More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0420 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008530  LGAS_0420  superfamily II DNA/RNA helicase  100 
 
 
464 aa  943    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0532  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  51 
 
 
457 aa  428  1e-118  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000013881  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1584  superfamily II DNA/RNA helicase  46.7 
 
 
454 aa  410  1e-113  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1285  superfamily II DNA/RNA helicase  46.21 
 
 
454 aa  404  1e-111  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0462  superfamily II DNA/RNA helicase  45.35 
 
 
446 aa  390  1e-107  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0289  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  46.95 
 
 
447 aa  384  1e-105  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1664  superfamily II DNA/RNA helicase  44.92 
 
 
447 aa  366  1e-100  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2407  DEAD/DEAH box helicase domain protein  40.37 
 
 
435 aa  360  2e-98  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.74616  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0164  DEAD/DEAH box helicase domain protein  40.65 
 
 
436 aa  335  1e-90  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1124  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  39.96 
 
 
448 aa  333  4e-90  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.0000682714  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1650  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.74 
 
 
448 aa  329  8e-89  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0163968  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1616  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.74 
 
 
448 aa  329  8e-89  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.309346  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3013  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.1 
 
 
436 aa  322  7e-87  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.183569  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4403  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  41.55 
 
 
436 aa  306  4.0000000000000004e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000107871  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0833  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  41.55 
 
 
436 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000594889  hitchhiker  0.0000000000789178 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4138  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.82 
 
 
436 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000176231  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4366  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  41.29 
 
 
436 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000110703  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4187  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  41.55 
 
 
436 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000302843  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4025  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  41.55 
 
 
436 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000188608  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4035  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  41.55 
 
 
436 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000492575  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4509  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  41.55 
 
 
436 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000163692  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4419  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  41.29 
 
 
436 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000144636  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4307  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  41.55 
 
 
436 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.163670000000001e-32 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl273  ATP-dependent RNA helicase  34.29 
 
 
460 aa  270  2.9999999999999997e-71  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00339655  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0500  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  35.31 
 
 
453 aa  258  2e-67  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0107165  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0234  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.53 
 
 
511 aa  257  4e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0686  ATP-dependent RNA helicase  36.64 
 
 
445 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1760  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.64 
 
 
527 aa  253  5.000000000000001e-66  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0371  hypothetical protein  37.78 
 
 
656 aa  252  1e-65  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5063  DEAD/DEAH box helicase  36.91 
 
 
529 aa  251  2e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0225  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.64 
 
 
538 aa  249  6e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0267  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  36.64 
 
 
525 aa  249  9e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0281  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  36.64 
 
 
525 aa  249  9e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0233  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  36.64 
 
 
528 aa  249  1e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.714358  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0219  DEAD/DEAH box helicase  36.64 
 
 
528 aa  249  1e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0221  DEAD/DEAH box helicase  36.64 
 
 
528 aa  249  1e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.983114  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0262  DEAD/DEAH box helicase  36.64 
 
 
533 aa  249  1e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0247  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  36.64 
 
 
528 aa  249  1e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0259  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  36.64 
 
 
528 aa  249  1e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0206  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.91 
 
 
466 aa  247  3e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00471201  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2292  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.52 
 
 
482 aa  246  6.999999999999999e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.229861  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0037  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.35 
 
 
460 aa  245  9.999999999999999e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1087  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.09 
 
 
467 aa  242  1e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1643  superfamily II DNA/RNA helicase  36.94 
 
 
521 aa  242  1e-62  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000605464  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0152  DEAD/DEAH box helicase-like  36.11 
 
 
572 aa  241  2.9999999999999997e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2301  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  36.81 
 
 
450 aa  240  5e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2475  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  36.81 
 
 
450 aa  240  5e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3324  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.19 
 
 
446 aa  240  5e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2509  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  36.52 
 
 
447 aa  239  6.999999999999999e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000655646  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0456  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.56 
 
