More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0063 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009952  Dshi_0063  inositol-phosphate phosphatase  100 
 
 
264 aa  531  1e-150  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.695366  hitchhiker  0.0000489388 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0402  inositol-1(or 4)-monophosphatase  55.86 
 
 
260 aa  293  2e-78  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.126302  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2640  inositol monophosphatase  56.82 
 
 
266 aa  291  7e-78  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.727914  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0917  inositol monophosphatase  55.86 
 
 
258 aa  270  1e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.018726  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3002  inositol-phosphate phosphatase  56.2 
 
 
258 aa  265  4e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.867462  normal  0.136891 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2576  inositol monophosphatase  55.47 
 
 
258 aa  264  1e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.635906 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2688  inositol monophosphatase  49.24 
 
 
273 aa  237  2e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0630  inositol-phosphate phosphatase  41.42 
 
 
268 aa  197  1.0000000000000001e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3283  inositol monophosphatase  43.02 
 
 
274 aa  196  4.0000000000000005e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000172792  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4535  inositol-phosphate phosphatase  44.9 
 
 
261 aa  185  6e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.196766 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3043  inositol monophosphatase  41.94 
 
 
265 aa  177  2e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0192  inositol monophosphatase family protein  42 
 
 
269 aa  174  9e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0435  inositol monophosphatase  44.93 
 
 
264 aa  173  2.9999999999999996e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0212  inositol monophosphatase family protein  42.17 
 
 
254 aa  172  3.9999999999999995e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0486  inositol monophosphatase  39.85 
 
 
269 aa  167  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0479273 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0530  inositol monophosphatase  39.04 
 
 
269 aa  167  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.428745 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4111  inositol-1(or 4)-monophosphatase  39.06 
 
 
271 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0902  inositol monophosphatase family protein  38.1 
 
 
270 aa  160  2e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0422  inositol monophosphatase  40.32 
 
 
272 aa  159  6e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0915  inositol monophosphatase  41.3 
 
 
273 aa  159  6e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.208619 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1347  inositol monophosphatase  38.31 
 
 
271 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0596677  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1485  inositol monophosphatase  41.27 
 
 
278 aa  155  9e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.208921  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0070  inositol monophosphatase  44.24 
 
 
273 aa  154  1e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.207628 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1853  inositol-1(or 4)-monophosphatase  37.96 
 
 
253 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0604801  decreased coverage  0.000548461 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3181  inositol monophosphatase  36.64 
 
 
271 aa  152  5e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.717976  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0821  inositol monophosphatase  41.74 
 
 
272 aa  151  8e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.272919 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0855  inositol monophosphatase  39.18 
 
 
272 aa  151  1e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0786662  normal  0.150631 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0895  inositol monophosphatase  39.18 
 
 
272 aa  150  2e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.632992 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3171  inositol monophosphatase  39.68 
 
 
258 aa  150  3e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0568  inositol monophosphatase  40.38 
 
 
263 aa  150  3e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.437406 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1688  putative inositol monophosphatase family protein  38.11 
 
 
248 aa  149  3e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.719108 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2360  inositol monophosphatase  41.06 
 
 
259 aa  144  1e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4707  inositol monophosphatase  35.25 
 
 
270 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.977346  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0361  inositol monophosphatase  40.35 
 
 
270 aa  143  2e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.186566  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5380  inositol monophosphatase  41.67 
 
 
271 aa  142  7e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.297931 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2559  inositol monophosphatase  37.16 
 
 
275 aa  139  3.9999999999999997e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.38703  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2248  inositol monophosphatase  39.48 
 
 
270 aa  139  6e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.041874  normal  0.100685 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2288  inositol monophosphatase  37.21 
 
 
265 aa  133  3.9999999999999996e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.690009  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3055  inositol-phosphate phosphatase  34.59 
 
 
262 aa  123  2e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00295141  normal  0.1713 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0795  inositol monophosphatase  34.94 
 
 
402 aa  122  5e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1653  inositol monophosphatase family protein  32.96 
 
 
263 aa  122  6e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1205  inositol-phosphate phosphatase  33.46 
 
 
263 aa  121  9.999999999999999e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.7767  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1711  inositol monophosphatase family protein  32.58 
 
 
263 aa  120  1.9999999999999998e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.558759  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3672  extragenic suppressor protein SuhB  32.7 
 
 
266 aa  118  9e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0159  inositol monophosphatase family protein  33.09 
 
 
263 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2747  Inositol-phosphate phosphatase  31.97 
 
 
275 aa  116  3e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.436852  normal  0.572242 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3185  inositol monophosphatase  34.08 
 
 
264 aa  115  7.999999999999999e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.777404  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1007  Inositol-phosphate phosphatase  31.7 
 
 
262 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.129201  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2324  inositol-phosphate phosphatase  36.52 
 
 
261 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4320  inositol-1(or 4)-monophosphatase  31.34 
 
 
262 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.960297  normal  0.946675 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00388  inositol-1-monophosphatase  30.97 
 
