More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1313 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1313  inositol-1(or 4)-monophosphatase  100 
 
 		 268 aa  510  1e-144  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.528727  normal  0.631294 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5201  inositol-phosphate phosphatase  71.23 
 
 		 304 aa  362  3e-99  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.289429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1625  Inositol-phosphate phosphatase  53.96 
 
 		 274 aa  275  7e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.206509 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1441  inositol-phosphate phosphatase  57.98 
 
 		 270 aa  258  9e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00213419 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2300  inositol monophosphatase  57.03 
 
 		 284 aa  257  2e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.273761 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6775  inositol-1(or 4)-monophosphatase  57.25 
 
 		 264 aa  256  3e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1943  inositol-1(or 4)-monophosphatase  55.85 
 
 		 266 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1692  inositol monophosphatase  57.2 
 
 		 269 aa  238  9e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00145341  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1866  inositol monophosphatase  54.92 
 
 		 272 aa  233  2.0000000000000002e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.609869  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4971  inositol monophosphatase  50.58 
 
 		 268 aa  226  4e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1476  inositol-phosphate phosphatase  56.54 
 
 		 269 aa  225  6e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.331156  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1934  Inositol-phosphate phosphatase  50.94 
 
 		 277 aa  219  5e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0503138 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2887  inositol monophosphatase  54.69 
 
 		 270 aa  218  1e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.778817  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2912  inositol-phosphate phosphatase  50.97 
 
 		 292 aa  214  9.999999999999999e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0545674  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16090  inositol monophosphatase/fructose-1,6-bisphosphatase family protein  49.61 
 
 		 283 aa  212  3.9999999999999995e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.155381  normal  0.152082 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1700  inositol monophosphatase  53.08 
 
 		 288 aa  211  1e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0133893  normal  0.297038 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1405  inositol-phosphate phosphatase  56.89 
 
 		 282 aa  208  7e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24310  inositol monophosphatase/fructose-1,6-bisphosphatase family protein  50.18 
 
 		 275 aa  202  4e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.117243 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1925  Inositol-phosphate phosphatase  50 
 
 		 302 aa  192  3e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0922188  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15810  inositol monophosphatase/fructose-1,6-bisphosphatase family protein  46.29 
 
 		 347 aa  192  4e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.125857  normal  0.0787941 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1553  Inositol-phosphate phosphatase  52.79 
 
 		 293 aa  191  8e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.269312  normal  0.180184 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1412  Inositol-phosphate phosphatase  45.64 
 
 		 293 aa  187  2e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.881002 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1511  Inositol-phosphate phosphatase  48.44 
 
 		 266 aa  185  8e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4057  inositol monophosphatase  47.14 
 
 		 268 aa  184  1.0000000000000001e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0345704  normal  0.72801 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1880  inositol monophosphatase  45.56 
 
 		 287 aa  183  2.0000000000000003e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2247  inositol monophosphatase  51.31 
 
 		 304 aa  179  5.999999999999999e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.76091  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0128  inositol monophosphatase  48.02 
 
 		 258 aa  169  4e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3030  inositol monophosphatase  39.3 
 
 		 268 aa  166  2.9999999999999998e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0983926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2908  inositol monophosphatase  41.18 
 
 		 267 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000930444  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0644  Inositol-phosphate phosphatase  48.73 
 
 		 273 aa  166  5e-40  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02425  inositol monophosphatase  40.72 
 
 		 267 aa  164  9e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.648235  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1135  Inositol-phosphate phosphatase  40.72 
 
 		 267 aa  164  9e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.915199  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02389  hypothetical protein  40.72 
 
 		 267 aa  164  9e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.516636  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2685  inositol monophosphatase  40.72 
 
 		 267 aa  164  9e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000252767  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2818  inositol monophosphatase  40.72 
 
 		 267 aa  164  9e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000612182  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2686  inositol monophosphatase  40.72 
 
 		 267 aa  164  9e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.10987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3765  inositol monophosphatase  40.72 
 
 		 267 aa  164  9e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0228752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1144  inositol monophosphatase  40.72 
 
 		 267 aa  164  9e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.221581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3258  inositol-1-monophosphatase  38.94 
 
 		 272 aa  164  9e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.506114  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2808  inositol monophosphatase  40.27 
 
 		 267 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0630411  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2921  inositol monophosphatase  40.27 
 
 		 267 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0208321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2701  inositol monophosphatase  40.27 
 
 		 267 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000859824  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2787  inositol monophosphatase  39.82 
 
 		 267 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0013173  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1824  inositol-1(or 4)-monophosphatase  43.75 
 
 		 283 aa  163  3e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0421706  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2746  inositol monophosphatase  39.37 
 
 		 267 aa  160  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.139672  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1101  inositol monophosphatase  40.72 
 
 		 267 aa  160  2e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0220453  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1241  inositol monophosphatase  37.6 
 
 		 267 aa  160  2e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.921359  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0438  inositol monophosphatase  38.91 
 
 		 267 aa  159  5e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0450003  hitchhiker  0.0000301386 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1165  inositol monophosphatase  38.91 
 
 		 267 aa  159  5e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000142854  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1273  inositol monophosphatase  38.91 
 
