239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1891 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1891  LemA family protein  100 
 
 		 194 aa  394  1e-109  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04770  hypothetical protein  54.04 
 
 		 199 aa  208  4e-53  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.158149  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4336  LemA family protein  54.08 
 
 		 193 aa  194  6e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.54593 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3704  LemA protein  47.72 
 
 		 192 aa  177  1e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0429675 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1774  LemA family protein  48.69 
 
 		 201 aa  175  4e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.119013  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3602  LemA family protein  47.85 
 
 		 217 aa  167  7e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1403  LemA family protein  46.43 
 
 		 196 aa  166  2e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5847  LemA family protein  47.96 
 
 		 193 aa  164  6.9999999999999995e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.871032 
 
 
-
 
NC_002950  PG0360  hypothetical protein  46.94 
 
 		 196 aa  162  2.0000000000000002e-39  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.193957 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2027  LemA family protein  45.45 
 
 		 195 aa  162  4.0000000000000004e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.90664  normal  0.597952 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1824  LemA family protein  46.03 
 
 		 198 aa  161  6e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0438485  normal  0.915056 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0413  LemA family protein  50.26 
 
 		 198 aa  159  2e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0012  LemA family protein  44.67 
 
 		 212 aa  159  3e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.417656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1298  hypothetical protein  53.37 
 
 		 202 aa  156  1e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0324719  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1477  LemA family protein  53.57 
 
 		 194 aa  154  8e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1794  LemA family protein  44.44 
 
 		 194 aa  152  2e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0347089 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0393  LemA family protein  47.69 
 
 		 217 aa  152  2e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.329178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2020  LemA family protein  44.95 
 
 		 211 aa  151  5e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2297  LemA family protein  44.95 
 
 		 211 aa  151  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0145217 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1371  hypothetical protein  45.03 
 
 		 194 aa  150  1e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000117075  hitchhiker  0.000133503 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2022  LemA family protein  51.16 
 
 		 195 aa  150  1e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.0000000112346  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1982  LemA family protein  45.26 
 
 		 211 aa  148  5e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.400761 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0955  LemA family protein  42.57 
 
 		 202 aa  147  8e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3874  LemA family protein  42.71 
 
 		 211 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.14771 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1256  LemA family protein  48.26 
 
 		 194 aa  145  3e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0145592  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2276  hypothetical protein  47.09 
 
 		 194 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.23375e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2423  LemA family protein  47.67 
 
 		 194 aa  144  1e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.903049  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0924  LemA family protein  50 
 
 		 193 aa  144  1e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.278173 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1221  LemA family protein  42.71 
 
 		 211 aa  142  3e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2032  LemA family protein  47.09 
 
 		 194 aa  141  6e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6372  LemA family protein  43.01 
 
 		 246 aa  141  7e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00757602  normal  0.786314 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0552  LemA family protein  45.93 
 
 		 194 aa  140  9e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000000777562  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1081  LemA family protein  43.75 
 
 		 207 aa  139  3e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.88944  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1822  hypothetical protein  42.42 
 
 		 207 aa  137  7.999999999999999e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0867  hypothetical protein  47.62 
 
 		 194 aa  137  7.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1754  hypothetical protein  42.42 
 
 		 207 aa  137  7.999999999999999e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0916  LemA family protein  47.02 
 
 		 193 aa  137  8.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.440516  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1669  LemA family protein  43.92 
 
 		 208 aa  137  1e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.39054  normal  0.0232057 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0912  LemA family protein  47.02 
 
 		 193 aa  137  1e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0874  LemA family protein  40.82 
 
 		 185 aa  135  3.0000000000000003e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0938199  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1670  LemA family protein  46.63 
 
 		 186 aa  134  6.0000000000000005e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0320592  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3482  LemA family protein  49.38 
 
 		 201 aa  133  1.9999999999999998e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.399994 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4544  LemA family protein  43.17 
 
 		 210 aa  132  3e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.171752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1822  LemA family protein  42.69 
 
 		 200 aa  132  3e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.29832  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1902  hypothetical protein  42.49 
 
 		 206 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.519616 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1229  LemA family protein  49.38 
 
 		 215 aa  131  6e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0161129 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3454  LemA family protein  41.8 
 
 		 197 aa  131  6e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.23113  normal  0.0915562 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0665  hypothetical protein  41.12 
 
 		 200 aa  131  6.999999999999999e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.510927  normal  0.615683 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47030  Conserved hypothetical protein, LemA family  47.93 
 