 
277 aa  114  2.0000000000000002e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.25186  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0707  inositol monophosphatase  33.83 
 
 
262 aa  114  2.0000000000000002e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2169  inositol monophosphatase family protein  36.52 
 
 
261 aa  113  3e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.214006  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0841  inositol monophosphatase  36.52 
 
 
261 aa  113  3e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.800769  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3537  inositol-1(or 4)-monophosphatase  32.18 
 
 
263 aa  113  3e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2665  inositol-phosphate phosphatase  38.19 
 
 
266 aa  113  3e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.887492  normal  0.378141 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4776  inositol-1(or 4)-monophosphatase  32.18 
 
 
262 aa  112  5e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.409036  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1698  inositol monophosphatase  35.27 
 
 
261 aa  112  5e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.133457  normal  0.97401 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2101  inositol-phosphate phosphatase  33.58 
 
 
267 aa  112  5e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0413503  hitchhiker  0.00162908 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1199  inositol-phosphate phosphatase  33.93 
 
 
264 aa  112  8.000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.339227 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6007  inositol-phosphate phosphatase  34.59 
 
 
264 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00601575 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6932  inositol monophosphatase  33.21 
 
 
263 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.538744 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3728  inositol monophosphatase  32.77 
 
 
292 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.275945  normal  0.190022 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3674  inositol monophosphatase  32.77 
 
 
292 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3553  inositol monophosphatase  33.97 
 
 
266 aa  110  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0078  inositol-phosphate phosphatase  34.09 
 
 
270 aa  110  3e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.105293 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1076  inositol monophosphatase  33.98 
 
 
263 aa  109  5e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0543949  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3711  Inositol-phosphate phosphatase  31.92 
 
 
263 aa  109  5e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0935134 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0601  inositol-phosphate phosphatase  34.32 
 
 
264 aa  109  6e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.406636  normal  0.0239837 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0612  Inositol-phosphate phosphatase  34.32 
 
 
264 aa  109  6e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.169608 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0576  Inositol-phosphate phosphatase  33.95 
 
 
264 aa  108  7.000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.587909  hitchhiker  0.0082747 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3256  Inositol-phosphate phosphatase  33.59 
 
 
266 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0330057  normal  0.162821 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0826  inositol monophosphatase  32.73 
 
 
272 aa  108  9.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.229284 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7280  inositol monophosphatase  33.21 
 
 
264 aa  108  9.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0255139  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1579  inositol-phosphate phosphatase  30.22 
 
 
275 aa  107  1e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0271512  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2609  inositol monophosphatase family protein  33.49 
 
 
270 aa  108  1e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1636  extragenic supressor  30.6 
 
 
275 aa  108  1e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2875  inositol-phosphate phosphatase  30.83 
 
 
267 aa  107  2e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000220191 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2471  inositol monophosphatase  31.43 
 
 
261 aa  107  2e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1378  inositol monophosphatase  31.34 
 
 
256 aa  107  2e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000032162  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0157  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  33.06 
 
 
269 aa  106  3e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00114057  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4474  inositol-1(or 4)-monophosphatase  30.68 
 
 
262 aa  107  3e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2439  inositol-1-monophosphatase  31.82 
 
 
315 aa  106  4e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1308  inositol monophosphatase  31.34 
 
 
256 aa  105  5e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.730975  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0672  inositol-1(or 4)-monophosphatase  32.74 
 
 
273 aa  105  6e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000135062  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0543  inositol-phosphate phosphatase  31.94 
 
 
263 aa  105  6e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3507  inositol-phosphate phosphatase  31.87 
 
 
265 aa  105  8e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.991426  normal  0.0688931 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1028  inositol-1(or 4)-monophosphatase  35.27 
 
 
264 aa  105  8e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.59391 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3216  inositol-phosphate phosphatase  32.02 
 
 
263 aa  104  1e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2588  inositol-phosphate phosphatase  32.58 
 
 
265 aa  104  1e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0024  inositol monophosphatase  27.97 
 
 
271 aa  104  2e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1321  inositol-phosphate phosphatase  29.66 
 
 
262 aa  103  4e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0218475  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1231  myo-inositol-1(or 4)-monophosphatase  31.44 
 
 
263 aa  102  5e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0360912  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2303  inositol monophosphatase  29.37 
 
 
293 aa  102  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000171915 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0854  inositol monophosphatase  29.32 
 
 
262 aa  102  6e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0018  inositol monophosphatase  30.45 
 
 
266 aa  102  6e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000389361  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0802  Inositol-phosphate phosphatase  29.49 
 
 
257 aa  102  7e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2321  inositol monophosphatase  31.23 
 
 
267 aa  101  1e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000655872  normal  0.931835 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2153  inositol-phosphate phosphatase  29.84 
 
 
267 aa  101  1e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.38913  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0813  inositol monophosphatase  29.86 
 
 
268 aa  101  2e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000261138  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>