More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4224 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_4224  inositol monophosphatase  100 
 
 
237 aa  461  1e-129  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206669  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6391  inositol monophosphatase  82.7 
 
 
261 aa  370  1e-101  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.597249  normal  0.139481 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3980  inositol monophosphatase  56.73 
 
 
263 aa  258  5.0000000000000005e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3343  inositol monophosphatase  59.23 
 
 
244 aa  258  8e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.685113 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1340  inositol monophosphatase  58.68 
 
 
270 aa  251  8.000000000000001e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.758603  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18520  3'-phosphoadenosine 5'-phosphosulfate (PAPS) 3'-phosphatase  58.51 
 
 
250 aa  248  7e-65  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.748791  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0913  inositol monophosphatase  58.9 
 
 
259 aa  246  2e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3769  inositol monophosphatase  55.46 
 
 
248 aa  245  4e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0384562  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3932  inositol monophosphatase  58.92 
 
 
242 aa  240  2e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.123025 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3917  inositol monophosphatase  58.92 
 
 
242 aa  239  4e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3991  inositol monophosphatase  58.92 
 
 
242 aa  239  4e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0418  3'-phosphoadenosine 5'-phosphosulfate (PAPS) 3'-phosphatase  55.51 
 
 
265 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0934  inositol monophosphatase  54.51 
 
 
253 aa  233  3e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12162  monophosphatase cysQ  56.49 
 
 
267 aa  229  2e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.309321 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4421  inositol monophosphatase  57.44 
 
 
248 aa  229  4e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1294  inositol monophosphatase  55.1 
 
 
282 aa  226  3e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5170  inositol monophosphatase  52.99 
 
 
297 aa  226  4e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0144285  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1525  inositol monophosphatase  60.28 
 
 
248 aa  223  2e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.93578 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3047  inositol monophosphatase  54.7 
 
 
262 aa  221  8e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.365425  normal  0.892025 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1322  inositol monophosphatase  51.87 
 
 
246 aa  217  1e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2273  inositol monophosphatase  57.79 
 
 
248 aa  216  2e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3479  inositol monophosphatase  52.7 
 
 
257 aa  216  2e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.647629  normal  0.529394 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3166  inositol monophosphatase  56.68 
 
 
252 aa  211  7e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3154  inositol monophosphatase  56.68 
 
 
252 aa  211  7e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0435159  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3216  inositol monophosphatase  56.68 
 
 
252 aa  211  7e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3150  inositol monophosphatase  53.63 
 
 
258 aa  211  1e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.956906 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0736  inositol monophosphatase  52.26 
 
 
277 aa  211  1e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0207527 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3350  inositol monophosphatase  51.65 
 
 
250 aa  210  1e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.989567  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8602  inositol monophosphatase family protein  54.62 
 
 
255 aa  209  2e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0792  inositol monophosphatase  54.51 
 
 
275 aa  205  6e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1002  inositol monophosphatase  52.49 
 
 
275 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4660  inositol monophosphatase  63.78 
 
 
249 aa  186  4e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.758546  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3118  inositol monophosphatase  42.15 
 
 
263 aa  137  1e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.940535  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0225  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  36.5 
 
 
269 aa  97.8  1e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.453654  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0795  inositol monophosphatase  37.26 
 
 
402 aa  97.1  2e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1485  inositol monophosphatase  38.46 
 
 
278 aa  97.1  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.208921  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5057  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  33.47 
 
 
287 aa  91.3  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4200  inositol monophosphatase  33.17 
 
 
277 aa  89.7  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0701939  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3079  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  30.74 
 
 
267 aa  89  6e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.955512  normal  0.146512 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2912  protein CysQ  30.64 
 
 
272 aa  88.6  7e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00612  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  30.04 
 
 
275 aa  87.8  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2295  cysQ protein  31.36 
 
 
275 aa  87.4  2e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001881  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  29.18 
 
 
275 aa  85.9  5e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3050  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  35.55 
 
 
265 aa  85.5  7e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.213338  normal  0.39699 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1688  putative inositol monophosphatase family protein  35 
 
 
248 aa  84.3  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.719108 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1853  inositol-1(or 4)-monophosphatase  35.03 
 
 
253 aa  84  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0604801  decreased coverage  0.000548461 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0118  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  29.61 
 
 
269 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1347  inositol monophosphatase  32.61 
 
 
271 aa  83.2  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0596677  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3728  inositol monophosphatase  33.17 
 