 		 267 aa  159  5e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000425107  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3630  inositol monophosphatase  36.29 
 
 		 267 aa  159  6e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0471893  normal  0.858784 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1076  inositol monophosphatase  38.85 
 
 		 263 aa  158  1e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0543949  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3937  inositol-phosphate phosphatase  46.55 
 
 		 299 aa  157  1e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.517909  normal  0.719209 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0345  Inositol-phosphate phosphatase  45.92 
 
 		 288 aa  157  1e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0160878 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1219  Inositol-phosphate phosphatase  38.5 
 
 		 256 aa  157  2e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3034  inositol monophosphatase  38.22 
 
 		 267 aa  157  2e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.251178  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0278  inositol-1(or 4)-monophosphatase  38.87 
 
 		 268 aa  157  2e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2463  inositol-phosphate phosphatase  44.53 
 
 		 302 aa  157  2e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.678422 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0854  inositol monophosphatase  37.21 
 
 		 262 aa  155  6e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0984  Inositol-phosphate phosphatase  36.58 
 
 		 284 aa  154  2e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.594779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0274  inositol monophosphate family protein  37.1 
 
 		 288 aa  154  2e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.578849  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3679  inositol-phosphate phosphatase  41.44 
 
 		 240 aa  153  2.9999999999999998e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6008  inositol monophosphatase  42.46 
 
 		 303 aa  152  4e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2754  inositol monophosphatase  36.68 
 
 		 267 aa  152  4e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00416326  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3316  inositol monophosphatase  39.61 
 
 		 262 aa  152  4e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.546431 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12716  extragenic suppressor protein suhB  49.2 
 
 		 290 aa  152  4e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.459276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004363  myo-inositol-1(or 4)-monophosphatase  37.1 
 
 		 267 aa  152  5e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000312516  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1028  inositol monophosphatase  37.12 
 
 		 269 aa  152  5.9999999999999996e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00157763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1289  extragenic suppressor protein SuhB  40.09 
 
 		 267 aa  151  1e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.077456  normal  0.0155379 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3566  inositol monophosphatase  36.26 
 
 		 353 aa  150  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1321  inositol-phosphate phosphatase  35.02 
 
 		 262 aa  150  2e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0218475  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0333  inositol-phosphate phosphatase  38.24 
 
 		 267 aa  150  3e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.366405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3781  inositol-phosphate phosphatase  36.8 
 
 		 270 aa  149  5e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.987521 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3707  Inositol-phosphate phosphatase  39.83 
 
 		 272 aa  149  6e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000252692  hitchhiker  0.000000465281 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1028  inositol-1(or 4)-monophosphatase  39.82 
 
 		 264 aa  148  8e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.59391 
 
 
-
 
NC_004310  BR1711  inositol monophosphatase family protein  36.68 
 
 		 263 aa  148  1.0000000000000001e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.558759  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1244  inositol-phosphate phosphatase  38.62 
 
 		 266 aa  148  1.0000000000000001e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1534  inositol monophosphatase  43.78 
 
 		 258 aa  147  2.0000000000000003e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0685889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2892  inositol-1(or 4)-monophosphatase  33.97 
 
 		 300 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1510  inositol monophosphatase  39.41 
 
 		 266 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1653  inositol monophosphatase family protein  36.68 
 
 		 263 aa  147  2.0000000000000003e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2186  inositol monophosphatase  35.34 
 
 		 259 aa  146  3e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2665  inositol-phosphate phosphatase  40.72 
 
 		 266 aa  146  3e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.887492  normal  0.378141 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01052  hypothetical protein  35.75 
 
 		 267 aa  147  3e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3501  inositol monophosphatase  36.8 
 
 		 274 aa  146  3e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.04424  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1681  inositol monophosphatase  36.29 
 
 		 268 aa  146  4.0000000000000006e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2841  inositol-1(or 4)-monophosphatase  35.09 
 
 		 330 aa  145  5e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.202978  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2282  inositol monophosphatase  36.78 
 
 		 266 aa  145  5e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.476526  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0018  inositol monophosphatase  39.57 
 
 		 266 aa  145  5e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000389361  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2706  inositol monophosphatase  42.13 
 
 		 266 aa  145  8.000000000000001e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000310915 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3672  extragenic suppressor protein SuhB  39.74 
 
 		 266 aa  145  9e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1545  inositol-1(or 4)-monophosphatase  43.84 
 
 		 259 aa  145  9e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1128  inositol-1-monophosphatase  35.75 
 
 		 267 aa  144  1e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.768163  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1205  inositol-phosphate phosphatase  36.86 
 
 		 263 aa  144  1e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.7767  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4776  inositol-1(or 4)-monophosphatase  37.93 
 
 		 262 aa  144  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.409036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0672  inositol-1(or 4)-monophosphatase  35.16 
 
 		 273 aa  144  2e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000135062  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4320  inositol-1(or 4)-monophosphatase  38.2 
 
 		 262 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.960297  normal  0.946675 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1343  Inositol-phosphate phosphatase  43.22 
 
 		 269 aa  144  2e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000231696 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2588  inositol-phosphate phosphatase  38.67 
 
 		 265 aa  143  3e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1407  inositol monophosphatase  40.6 
 
 		 263 aa  143  3e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.805923  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>