More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3486 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_3486  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  100 
 
 
280 aa  553  1e-156  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.174381 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2172  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  53.44 
 
 
269 aa  234  1.0000000000000001e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.244558  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2449  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  45.59 
 
 
271 aa  222  4.9999999999999996e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1396  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  53.66 
 
 
256 aa  209  4e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0294905  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1020  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  47.83 
 
 
288 aa  207  1e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.560522  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0202  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  47.21 
 
 
281 aa  206  2e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0835  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  52.94 
 
 
274 aa  204  2e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0187  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  48.69 
 
 
281 aa  200  3e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0623186  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6561  CysQ protein  46.51 
 
 
278 aa  199  3e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.708852 
 
 
-
 
NC_004310  BR0195  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  48.12 
 
 
266 aa  197  1.0000000000000001e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.158922  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3073  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  45.56 
 
 
265 aa  196  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3329  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  45.56 
 
 
265 aa  194  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.908736  normal  0.550753 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0518  inositol monophosphatase  44.03 
 
 
272 aa  193  2e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.757769 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4249  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  47.08 
 
 
278 aa  192  7e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.697748 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0013  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  45.64 
 
 
265 aa  189  4e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0129118  normal  0.641907 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2398  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  46.06 
 
 
258 aa  189  5e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.011841 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3520  exopolysaccharide production protein PssB  45 
 
 
260 aa  188  7e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1161  3'-phosphadenosine 5'-phosphosulfate 3'-phosphatase  48.62 
 
 
264 aa  186  4e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.89318  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2822  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  48.62 
 
 
264 aa  186  4e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.89166  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2300  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  46.72 
 
 
265 aa  186  4e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.237358  normal  0.187754 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2753  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  44.23 
 
 
264 aa  186  5e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.983862  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1621  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  45.65 
 
 
283 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00452912 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3574  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  43.7 
 
 
265 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0645111  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4561  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  43.53 
 
 
279 aa  182  6e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0215  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  44.32 
 
 
265 aa  182  8.000000000000001e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0638  sulfite synthesis pathway protein  43.36 
 
 
261 aa  178  9e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.162626  normal  0.297476 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4841  inositol monophosphatase  46.88 
 
 
278 aa  172  5e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13512  normal  0.0435582 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1501  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  41.09 
 
 
267 aa  172  5.999999999999999e-42  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3378  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  44.78 
 
 
291 aa  171  1e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1689  inositol monophosphatase  46.12 
 
 
278 aa  171  2e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.005759  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2932  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  45.19 
 
 
276 aa  170  2e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3050  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  48.58 
 
 
265 aa  170  3e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.213338  normal  0.39699 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0445  3(2),5 -bisphosphate nucleotidase  47.56 
 
 
260 aa  167  2e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.382332  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0525  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  43.14 
 
 
273 aa  166  4e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1203  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  46.31 
 
 
256 aa  166  4e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2983  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  42.35 
 
 
272 aa  166  5e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3079  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  42.07 
 
 
267 aa  165  6.9999999999999995e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.955512  normal  0.146512 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2419  3(2),5 -bisphosphate nucleotidase  40.56 
 
 
284 aa  165  9e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1716  inositol monophosphatase  40.91 
 
 
317 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5057  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  45.71 
 
 
287 aa  164  2.0000000000000002e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1815  inositol monophosphatase  47.31 
 
 
275 aa  163  3e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0817  adenosine-3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  39.17 
 
 
246 aa  162  4.0000000000000004e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1246  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  40.49 
 
 
273 aa  161  1e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.757598  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1807  inositol monophosphatase  40.44 
 
 
307 aa  159  3e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.198058 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1527  inositol monophosphatase  40.44 
 
 
307 aa  159  3e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0623274 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2587  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  42.04 
 
 
285 aa  158  9e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2973  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  42.04 
 
 
278 aa  158  9e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2617  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  42.62 
 
 
268 aa  158  1e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000408883 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0099  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  39.53 
 
 
258 aa  158  1e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.58993  normal  0.140317 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3622  thioredoxin  38.74 
 
