More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_1347 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011004  Rpal_1347  inositol monophosphatase  100 
 
 
271 aa  542  1e-153  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0596677  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4111  inositol-1(or 4)-monophosphatase  78.2 
 
 
271 aa  420  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1853  inositol-1(or 4)-monophosphatase  80 
 
 
253 aa  403  1e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0604801  decreased coverage  0.000548461 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4707  inositol monophosphatase  74.53 
 
 
270 aa  388  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.977346  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3181  inositol monophosphatase  65.56 
 
 
271 aa  336  2.9999999999999997e-91  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.717976  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1688  putative inositol monophosphatase family protein  68.67 
 
 
248 aa  332  3e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.719108 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2559  inositol monophosphatase  67.73 
 
 
275 aa  324  8.000000000000001e-88  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.38703  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1485  inositol monophosphatase  53.5 
 
 
278 aa  243  1.9999999999999999e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.208921  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0855  inositol monophosphatase  50.78 
 
 
272 aa  236  2e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0786662  normal  0.150631 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0895  inositol monophosphatase  50.39 
 
 
272 aa  235  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.632992 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0821  inositol monophosphatase  48.83 
 
 
272 aa  228  1e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.272919 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0361  inositol monophosphatase  48.03 
 
 
270 aa  217  1e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.186566  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0630  inositol-phosphate phosphatase  47.15 
 
 
268 aa  213  1.9999999999999998e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2248  inositol monophosphatase  48.03 
 
 
270 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.041874  normal  0.100685 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5380  inositol monophosphatase  45.63 
 
 
271 aa  208  9e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.297931 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0915  inositol monophosphatase  43.36 
 
 
273 aa  186  3e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.208619 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0070  inositol monophosphatase  44.31 
 
 
273 aa  183  3e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.207628 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0530  inositol monophosphatase  41.5 
 
 
269 aa  181  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.428745 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0422  inositol monophosphatase  44.35 
 
 
272 aa  179  4.999999999999999e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0902  inositol monophosphatase family protein  41.63 
 
 
270 aa  177  2e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3043  inositol monophosphatase  40.08 
 
 
265 aa  176  3e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0435  inositol monophosphatase  41.27 
 
 
264 aa  175  6e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0192  inositol monophosphatase family protein  39.29 
 
 
269 aa  170  2e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0486  inositol monophosphatase  40.16 
 
 
269 aa  169  6e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0479273 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4535  inositol-phosphate phosphatase  40.48 
 
 
261 aa  166  2.9999999999999998e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.196766 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0212  inositol monophosphatase family protein  39.92 
 
 
254 aa  164  1.0000000000000001e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0063  inositol-phosphate phosphatase  38.31 
 
 
264 aa  155  5.0000000000000005e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.695366  hitchhiker  0.0000489388 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3283  inositol monophosphatase  36.24 
 
 
274 aa  149  4e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000172792  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2640  inositol monophosphatase  34.35 
 
 
266 aa  142  4e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.727914  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2576  inositol monophosphatase  38.17 
 
 
258 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.635906 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0917  inositol monophosphatase  37.76 
 
 
258 aa  137  1e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.018726  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3171  inositol monophosphatase  36.48 
 
 
258 aa  137  2e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2360  inositol monophosphatase  41.86 
 
 
259 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0568  inositol monophosphatase  37.7 
 
 
263 aa  135  7.000000000000001e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.437406 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0402  inositol-1(or 4)-monophosphatase  33.07 
 
 
260 aa  132  6e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.126302  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2688  inositol monophosphatase  35.56 
 
 
273 aa  129  5.0000000000000004e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3002  inositol-phosphate phosphatase  35.02 
 
 
258 aa  128  8.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.867462  normal  0.136891 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2288  inositol monophosphatase  35.89 
 
 
265 aa  124  1e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.690009  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0024  inositol monophosphatase  32.03 
 
 
271 aa  122  5e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00612  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  33.47 
 
 
275 aa  115  6e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2303  inositol monophosphatase  31.14 
 
 
293 aa  115  7.999999999999999e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000171915 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001881  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  32.63 
 
 
275 aa  113  4.0000000000000004e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0795  inositol monophosphatase  35.96 
 
 
402 aa  113  4.0000000000000004e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0186  inositol-phosphate phosphatase  33.63 
 
 
257 aa  112  9e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0137  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  27.53 
 
 
278 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1912  inositol monophosphatase  30.47 
 
 
284 aa  111  1.0000000000000001e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0898  Inositol-phosphate phosphatase  28.57 
 
 
265 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000281614  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2912  protein CysQ  32.23 
 
 
272 aa  109  6e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2747  Inositol-phosphate phosphatase  34.53 
 