 
292 aa  82.8  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.275945  normal  0.190022 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3674  inositol monophosphatase  33.17 
 
 
292 aa  82.8  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4111  inositol-1(or 4)-monophosphatase  31.76 
 
 
271 aa  82.8  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0184  cysQ protein  29.22 
 
 
270 aa  82.8  0.000000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.39498 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2983  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  32.92 
 
 
272 aa  81.3  0.00000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1501  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  31.46 
 
 
267 aa  81.3  0.00000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1246  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  27.62 
 
 
273 aa  80.9  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.757598  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2640  inositol monophosphatase  30.45 
 
 
266 aa  80.9  0.00000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.727914  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2343  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  34.86 
 
 
269 aa  80.9  0.00000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.847006  normal  0.982736 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0170  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  31.2 
 
 
270 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0125589  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03972  3-Phosphoadenosine 5-phosphosulfate (PAPS) 3-phosphatase  26.58 
 
 
281 aa  80.1  0.00000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00312866  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0361  inositol monophosphatase  33.77 
 
 
270 aa  80.1  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.186566  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3181  inositol monophosphatase  34.16 
 
 
271 aa  80.1  0.00000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.717976  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0170  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  31.2 
 
 
270 aa  80.1  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0165  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  31.2 
 
 
270 aa  80.1  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.462598 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0157  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  29.74 
 
 
269 aa  79.7  0.00000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00114057  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0130  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  32.84 
 
 
270 aa  79.7  0.00000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.835537 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3171  inositol monophosphatase  34.39 
 
 
258 aa  79.7  0.00000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1203  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  35.68 
 
 
256 aa  79  0.00000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01649  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  28.81 
 
 
266 aa  78.6  0.00000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.643804  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4187  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  31.62 
 
 
270 aa  79  0.00000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0191  cysQ protein  32.05 
 
 
270 aa  79  0.00000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0024  inositol monophosphatase  27.27 
 
 
271 aa  79  0.00000000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0172  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  31.62 
 
 
270 aa  78.6  0.00000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.126779 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0215  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  26.32 
 
 
265 aa  78.6  0.00000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0123  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  35.94 
 
 
257 aa  78.6  0.00000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0168  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  31.62 
 
 
270 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0630  inositol-phosphate phosphatase  29.69 
 
 
268 aa  78.2  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2373  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  33.79 
 
 
274 aa  78.2  0.0000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000809688 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0855  inositol monophosphatase  33.48 
 
 
272 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0786662  normal  0.150631 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0137  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  25.4 
 
 
278 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0140  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  30.92 
 
 
266 aa  76.6  0.0000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0895  inositol monophosphatase  33.04 
 
 
272 aa  75.9  0.0000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.632992 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16661  CysQ  29.19 
 
 
304 aa  75.9  0.0000000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.385799  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4086  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  33.33 
 
 
237 aa  75.5  0.0000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2303  inositol monophosphatase  31.32 
 
 
293 aa  75.9  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000171915 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3283  inositol monophosphatase  30.62 
 
 
274 aa  75.5  0.0000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000172792  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0811  3'-phosphoadenosine-5'-phosphosulfate (PAPS) 3'-phosphatase  29.19 
 
 
304 aa  75.5  0.0000000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.989913  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3548  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  31.2 
 
 
270 aa  75.5  0.0000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13641  CysQ  27.19 
 
 
302 aa  74.7  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4707  inositol monophosphatase  31.79 
 
 
270 aa  74.3  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.977346  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1058  inositol monophosphatase  30.3 
 
 
281 aa  74.7  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000501091 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0638  sulfite synthesis pathway protein  29.91 
 
 
261 aa  74.7  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.162626  normal  0.297476 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13931  CysQ-like protein  27.14 
 
 
300 aa  74.3  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.886822  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4345  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  30.77 
 
 
270 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0764752  normal  0.270175 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1396  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  33.75 
 
 
256 aa  73.6  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0294905  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2932  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  29.48 
 
 
276 aa  73.9  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0159  sulfite synthesis pathway protein  30.19 
 
 
272 aa  73.9  0.000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2559  inositol monophosphatase  34.2 
 
 
275 aa  73.6  0.000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.38703  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0821  inositol monophosphatase  33.02 
 
 
272 aa  73.6  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.272919 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0835  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  33 
 
 
274 aa  73.6  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2688  inositol monophosphatase  33.8 
 
 
273 aa  73.6  0.000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>