More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0532 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_0532  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  100 
 
 
457 aa  937    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000013881  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0462  superfamily II DNA/RNA helicase  54.61 
 
 
446 aa  513  1e-144  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1285  superfamily II DNA/RNA helicase  55.23 
 
 
454 aa  500  1e-140  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1664  superfamily II DNA/RNA helicase  56.43 
 
 
447 aa  498  1e-140  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0289  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  55.98 
 
 
447 aa  495  1e-139  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1584  superfamily II DNA/RNA helicase  54.38 
 
 
454 aa  496  1e-139  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2407  DEAD/DEAH box helicase domain protein  48.97 
 
 
435 aa  434  1e-120  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.74616  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0164  DEAD/DEAH box helicase domain protein  49.66 
 
 
436 aa  430  1e-119  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3013  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  48.75 
 
 
436 aa  408  1e-113  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.183569  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0420  superfamily II DNA/RNA helicase  51.15 
 
 
464 aa  404  1e-111  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4366  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  49.75 
 
 
436 aa  396  1e-109  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000110703  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4419  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  49.25 
 
 
436 aa  392  1e-108  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000144636  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4187  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  49 
 
 
436 aa  391  1e-107  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000302843  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4307  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  49 
 
 
436 aa  391  1e-107  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.163670000000001e-32 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4025  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  49 
 
 
436 aa  391  1e-107  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000188608  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4035  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  49 
 
 
436 aa  391  1e-107  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000492575  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4509  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  49 
 
 
436 aa  391  1e-107  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000163692  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0833  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  49 
 
 
436 aa  390  1e-107  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000594889  hitchhiker  0.0000000000789178 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4403  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  48.75 
 
 
436 aa  390  1e-107  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000107871  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1124  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  43.32 
 
 
448 aa  376  1e-103  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.0000682714  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1616  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.65 
 
 
448 aa  377  1e-103  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.309346  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1650  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.65 
 
 
448 aa  377  1e-103  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0163968  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4138  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  47.01 
 
 
436 aa  377  1e-103  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000176231  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl273  ATP-dependent RNA helicase  37.76 
 
 
460 aa  320  3e-86  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00339655  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0500  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  35.82 
 
 
453 aa  294  2e-78  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0107165  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1643  superfamily II DNA/RNA helicase  39.94 
 
 
521 aa  278  2e-73  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000605464  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0686  ATP-dependent RNA helicase  35.57 
 
 
445 aa  277  3e-73  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0777  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  38.86 
 
 
528 aa  266  7e-70  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1526  superfamily II DNA/RNA helicase  38.29 
 
 
527 aa  265  8.999999999999999e-70  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2509  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  36.59 
 
 
447 aa  263  4.999999999999999e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000655646  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0371  hypothetical protein  38.57 
 
 
656 aa  261  1e-68  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2284  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.31 
 
 
450 aa  261  2e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000706088  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2301  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  36.39 
 
 
450 aa  260  3e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl525  ATP-dependent RNA helicase  39.42 
 
 
666 aa  261  3e-68  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2475  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  36.39 
 
 
450 aa  260  3e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1816  DEAD/DEAH box helicase-like  36.9 
 
 
531 aa  260  3e-68  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2269  ATP-dependent RNA helicase  35.75 
 
 
450 aa  259  7e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2496  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  35.75 
 
 
450 aa  259  8e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2223  ATP-dependent RNA helicase  35.75 
 
 
450 aa  259  9e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2900  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  35.75 
 
 
450 aa  259  9e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000426255  normal  0.0366346 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2488  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.93 
 
 
565 aa  258  1e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000211561  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2430  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  36.03 
 
 
458 aa  258  1e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1921  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36 
 
 
532 aa  258  1e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000118371  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0454  superfamily II DNA/RNA helicase  36.87 
 
 
528 aa  258  1e-67  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0981  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.54 
 
 
405 aa  258  1e-67  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00015169  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2571  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  35.75 
 
 
454 aa  257  3e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.108731  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05480  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.64 
 
 
527 aa  256  5e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000471221  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3340  ATP-dependent RNA helicase DeaD  33.74 
 
 
621 aa  256  7e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0265  superfamily II DNA/RNA helicase  35.75 
 
 
485 aa  255  1.0000000000000001e-66  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3599  ATP-dependent RNA helicase DeaD  33.99 
 
 
655 aa  253  4.0000000000000004e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00604869 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0591  ATP-dependent RNA helicase DeaD  33.66 
 
