More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0422 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_0422  inositol monophosphatase  100 
 
 		 272 aa  545  1e-154  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0486  inositol monophosphatase  57.09 
 
 		 269 aa  291  1e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0479273 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0530  inositol monophosphatase  56.3 
 
 		 269 aa  288  6e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.428745 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0902  inositol monophosphatase family protein  60.31 
 
 		 270 aa  282  4.0000000000000003e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3043  inositol monophosphatase  49.6 
 
 		 265 aa  228  9e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0192  inositol monophosphatase family protein  48.26 
 
 		 269 aa  224  1e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0212  inositol monophosphatase family protein  48.03 
 
 		 254 aa  218  6e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0435  inositol monophosphatase  49.03 
 
 		 264 aa  216  5e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1853  inositol-1(or 4)-monophosphatase  47.06 
 
 		 253 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0604801  decreased coverage  0.000548461 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0630  inositol-phosphate phosphatase  44.8 
 
 		 268 aa  197  2.0000000000000003e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4111  inositol-1(or 4)-monophosphatase  44.81 
 
 		 271 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3181  inositol monophosphatase  43.21 
 
 		 271 aa  189  2.9999999999999997e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.717976  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0070  inositol monophosphatase  45.53 
 
 		 273 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.207628 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1347  inositol monophosphatase  46.32 
 
 		 271 aa  183  3e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0596677  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1688  putative inositol monophosphatase family protein  42.28 
 
 		 248 aa  181  8.000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.719108 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0917  inositol monophosphatase  43.27 
 
 		 258 aa  178  1e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.018726  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4707  inositol monophosphatase  40.32 
 
 		 270 aa  176  3e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.977346  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2559  inositol monophosphatase  43.98 
 
 		 275 aa  176  5e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.38703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0895  inositol monophosphatase  43.1 
 
 		 272 aa  175  6e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.632992 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0855  inositol monophosphatase  42.74 
 
 		 272 aa  175  6e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0786662  normal  0.150631 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2576  inositol monophosphatase  44.13 
 
 		 258 aa  175  7e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.635906 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0821  inositol monophosphatase  43.48 
 
 		 272 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.272919 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0915  inositol monophosphatase  42.26 
 
 		 273 aa  170  3e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.208619 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4535  inositol-phosphate phosphatase  42.02 
 
 		 261 aa  169  6e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.196766 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2248  inositol monophosphatase  41.87 
 
 		 270 aa  169  7e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.041874  normal  0.100685 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0063  inositol-phosphate phosphatase  43.39 
 
 		 264 aa  167  2e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.695366  hitchhiker  0.0000489388 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3002  inositol-phosphate phosphatase  42.49 
 
 		 258 aa  166  4e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.867462  normal  0.136891 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5380  inositol monophosphatase  41.2 
 
 		 271 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.297931 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0361  inositol monophosphatase  41.56 
 
 		 270 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.186566  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2640  inositol monophosphatase  39.67 
 
 		 266 aa  161  9e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.727914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1485  inositol monophosphatase  43.2 
 
 		 278 aa  159  4e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.208921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0402  inositol-1(or 4)-monophosphatase  39.08 
 
 		 260 aa  157  2e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.126302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3283  inositol monophosphatase  37.92 
 
 		 274 aa  157  2e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000172792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2688  inositol monophosphatase  41.2 
 
 		 273 aa  154  2e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0568  inositol monophosphatase  38.8 
 
 		 263 aa  133  3e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.437406 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2288  inositol monophosphatase  37.17 
 
 		 265 aa  125  7e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.690009  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3171  inositol monophosphatase  38.03 
 
 		 258 aa  121  9.999999999999999e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2360  inositol monophosphatase  38.3 
 
 		 259 aa  115  6.9999999999999995e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0795  inositol monophosphatase  33.05 
 
 		 402 aa  108  9.000000000000001e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0646  3(2),5 -bisphosphate nucleotidase  30.25 
 
 		 251 aa  106  4e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3118  inositol-phosphate phosphatase  34.65 
 
 		 262 aa  102  5e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2950  histidinol-phosphate phosphatase, putative, inositol monophosphatase  31.42 
 
 		 261 aa  102  8e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1698  inositol monophosphatase  32.58 
 
 		 261 aa  101  1e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.133457  normal  0.97401 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0948  histidinol-phosphate phosphatase  33.59 
 
 		 256 aa  100  3e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.50509  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1141  histidinol-phosphate phosphatase, putative, inositol monophosphatase  31.42 
 
 		 275 aa  99.4  6e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2303  inositol monophosphatase  27.27 
 
 		 293 aa  99  7e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000171915 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0191  cysQ protein  31.8 
 
 		 270 aa  99  8e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03972  3-Phosphoadenosine 5-phosphosulfate (PAPS) 3-phosphatase  29.88 
 
 		 281 aa  98.6  9e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00312866  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0130  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  30 
 
