More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_2407 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_0164  DEAD/DEAH box helicase domain protein  80.5 
 
 
436 aa  735    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2407  DEAD/DEAH box helicase domain protein  100 
 
 
435 aa  888    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.74616  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3013  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  69.04 
 
 
436 aa  578  1e-164  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.183569  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4366  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  65.14 
 
 
436 aa  566  1e-160  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000110703  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4187  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  64.68 
 
 
436 aa  565  1e-160  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000302843  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4025  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  64.68 
 
 
436 aa  565  1e-160  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000188608  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4035  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  64.68 
 
 
436 aa  565  1e-160  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000492575  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4419  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  64.91 
 
 
436 aa  565  1e-160  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000144636  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4509  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  64.68 
 
 
436 aa  565  1e-160  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000163692  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4307  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  64.68 
 
 
436 aa  565  1e-160  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.163670000000001e-32 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4403  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  64.68 
 
 
436 aa  565  1e-160  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000107871  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0833  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  64.45 
 
 
436 aa  563  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000594889  hitchhiker  0.0000000000789178 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4138  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  68.97 
 
 
436 aa  553  1e-156  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000176231  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0462  superfamily II DNA/RNA helicase  49.88 
 
 
446 aa  444  1e-123  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1124  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  47.13 
 
 
448 aa  427  1e-118  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.0000682714  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0532  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  49.87 
 
 
457 aa  419  1e-116  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000013881  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1664  superfamily II DNA/RNA helicase  52.84 
 
 
447 aa  421  1e-116  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1650  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  46.62 
 
 
448 aa  417  9.999999999999999e-116  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0163968  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1616  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  46.62 
 
 
448 aa  417  9.999999999999999e-116  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.309346  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0289  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  51.29 
 
 
447 aa  412  1e-114  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1584  superfamily II DNA/RNA helicase  46 
 
 
454 aa  408  1e-113  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1285  superfamily II DNA/RNA helicase  46.48 
 
 
454 aa  378  1e-103  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl273  ATP-dependent RNA helicase  42.33 
 
 
460 aa  348  1e-94  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00339655  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0420  superfamily II DNA/RNA helicase  40.69 
 
 
464 aa  340  2e-92  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0500  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  38.71 
 
 
453 aa  311  2e-83  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0107165  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1921  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.58 
 
 
532 aa  299  7e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000118371  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0686  ATP-dependent RNA helicase  38 
 
 
445 aa  297  2e-79  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1643  superfamily II DNA/RNA helicase  41.5 
 
 
521 aa  296  3e-79  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000605464  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3104  DEAD/DEAH box helicase domain protein  42.78 
 
 
539 aa  295  1e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000955018  normal  0.89853 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2301  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  41.57 
 
 
450 aa  291  2e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2475  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  41.57 
 
 
450 aa  291  2e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2509  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  41.01 
 
 
447 aa  290  3e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000655646  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2571  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  41.85 
 
 
454 aa  290  4e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.108731  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2269  ATP-dependent RNA helicase  41.29 
 
 
450 aa  290  5.0000000000000004e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2223  ATP-dependent RNA helicase  41.29 
 
 
450 aa  289  7e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2496  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  41.29 
 
 
450 aa  289  7e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0244  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.83 
 
 
498 aa  288  1e-76  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0681922  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0981  DEAD/DEAH box helicase domain protein  40.83 
 
 
405 aa  287  2e-76  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00015169  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0371  hypothetical protein  40.23 
 
 
656 aa  287  2e-76  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2284  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.74 
 
 
450 aa  287  2.9999999999999996e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000706088  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0234  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.44 
 
 
511 aa  286  4e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2900  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  40.73 
 
 
450 aa  286  5e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000426255  normal  0.0366346 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2430  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  40.73 
 
 
458 aa  286  5e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0454  superfamily II DNA/RNA helicase  39.55 
 
 
528 aa  286  5e-76  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5063  DEAD/DEAH box helicase  39.44 
 
 
529 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0206  DEAD/DEAH box helicase domain protein  40.28 
 
 
466 aa  283  4.0000000000000003e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00471201  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4969  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.72 
 
 
584 aa  283  5.000000000000001e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.465149  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0262  DEAD/DEAH box helicase  39.17 
 
 
533 aa  283  6.000000000000001e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0233  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  39.17 
 