 
271 aa  157  2e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.359858 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2684  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  42.8 
 
 
268 aa  157  2e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  unclonable  0.0000412314 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2791  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  42.39 
 
 
268 aa  157  2e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0197504 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1898  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  41.92 
 
 
265 aa  157  2e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00288837  normal  0.0251034 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1404  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  40 
 
 
266 aa  157  3e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.19036  normal  0.16729 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1655  cysQ protein  43.15 
 
 
253 aa  154  1e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1474  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  38.37 
 
 
268 aa  154  1e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1469  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  39.27 
 
 
268 aa  154  2e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2878  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  38.37 
 
 
268 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000434249 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1505  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  38.37 
 
 
268 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2232  cysQ protein  39.52 
 
 
281 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.283489  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2417  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  42.23 
 
 
277 aa  152  7e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.620864  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1649  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  38.02 
 
 
262 aa  152  7e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0140  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  39.76 
 
 
266 aa  150  2e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0361  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  41.38 
 
 
272 aa  150  2e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01649  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  40.78 
 
 
266 aa  149  3e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.643804  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0123  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  41.82 
 
 
257 aa  149  5e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3680  inositol monophosphatase  42.47 
 
 
278 aa  149  7e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.129491  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0646  3(2),5 -bisphosphate nucleotidase  34.55 
 
 
251 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1370  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  39.09 
 
 
273 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.616067  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0712  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  37.64 
 
 
271 aa  147  2.0000000000000003e-34  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3922  inositol monophosphatase  44.02 
 
 
278 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  hitchhiker  0.00186914  normal  0.766393 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05500  3(2),5-bisphosphate nucleotidase  41.89 
 
 
274 aa  147  2.0000000000000003e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0489757  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2373  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  41.7 
 
 
274 aa  147  2.0000000000000003e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000809688 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0159  sulfite synthesis pathway protein  39.37 
 
 
272 aa  147  2.0000000000000003e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1466  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  37.74 
 
 
271 aa  147  3e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2032  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  38.58 
 
 
283 aa  146  3e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000246736  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13123  CysQ protein  36.84 
 
 
268 aa  145  5e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.124683  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5915  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  41.99 
 
 
270 aa  145  5e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3775  adenosine-3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  40.55 
 
 
246 aa  146  5e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3957  adenosine-3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  40.55 
 
 
246 aa  146  5e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0276  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  40.8 
 
 
272 aa  146  5e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0137  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  37.35 
 
 
278 aa  145  5e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68370  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  42.86 
 
 
273 aa  146  5e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00165193  normal  0.391986 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3630  adenosine-3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  40.55 
 
 
246 aa  146  5e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2651  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  39.84 
 
 
255 aa  145  7.0000000000000006e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0131852  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1440  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  41.28 
 
 
262 aa  145  9e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.022159  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5401  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  40.82 
 
 
269 aa  144  1e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0394  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  40.43 
 
 
272 aa  144  1e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.861992  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0784  adenosine-3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  38.89 
 
 
246 aa  144  1e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.186913  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0285  3(2),5 -bisphosphate nucleotidase  39.54 
 
 
275 aa  144  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.736808  normal  0.186068 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1750  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  42.26 
 
 
263 aa  144  2e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.497689  normal  0.0213906 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2611  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  40.96 
 
 
271 aa  144  2e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0261  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  42.02 
 
 
266 aa  142  5e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.014346 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1427  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  39.75 
 
 
264 aa  142  7e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.839377  normal  0.0817385 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0020  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  37.98 
 
 
286 aa  142  8e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0134954  normal  0.230148 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4940  3(2),5 -bisphosphate nucleotidase  38.85 
 
 
280 aa  141  9e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1215  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  39.1 
 
 
265 aa  141  9.999999999999999e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2343  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  42.47 
 
 
269 aa  141  9.999999999999999e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.847006  normal  0.982736 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2058  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  41.78 
 
 
274 aa  141  9.999999999999999e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0393  adenosine-3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  39.68 
 
 
246 aa  141  9.999999999999999e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.856173  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>