 
625 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0704  ATP-dependent RNA helicase  36.24 
 
 
601 aa  253  5.000000000000001e-66  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3104  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.64 
 
 
539 aa  253  6e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000955018  normal  0.89853 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0244  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.13 
 
 
498 aa  252  1e-65  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0681922  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1472  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.5 
 
 
541 aa  251  2e-65  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.000000440496  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3324  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.53 
 
 
446 aa  250  3e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0642  DEAD/DEAH box helicase-like  40.24 
 
 
513 aa  251  3e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.770015  normal  0.292104 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3818  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.92 
 
 
527 aa  250  3e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00215503  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1760  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38 
 
 
527 aa  250  4e-65  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3118  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.35 
 
 
530 aa  249  6e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0814  ATP-dependent RNA helicase DeaD  33.17 
 
 
632 aa  249  8e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0212558  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3467  ATP-dependent RNA helicase DeaD  33.25 
 
 
629 aa  248  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3467  ATP-dependent RNA helicase DeaD  33.25 
 
 
629 aa  248  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2292  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.5 
 
 
482 aa  248  1e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.229861  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3573  ATP-dependent RNA helicase DeaD  33.25 
 
 
629 aa  248  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3536  ATP-dependent RNA helicase DeaD  33.25 
 
 
629 aa  248  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3459  ATP-dependent RNA helicase DeaD  33.01 
 
 
624 aa  248  2e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.319039  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03029  ATP-dependent RNA helicase  33.25 
 
 
629 aa  247  3e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0543  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.25 
 
 
629 aa  247  3e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02980  hypothetical protein  33.25 
 
 
629 aa  247  3e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3609  ATP-dependent RNA helicase DeaD  33.25 
 
 
651 aa  247  3e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3354  ATP-dependent RNA helicase DeaD  33.25 
 
 
651 aa  247  3e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3458  ATP-dependent RNA helicase DeaD  33.25 
 
 
629 aa  247  3e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.438364 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3644  ATP-dependent RNA helicase DeaD  33.25 
 
 
651 aa  247  3e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3635  ATP-dependent RNA helicase DeaD  33.25 
 
 
629 aa  247  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4481  ATP-dependent RNA helicase DeaD  33.25 
 
 
629 aa  247  3e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0536  ATP-dependent RNA helicase DeaD  33.25 
 
 
629 aa  247  3e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00419869 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3732  DEAD/DEAH box helicase-like  34.76 
 
 
495 aa  247  4e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.152324 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0250  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.73 
 
 
643 aa  246  4.9999999999999997e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.173354  decreased coverage  0.00154512 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0442  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.37 
 
 
513 aa  246  4.9999999999999997e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0495  ATP-dependent RNA helicase DeaD  32.45 
 
 
653 aa  246  6e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.148315  normal  0.959969 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0267  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  35.29 
 
 
525 aa  246  6.999999999999999e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0233  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  35.29 
 
 
528 aa  246  6.999999999999999e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.714358  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0219  DEAD/DEAH box helicase  35.29 
 
 
528 aa  246  6.999999999999999e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0262  DEAD/DEAH box helicase  35.29 
 
 
533 aa  246  6.999999999999999e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0281  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  35.29 
 
 
525 aa  246  6.999999999999999e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0247  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  35.29 
 
 
528 aa  246  6.999999999999999e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0259  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  35.29 
 
 
528 aa  246  6.999999999999999e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0221  DEAD/DEAH box helicase  35.29 
 
 
528 aa  246  8e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.983114  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3753  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.75 
 
 
908 aa  245  9.999999999999999e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.237591  normal  0.30492 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2294  hypothetical protein  36.8 
 
 
589 aa  245  9.999999999999999e-64  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2267  hypothetical protein  36.8 
 
 
589 aa  245  9.999999999999999e-64  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0152  DEAD/DEAH box helicase-like  37.43 
 
 
572 aa  245  9.999999999999999e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0234  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.4 
 
 
511 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5063  DEAD/DEAH box helicase  35.29 
 
 
529 aa  245  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0225  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.01 
 
 
538 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1087  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.06 
 
 
467 aa  243  3.9999999999999997e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0902  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.06 
 
 
474 aa  243  3.9999999999999997e-63  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.282889  normal  0.164162 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1397  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.5 
 
 
533 aa  243  3.9999999999999997e-63  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.796672  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1365  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.16 
 
 
529 aa  243  5e-63  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>