 		 204 aa  129  2.0000000000000002e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2626  hypothetical protein  40.61 
 
 		 208 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0284  LemA family protein  40.7 
 
 		 222 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0971623  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0311  LemA family protein  41.58 
 
 		 201 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.206877  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0102  hypothetical protein  48.61 
 
 		 210 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.95764  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2519  LemA family protein  46.88 
 
 		 212 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0316  LemA family protein  41.58 
 
 		 201 aa  129  2.0000000000000002e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.529151 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5307  LemA family protein  42.11 
 
 		 207 aa  129  3e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.271744  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1695  LemA family protein  42.11 
 
 		 207 aa  129  3e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.392231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1519  hypothetical protein  40.1 
 
 		 201 aa  128  5.0000000000000004e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.268793 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4853  LemA family protein  48 
 
 		 200 aa  127  8.000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.300038  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3370  LemA family protein  44.07 
 
 		 224 aa  127  9.000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0508  LemA family protein  44.07 
 
 		 224 aa  127  9.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1511  LemA family protein  50.35 
 
 		 204 aa  127  9.000000000000001e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.69896  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3040  LemA family protein  44.07 
 
 		 224 aa  127  9.000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2052  LemA family protein  44.07 
 
 		 224 aa  127  9.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0326  hypothetical protein  44.07 
 
 		 224 aa  127  9.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.458639  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2232  LemA family protein  44.07 
 
 		 224 aa  127  9.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2046  LemA family protein  40 
 
 		 220 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.279862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0313  hypothetical protein  44.07 
 
 		 226 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6198  hypothetical protein  43.92 
 
 		 218 aa  126  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0811  hypothetical protein  47.02 
 
 		 210 aa  126  2.0000000000000002e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0259  LemA family protein  47.33 
 
 		 199 aa  126  2.0000000000000002e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.954507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0331  hypothetical protein  48.61 
 
 		 201 aa  125  3e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.355285 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0991  hypothetical protein  44.91 
 
 		 200 aa  125  3e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.658235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0145  LemA protein  47.68 
 
 		 201 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0551887  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0425  LemA family protein  40 
 
 		 195 aa  125  4.0000000000000003e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0381  LemA family protein  47.92 
 
 		 244 aa  125  5e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1788  LemA family protein  46.01 
 
 		 208 aa  125  5e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000175947  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3956  hypothetical protein  42.62 
 
 		 202 aa  124  6e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.992492  normal  0.709907 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1831  LemA family protein  46.01 
 
 		 187 aa  124  6e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00691191  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3391  LemA family protein  43.5 
 
 		 220 aa  124  9e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.066637  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3226  hypothetical protein  45.12 
 
 		 208 aa  123  1e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.969393  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0415  hypothetical protein  41.62 
 
 		 197 aa  123  2e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.852272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2119  hypothetical protein  47.1 
 
 		 197 aa  122  4e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3714  hypothetical protein  41.05 
 
 		 204 aa  122  4e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.774184  normal  0.302719 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1761  LemA family protein  45.86 
 
 		 204 aa  120  9e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.105862  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0070  LemA family protein  42.07 
 
 		 181 aa  120  9.999999999999999e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0896  LemA family protein  42.42 
 
 		 214 aa  120  9.999999999999999e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.652606  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1190  hypothetical protein  44.64 
 
 		 201 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1333  hypothetical protein  41.53 
 
 		 210 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.58782  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4746  LemA family protein  44.1 
 
 		 214 aa  119  1.9999999999999998e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0585872 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0607  LemA family protein  45.18 
 
 		 208 aa  119  3e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0555  LemA family protein  45.18 
 
 		 208 aa  119  3e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.556411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1074  LemA family protein  42.11 
 
 		 204 aa  117  7e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0283  LemA family protein  38.58 
 
 		 192 aa  117  7.999999999999999e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.646513  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2694  LemA family protein  47.92 
 
 		 203 aa  117  9e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1185  hypothetical protein  39.43 
 
 		 185 aa  117  9.999999999999999e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0911033  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2159  LemA family protein  38.1 
 
 		 197 aa  117  9.999999999999999e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0879  hypothetical protein  37.57 
 
 		 208 aa  116  3e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0238242  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1289  hypothetical protein  39.56 
 
 		 208 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0311306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3402  hypothetical protein  39.47 
 
 		 203 aa  115  3.9999999999999997e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>