  75.1  0.000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0569  CysQ protein-like  30.65 
 
 
305 aa  75.1  0.000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.466541  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1058  inositol monophosphatase  28.81 
 
 
281 aa  74.7  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000501091 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2576  inositol monophosphatase  32.12 
 
 
258 aa  75.1  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.635906 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0024  inositol monophosphatase  22.69 
 
 
271 aa  73.9  0.000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1750  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  29.8 
 
 
263 aa  73.9  0.000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.497689  normal  0.0213906 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00612  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  27.47 
 
 
275 aa  74.3  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1795  CysQ protein-like  31.18 
 
 
305 aa  73.9  0.000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1293  CysQ protein-like  23.62 
 
 
298 aa  74.3  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4111  inositol-1(or 4)-monophosphatase  29.73 
 
 
271 aa  73.9  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2343  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  29.46 
 
 
269 aa  74.3  0.000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.847006  normal  0.982736 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4717  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  27.04 
 
 
270 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.957777  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0215  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  30.61 
 
 
265 aa  73.6  0.000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3574  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  29.3 
 
 
265 aa  73.6  0.000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0645111  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2932  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  31.25 
 
 
276 aa  73.6  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1649  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  29.06 
 
 
262 aa  73.6  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0184  cysQ protein  28.17 
 
 
270 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.39498 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0712  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  29.57 
 
 
271 aa  72.8  0.000000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1404  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  29.61 
 
 
266 aa  73.2  0.000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.19036  normal  0.16729 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06011  CysQ  31.02 
 
 
334 aa  73.2  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.224612 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2983  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  28.45 
 
 
272 aa  72.8  0.000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1440  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  25.83 
 
 
262 aa  72.8  0.000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.022159  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001881  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  27.9 
 
 
275 aa  72.4  0.000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2688  inositol monophosphatase  29.57 
 
 
273 aa  72.8  0.000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1853  inositol-1(or 4)-monophosphatase  30.48 
 
 
253 aa  72.4  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0604801  decreased coverage  0.000548461 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2651  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  25.21 
 
 
255 aa  72.4  0.000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0131852  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0063  inositol-phosphate phosphatase  30.26 
 
 
264 aa  72  0.000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.695366  hitchhiker  0.0000489388 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>