More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4660 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_4660  inositol monophosphatase  100 
 
 
249 aa  466  9.999999999999999e-131  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.758546  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0913  inositol monophosphatase  61.67 
 
 
259 aa  256  3e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6391  inositol monophosphatase  56.61 
 
 
261 aa  240  1e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.597249  normal  0.139481 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3769  inositol monophosphatase  54.03 
 
 
248 aa  236  3e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0384562  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3980  inositol monophosphatase  55.06 
 
 
263 aa  235  6e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0934  inositol monophosphatase  54.73 
 
 
253 aa  234  9e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0418  3'-phosphoadenosine 5'-phosphosulfate (PAPS) 3'-phosphatase  56.15 
 
 
265 aa  228  5e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1322  inositol monophosphatase  53.94 
 
 
246 aa  228  7e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3343  inositol monophosphatase  54.94 
 
 
244 aa  226  3e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.685113 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4224  inositol monophosphatase  57.02 
 
 
237 aa  225  6e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206669  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1340  inositol monophosphatase  57.14 
 
 
270 aa  225  7e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.758603  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3932  inositol monophosphatase  55.56 
 
 
242 aa  224  1e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.123025 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3917  inositol monophosphatase  55.56 
 
 
242 aa  223  2e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3991  inositol monophosphatase  55.56 
 
 
242 aa  223  2e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3047  inositol monophosphatase  55.33 
 
 
262 aa  221  6e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.365425  normal  0.892025 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3150  inositol monophosphatase  56.75 
 
 
258 aa  221  8e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.956906 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3350  inositol monophosphatase  52.67 
 
 
250 aa  220  1.9999999999999999e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.989567  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18520  3'-phosphoadenosine 5'-phosphosulfate (PAPS) 3'-phosphatase  53.33 
 
 
250 aa  219  3e-56  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.748791  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2273  inositol monophosphatase  63.03 
 
 
248 aa  219  3e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1294  inositol monophosphatase  55.12 
 
 
282 aa  219  3e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3479  inositol monophosphatase  55.3 
 
 
257 aa  210  2e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.647629  normal  0.529394 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3166  inositol monophosphatase  57.08 
 
 
252 aa  209  3e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3154  inositol monophosphatase  57.08 
 
 
252 aa  209  3e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0435159  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1002  inositol monophosphatase  54.58 
 
 
275 aa  209  3e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3216  inositol monophosphatase  57.08 
 
 
252 aa  209  3e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4421  inositol monophosphatase  61.72 
 
 
248 aa  208  6e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8602  inositol monophosphatase family protein  55.69 
 
 
255 aa  203  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5170  inositol monophosphatase  50.55 
 
 
297 aa  203  3e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0144285  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1525  inositol monophosphatase  56.56 
 
 
248 aa  199  3e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.93578 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0736  inositol monophosphatase  53.33 
 
 
277 aa  197  1.0000000000000001e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0207527 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12162  monophosphatase cysQ  54.13 
 
 
267 aa  196  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.309321 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0792  inositol monophosphatase  53.42 
 
 
275 aa  183  2.0000000000000003e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3118  inositol monophosphatase  41.27 
 
 
263 aa  142  6e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.940535  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5057  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  35.68 
 
 
287 aa  87.4  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3050  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  36.19 
 
 
265 aa  82.8  0.000000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.213338  normal  0.39699 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2983  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  34.15 
 
 
272 aa  80.5  0.00000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00612  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  29.87 
 
 
275 aa  80.1  0.00000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001881  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  29 
 
 
275 aa  77.4  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1246  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  32.08 
 
 
273 aa  77  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.757598  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3283  inositol monophosphatase  31.61 
 
 
274 aa  77.4  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000172792  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0817  adenosine-3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  33.01 
 
 
246 aa  76.6  0.0000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0630  inositol-phosphate phosphatase  32.57 
 
 
268 aa  76.3  0.0000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2684  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  31.54 
 
 
268 aa  76.3  0.0000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  unclonable  0.0000412314 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2343  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  34.7 
 
 
269 aa  76.3  0.0000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.847006  normal  0.982736 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3674  inositol monophosphatase  30.92 
 
 
292 aa  75.5  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3728  inositol monophosphatase  30.92 
 