 
275 aa  109  6e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.436852  normal  0.572242 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03972  3-Phosphoadenosine 5-phosphosulfate (PAPS) 3-phosphatase  29.72 
 
 
281 aa  108  8.000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00312866  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2932  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  32.96 
 
 
276 aa  108  1e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01351  inositol-1-monophosphatase  32.34 
 
 
255 aa  108  1e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.104947  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1199  inositol-phosphate phosphatase  33.48 
 
 
264 aa  107  2e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.339227 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0646  3(2),5 -bisphosphate nucleotidase  29.15 
 
 
251 aa  106  3e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2419  3(2),5 -bisphosphate nucleotidase  32.38 
 
 
284 aa  106  4e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0811  3'-phosphoadenosine-5'-phosphosulfate (PAPS) 3'-phosphatase  29.75 
 
 
304 aa  105  6e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.989913  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1985  inositol monophosphatase  29.05 
 
 
290 aa  105  6e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.838762 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2983  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  33.19 
 
 
272 aa  105  7e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00388  inositol-1-monophosphatase  34.95 
 
 
277 aa  105  7e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.25186  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16661  CysQ  29.39 
 
 
304 aa  105  8e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.385799  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0712  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  29.39 
 
 
271 aa  105  8e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0184  cysQ protein  28.77 
 
 
270 aa  105  9e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.39498 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0130  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  32.24 
 
 
270 aa  105  1e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.835537 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2295  cysQ protein  30.24 
 
 
275 aa  105  1e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3079  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  32.52 
 
 
267 aa  105  1e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.955512  normal  0.146512 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0225  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  30.05 
 
 
269 aa  104  1e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.453654  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1636  extragenic supressor  31.03 
 
 
275 aa  104  1e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1698  inositol monophosphatase  34.43 
 
 
261 aa  105  1e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.133457  normal  0.97401 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0274  inositol monophosphate family protein  31.38 
 
 
288 aa  104  1e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.578849  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0118  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  28.39 
 
 
269 aa  105  1e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1579  inositol-phosphate phosphatase  31.03 
 
 
275 aa  104  2e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0271512  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3501  inositol monophosphatase  35.66 
 
 
274 aa  103  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.04424  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0173  3'-phosphoadenosine 5'-phosphosulfate (PAPS) 3'-phosphatase-like  28.35 
 
 
289 aa  103  3e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.82997  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0191  cysQ protein  30.84 
 
 
270 aa  103  4e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1466  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  28.98 
 
 
271 aa  103  4e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1232  inositol-1(or 4)-monophosphatase  33.04 
 
 
259 aa  103  4e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.223718  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2471  inositol monophosphatase  30.35 
 
 
261 aa  103  4e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02425  inositol monophosphatase  31.15 
 
 
267 aa  102  6e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.648235  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1135  Inositol-phosphate phosphatase  31.15 
 
 
267 aa  102  6e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.915199  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02389  hypothetical protein  31.15 
 
 
267 aa  102  6e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.516636  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2686  inositol monophosphatase  31.15 
 
 
267 aa  102  6e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.10987  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2685  inositol monophosphatase  31.15 
 
 
267 aa  102  6e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000252767  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1144  inositol monophosphatase  31.15 
 
 
267 aa  102  6e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.221581  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2818  inositol monophosphatase  31.15 
 
 
267 aa  102  6e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000612182  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0170  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  29.91 
 
 
270 aa  102  6e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0125589  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3765  inositol monophosphatase  31.15 
 
 
267 aa  102  6e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0228752  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1058  inositol monophosphatase  28.21 
 
 
281 aa  102  7e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000501091 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2908  inositol monophosphatase  31.71 
 
 
267 aa  102  7e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000930444  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0170  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  29.91 
 
 
270 aa  102  7e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004363  myo-inositol-1(or 4)-monophosphatase  31.5 
 
 
267 aa  102  8e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000312516  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2921  inositol monophosphatase  30.74 
 
 
267 aa  102  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0208321  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2428  inositol monophosphatase  33.18 
 
 
267 aa  102  8e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.857801  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2787  inositol monophosphatase  30.74 
 
 
267 aa  102  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0013173  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2701  inositol monophosphatase  30.74 
 
 
267 aa  102  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000859824  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2808  inositol monophosphatase  30.74 
 
 
267 aa  102  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0630411  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1454  inositol monophosphatase  35 
 
 
267 aa  102  9e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00259546  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0165  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  29.91 
 
 
270 aa  102  9e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.462598 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0841  inositol monophosphatase  34.96 
 
 
261 aa  102  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.800769  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13641  CysQ  26.14 
 
 
302 aa  101  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2324  inositol-phosphate phosphatase  34.96 
 
 
261 aa  101  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>