 
528 aa  283  6.000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.714358  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0219  DEAD/DEAH box helicase  39.17 
 
 
528 aa  283  6.000000000000001e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0221  DEAD/DEAH box helicase  39.17 
 
 
528 aa  283  6.000000000000001e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.983114  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0247  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  39.17 
 
 
528 aa  283  6.000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0259  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  39.17 
 
 
528 aa  283  6.000000000000001e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0267  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  39.17 
 
 
525 aa  282  7.000000000000001e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0281  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  39.17 
 
 
525 aa  282  7.000000000000001e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0225  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.61 
 
 
538 aa  282  1e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0037  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.55 
 
 
460 aa  282  1e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1087  DEAD/DEAH box helicase domain protein  40 
 
 
467 aa  281  2e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0265  superfamily II DNA/RNA helicase  39 
 
 
485 aa  281  2e-74  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0396  superfamily II DNA/RNA helicase  39.83 
 
 
551 aa  279  7e-74  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0777  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  38.72 
 
 
528 aa  278  1e-73  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1526  superfamily II DNA/RNA helicase  38.16 
 
 
527 aa  277  3e-73  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05480  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.94 
 
 
527 aa  275  1.0000000000000001e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000471221  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3093  DEAD/DEAH box helicase domain protein  41.49 
 
 
581 aa  273  3e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0434047 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2292  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.16 
 
 
482 aa  272  7e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.229861  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3818  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.57 
 
 
527 aa  272  1e-71  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00215503  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0642  DEAD/DEAH box helicase-like  41 
 
 
513 aa  271  1e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.770015  normal  0.292104 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3324  DEAD/DEAH box helicase domain protein  40.76 
 
 
446 aa  271  1e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1472  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.83 
 
 
541 aa  271  1e-71  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.000000440496  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1760  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.23 
 
 
527 aa  272  1e-71  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4475  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.17 
 
 
457 aa  270  2.9999999999999997e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2488  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.26 
 
 
565 aa  269  5.9999999999999995e-71  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000211561  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0649  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.11 
 
 
532 aa  269  8e-71  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3118  DEAD/DEAH box helicase domain protein  40 
 
 
530 aa  268  2e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0202  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.95 
 
 
590 aa  267  2e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.940477  normal  0.073291 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1452  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.29 
 
 
546 aa  265  1e-69  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.661924  normal  0.15207 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0152  DEAD/DEAH box helicase-like  39.42 
 
 
572 aa  265  1e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2125  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.23 
 
 
583 aa  265  1e-69  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1792  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.04 
 
 
434 aa  265  1e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.145423  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0456  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.29 
 
 
546 aa  264  2e-69  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.441946  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2125  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.66 
 
 
531 aa  264  2e-69  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0250  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.08 
 
 
643 aa  264  2e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.173354  decreased coverage  0.00154512 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1182  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40 
 
 
541 aa  264  2e-69  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00431867  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1629  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.71 
 
 
538 aa  263  4e-69  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.343673  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0442  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.83 
 
 
513 aa  263  4.999999999999999e-69  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1650  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  38.25 
 
 
528 aa  263  6e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000109109  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1389  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  38.25 
 
 
528 aa  263  6e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.0000000667125  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3732  DEAD/DEAH box helicase-like  38.68 
 
 
495 aa  261  1e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.152324 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0902  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.01 
 
 
474 aa  261  2e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.282889  normal  0.164162 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4337  DEAD/DEAH box helicase domain protein  40.28 
 
 
485 aa  261  2e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.590668 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4277  DEAD/DEAH box helicase domain protein  40.28 
 
 
485 aa  261  2e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0042  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  35.45 
 
 
420 aa  260  3e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1083  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.66 
 
 
536 aa  260  4e-68  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0531  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.26 
 
 
599 aa  259  6e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1897  ATP-dependent RNA helicase  39.03 
 
 
530 aa  259  8e-68  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1688  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  37.43 
 
 
509 aa  258  2e-67  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.279594  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0145  ATP-dependent RNA helicase  37.03 
 
 
579 aa  258  2e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.432053  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0423  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.78 
 
 
550 aa  257  2e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.109819  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2156  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.43 
 
 
506 aa  257  2e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000532471  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2118  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.43 
 
 
506 aa  257  2e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000739492  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>