 
292 aa  75.5  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.275945  normal  0.190022 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1485  inositol monophosphatase  36.68 
 
 
278 aa  75.1  0.0000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.208921  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0795  inositol monophosphatase  34.17 
 
 
402 aa  75.1  0.000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0130  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  30.49 
 
 
270 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.835537 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1501  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  34.72 
 
 
267 aa  75.1  0.000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2295  cysQ protein  29 
 
 
275 aa  73.9  0.000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0225  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  31.68 
 
 
269 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.453654  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2791  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  32.28 
 
 
268 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0197504 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1469  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  31.35 
 
 
268 aa  73.2  0.000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2912  protein CysQ  28.88 
 
 
272 aa  73.2  0.000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0118  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  32.84 
 
 
269 aa  73.2  0.000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2576  inositol monophosphatase  32.28 
 
 
258 aa  72.8  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.635906 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1688  putative inositol monophosphatase family protein  34.67 
 
 
248 aa  72.8  0.000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.719108 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1655  cysQ protein  33.33 
 
 
253 aa  72.4  0.000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2878  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  30.71 
 
 
268 aa  72.4  0.000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000434249 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1505  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  30.71 
 
 
268 aa  72.4  0.000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0170  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  33.17 
 
 
270 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0165  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  33.17 
 
 
270 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.462598 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0170  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  33.17 
 
 
270 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0125589  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1474  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  30.56 
 
 
268 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0530  inositol monophosphatase  29.18 
 
 
269 aa  70.5  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.428745 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1912  inositol monophosphatase  29.29 
 
 
284 aa  70.9  0.00000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0157  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  31.68 
 
 
269 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00114057  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4345  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  31.86 
 
 
270 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0764752  normal  0.270175 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1427  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  32.86 
 
 
264 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.839377  normal  0.0817385 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0168  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  32.67 
 
 
270 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4086  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  32.67 
 
 
237 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4200  inositol monophosphatase  30.21 
 
 
277 aa  70.1  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0701939  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2419  3(2),5 -bisphosphate nucleotidase  31.9 
 
 
284 aa  70.5  0.00000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1203  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  35.94 
 
 
256 aa  70.1  0.00000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4717  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  28.35 
 
 
270 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.957777  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4949  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  29.55 
 
 
275 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.19378  hitchhiker  0.0000193333 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2617  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  33.33 
 
 
268 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000408883 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4187  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  32.67 
 
 
270 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0172  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  32.67 
 
 
270 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.126779 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0917  inositol monophosphatase  30.89 
 
 
258 aa  69.7  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.018726  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2932  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  31.1 
 
 
276 aa  69.7  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1404  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  31.63 
 
 
266 aa  70.1  0.00000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.19036  normal  0.16729 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0191  cysQ protein  33.17 
 
 
270 aa  69.7  0.00000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2303  inositol monophosphatase  28.71 
 
 
293 aa  69.3  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000171915 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3548  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  32.67 
 
 
270 aa  69.3  0.00000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5401  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  29.79 
 
 
269 aa  69.3  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1396  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  34.85 
 
 
256 aa  69.3  0.00000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0294905  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0835  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  35.8 
 
 
274 aa  69.3  0.00000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2232  cysQ protein  32.68 
 
 
281 aa  68.9  0.00000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.283489  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1440  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  29.13 
 
 
262 aa  68.9  0.00000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.022159  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0184  cysQ protein  30.95 
 
 
270 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.39498 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1985  inositol monophosphatase  29.89 
 
 
290 aa  67.4  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.838762 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3486  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  33.99 
 
 
280 aa  67.4  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.174381 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1313  inositol-1(or 4)-monophosphatase  36.02 
 
 
268 aa  66.6  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.528727  normal  0.631294 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0486  inositol monophosphatase  28.45 
 
 
269 aa  67  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0479273 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2640  inositol monophosphatase  28.7 
 
 
266 aa  67  0.0000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.727914  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0638  sulfite synthesis pathway protein  29.44 
 
 
261 aa  67  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.162626  normal  0.297476 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2373  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  33.77 
 
 
274 aa  66.6  0.0000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000809688 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16661  CysQ  25 
 
 
304 aa  66.6  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.385799  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>