 
546 aa  238  1e-61  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.441946  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2269  ATP-dependent RNA helicase  36.52 
 
 
450 aa  239  1e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2223  ATP-dependent RNA helicase  36.52 
 
 
450 aa  238  1e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0442  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.82 
 
 
513 aa  238  1e-61  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05480  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.84 
 
 
527 aa  238  1e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000471221  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2496  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  36.52 
 
 
450 aa  238  1e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0649  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.89 
 
 
532 aa  238  1e-61  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1182  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35 
 
 
541 aa  238  1e-61  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00431867  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2488  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.76 
 
 
565 aa  238  2e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000211561  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0642  DEAD/DEAH box helicase-like  38.74 
 
 
513 aa  238  2e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.770015  normal  0.292104 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1452  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.28 
 
 
546 aa  238  2e-61  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.661924  normal  0.15207 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2571  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  36.23 
 
 
454 aa  238  2e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.108731  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0981  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.84 
 
 
405 aa  237  3e-61  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00015169  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0566  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.44 
 
 
623 aa  237  3e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0265  superfamily II DNA/RNA helicase  35.36 
 
 
485 aa  236  5.0000000000000005e-61  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2284  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.36 
 
 
450 aa  236  6e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000706088  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2430  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  36.07 
 
 
458 aa  236  7e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4969  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.04 
 
 
584 aa  236  9e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.465149  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2900  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  36.18 
 
 
450 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000426255  normal  0.0366346 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3104  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.31 
 
 
539 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000955018  normal  0.89853 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl525  ATP-dependent RNA helicase  35.47 
 
 
666 aa  233  4.0000000000000004e-60  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1526  superfamily II DNA/RNA helicase  36.74 
 
 
527 aa  233  4.0000000000000004e-60  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4029  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.04 
 
 
610 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00643169 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0423  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.36 
 
 
550 aa  233  7.000000000000001e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.109819  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2125  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.1 
 
 
531 aa  232  9e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2294  hypothetical protein  36.07 
 
 
589 aa  232  1e-59  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2267  hypothetical protein  36.07 
 
 
589 aa  232  1e-59  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1897  ATP-dependent RNA helicase  36.34 
 
 
530 aa  231  2e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0454  superfamily II DNA/RNA helicase  36.99 
 
 
528 aa  231  2e-59  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1921  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.48 
 
 
532 aa  231  2e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000118371  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4277  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.46 
 
 
485 aa  229  6e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4337  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.46 
 
 
485 aa  229  6e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.590668 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0777  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  35.91 
 
 
528 aa  229  8e-59  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0015  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.65 
 
 
423 aa  229  9e-59  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3818  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.67 
 
 
527 aa  229  9e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00215503  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1397  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.91 
 
 
533 aa  229  9e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.796672  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0636  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.18 
 
 
605 aa  228  3e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0593463 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4475  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.78 
 
 
457 aa  227  3e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0531  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.25 
 
 
599 aa  227  3e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1688  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  38.4 
 
 
509 aa  227  4e-58  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.279594  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0244  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.23 
 
 
498 aa  227  4e-58  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0681922  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2118  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.04 
 
 
506 aa  226  5.0000000000000005e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000739492  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2156  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.04 
 
 
506 aa  226  5.0000000000000005e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000532471  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1893  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.79 
 
 
581 aa  226  7e-58  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0980839  normal  0.349593 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1629  ATP-dependent RNA helicase DbpA  36.49 
 
 
458 aa  225  1e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.606016  normal  0.220561 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1629  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.14 
 
 
538 aa  225  1e-57  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.343673  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2005  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.38 
 
 
589 aa  225  1e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.343146 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0838  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.8 
 
 
514 aa  224  2e-57  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0202  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.88 
 
 
590 aa  224  3e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.940477  normal  0.073291 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0501  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.08 
 
 
451 aa  223  4e-57  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0396  superfamily II DNA/RNA helicase  36.81 
 
 
551 aa  223  4e-57  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>