 		 270 aa  98.2  1e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.835537 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0973  histidinol-phosphate phosphatase  30.43 
 
 		 260 aa  97.4  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0782489  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2753  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  31.71 
 
 		 264 aa  97.1  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.983862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4187  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  32.5 
 
 		 270 aa  96.7  3e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0170  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  31.91 
 
 		 270 aa  96.7  3e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0125589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3548  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  32.5 
 
 		 270 aa  97.1  3e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0172  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  32.5 
 
 		 270 aa  96.7  4e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.126779 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0170  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  32.34 
 
 		 270 aa  96.7  4e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0168  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  32.5 
 
 		 270 aa  96.3  5e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4358  histidinol-phosphate phosphatase, putative, inositol monophosphatase  30.7 
 
 		 260 aa  96.3  5e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.0029628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0165  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  31.91 
 
 		 270 aa  96.3  5e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.462598 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2598  inositol monophosphatase  28.32 
 
 		 309 aa  95.9  7e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.624255  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0118  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  30.35 
 
 		 269 aa  95.9  7e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0425  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  31.36 
 
 		 273 aa  95.5  9e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3079  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  32.41 
 
 		 267 aa  95.5  9e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.955512  normal  0.146512 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1758  Inositol-phosphate phosphatase  31.44 
 
 		 273 aa  95.1  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0897515  normal  0.0157082 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4517  histidinol-phosphate phosphatase, putative, inositol monophosphatase  30.87 
 
 		 260 aa  95.1  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.158706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3821  inositol monophosphatase  28.94 
 
 		 593 aa  95.1  1e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0303328  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2983  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  30.29 
 
 		 272 aa  94  2e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0099  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  32.02 
 
 		 258 aa  94.4  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.58993  normal  0.140317 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3728  inositol monophosphatase  29.34 
 
 		 292 aa  94.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.275945  normal  0.190022 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1161  3'-phosphadenosine 5'-phosphosulfate 3'-phosphatase  32.11 
 
 		 264 aa  94.4  2e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.89318  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3674  inositol monophosphatase  29.34 
 
 		 292 aa  94.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2822  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  32.11 
 
 		 264 aa  94.4  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.89166  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0295  inositol monophosphatase  32.82 
 
 		 487 aa  94.4  2e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.24616  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1205  inositol-phosphate phosphatase  30.74 
 
 		 263 aa  94.4  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.7767  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1199  inositol-phosphate phosphatase  31.25 
 
 		 264 aa  94.4  2e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.339227 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1058  inositol monophosphatase  30.3 
 
 		 281 aa  94  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000501091 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3994  inositol monophosphatase  29.26 
 
 		 257 aa  93.6  3e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000574883 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4086  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  34.13 
 
 		 237 aa  93.6  3e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0018  inositol monophosphatase  29.2 
 
 		 266 aa  93.6  3e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000389361  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0717  inositol monophosphatase family protein  31.72 
 
 		 266 aa  93.2  4e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2169  inositol monophosphatase family protein  31.25 
 
 		 261 aa  93.2  4e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.214006  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2058  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  32.38 
 
 		 274 aa  93.2  4e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0215  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  30.77 
 
 		 265 aa  93.2  4e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0841  inositol monophosphatase  31.25 
 
 		 261 aa  93.2  4e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.800769  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0078  inositol-phosphate phosphatase  33.62 
 
 		 270 aa  93.2  4e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.105293 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0024  inositol monophosphatase  27.55 
 
 		 271 aa  93.2  4e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0345  Inositol-phosphate phosphatase  32.58 
 
 		 288 aa  92.8  6e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0160878 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0673  inositol monophosphatase family protein  31.72 
 
 		 266 aa  92.8  6e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1389  putative inositol monophosphatase family protein  30.22 
 
 		 261 aa  92.4  8e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.000213319  normal  0.368987 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0563  Inositol-phosphate phosphatase  31.84 
 
 		 257 aa  92  9e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0965012 
 
 
-
 
NC_004310  BR1711  inositol monophosphatase family protein  32.14 
 
 		 263 aa  92  1e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.558759  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1850  CysQ  29.31 
 
 		 254 aa  91.3  2e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0157  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  28.87 
 
 		 269 aa  90.9  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00114057  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1653  inositol monophosphatase family protein  32.14 
 
 		 263 aa  91.3  2e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2060  inositol-1(or 4)-monophosphatase  31.88 
 
 		 282 aa  91.3  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.855853 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1220  histidinol-phosphate phosphatase  35.94 
 
 		 278 aa  90.9  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.427245  normal  0.220917 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0140  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  30.98 
 
 		 266 aa  90.9  2e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01649  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  31.5 
 
 		 266 aa  90.5  3e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.643804  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0179  3(2),5-bisphosphate nucleotidase  30.2 
 
 		 260 aa  90.5  3e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00838731  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2324  inositol-phosphate phosphatase  31.25 
 
 		 261 aa  90.1  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>