68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_1645 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010468  EcolC_1645  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  100 
 
 		 147 aa  305  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000320453 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3257  galactitol-specific phosphotransferase enzyme iia component  64.38 
 
 		 159 aa  201  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000435521  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1144  PTS system galactitol-specific transporter subunit IIA  44.53 
 
 		 148 aa  124  3e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1563  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  39.04 
 
 		 150 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00172388  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3073  PTS system galactitol-specific transporter subunit IIA  39.04 
 
 		 150 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000478831 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0970  PTS system galactitol-specific transporter subunit IIA  39.04 
 
 		 150 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.381164 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1553  PTS system galactitol-specific transporter subunit IIA  39.04 
 
 		 150 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2382  PTS system galactitol-specific transporter subunit IIA  39.04 
 
 		 150 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2230  PTS system galactitol-specific transporter subunit IIA  39.04 
 
 		 150 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.846174  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02020  galactitol-specific enzyme IIA component of PTS  38.36 
 
 		 150 aa  108  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01986  hypothetical protein  38.36 
 
 		 150 aa  108  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1144  PTS system galactitol-specific transporter subunit IIA  38.36 
 
 		 150 aa  107  6e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.199908  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3445  PTS system galactitol-specific transporter subunit IIA  39.85 
 
 		 154 aa  104  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3447  PTS system galactitol-specific transporter subunit IIA  39.85 
 
 		 154 aa  104  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.487344  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3553  PTS system galactitol-specific transporter subunit IIA  39.85 
 
 		 154 aa  104  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3613  PTS system galactitol-specific transporter subunit IIA  39.85 
 
 		 154 aa  104  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.397916  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3516  PTS system galactitol-specific transporter subunit IIA  39.85 
 
 		 154 aa  104  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0319619  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3386  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  30.28 
 
 		 149 aa  67.4  0.00000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000117799  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3717  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  33.02 
 
 		 154 aa  66.6  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0121  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  30 
 
 		 157 aa  65.1  0.0000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0315962  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3554  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  30.43 
 
 		 153 aa  62.8  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1732  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  36.36 
 
 		 155 aa  62.4  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0234  phosphotransferase system galacitol-specific IIA domain-containing protein  27.18 
 
 		 153 aa  59.3  0.00000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3767  PEP-dependent sugar transporting PTS family, IIA component  30.22 
 
 		 157 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0214  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  43.9 
 
 		 153 aa  58.2  0.00000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0154  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  32.26 
 
 		 157 aa  57  0.00000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.882818  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4823  PEP-dependent sugar transporting PTS family, IIA component  28.78 
 
 		 157 aa  56.2  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0037  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  29.41 
 
 		 150 aa  54.7  0.0000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3159  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  30.77 
 
 		 154 aa  53.9  0.0000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4010  putative phosphoenolpyruvate-dependent sugar phosphotransferase system, eiia 2  33.96 
 
 		 157 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3753  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  26.88 
 
 		 150 aa  52.8  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4065  putative PTS system mannitol/fructose-specific transporter subunit IIA  33.96 
 
 		 157 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.405107  normal  0.80579 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4115  putative phosphoenolpyruvate-dependent sugar PTS system eiia 2  33.96 
 
 		 157 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3994  putative phosphotransferase system mannitol/fructose-specific IIA domain  33.96 
 
 		 157 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.489093 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1640  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  27.88 
 
 		 152 aa  52  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.233864  hitchhiker  0.0036959 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03830  phosphotransferase system mannitol/fructose-specifc IIA component (Ntr-type)  32.32 
 
 		 200 aa  51.6  0.000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4395  multi-phosphoryl transfer protein 2  35.71 
 
 		 833 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.963786 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0577  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  29.75 
 
 		 148 aa  48.9  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000200384  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0865  HPr family phosphocarrier protein  34.44 
 
 		 809 aa  48.5  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5408  multi-phosphoryl transfer protein 2  34.69 
 
 		 833 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4516  multiphosphoryl transfer protein 2  34.69 
 
 		 829 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000995524 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03833  fused predicted PTS enzymes: Hpr component/enzyme I component/enzyme IIA component  34.69 
 
 		 833 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03782  hypothetical protein  34.69 
 
 		 833 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4442  multiphosphoryl transfer protein 2  34.69 
 
 		 829 aa  47.8  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.557149 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4038  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase  34.69 
 
 		 833 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4182  multi-phosphoryl transfer protein 2  34.69 
 
 		 833 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4487  multi-phosphoryl transfer protein 2  34.69 
 
 		 833 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4434  multi-phosphoryl transfer protein 2  34.69 
 
 		 833 aa  48.1  0.00004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4068  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase  34.69 
 
 		 833 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3657  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase  33.33 
 
 		 864 aa  47  0.00009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3528  HPr family phosphocarrier protein  33.33 
 
 		 858 aa  47  0.00009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28600  PTS system, fructose subfamily, IIA component  28.72 
 
 		 155 aa  46.6  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0345947  normal  0.0698609 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0823  transcriptional antiterminator, BglG  27.64 
 
 		 652 aa  46.6  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.325703  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0495  phosphotransferase system galacitol-specific IIA domain-containing protein  28.79 
 
 		 166 aa  45.8  0.0002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000311069  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1933  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  29.81 
 
 		 172 aa  45.8  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000195157  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2222  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  25 
 
 		 165 aa  45.1  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.694399 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3262  PTS system mannitol-specific eiicba component  26.21 
 
 		 152 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.71965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0236  phosphoenolpyruvate-dependent sugar phosphotransferase system EIIA 2  30.12 
 
 		 155 aa  43.5  0.0008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0230  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  30.12 
 
 		 155 aa  43.5  0.0008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3023  phosphoenolpyruvate-dependent sugar PTS system, EIIA component  30.48 
 
 		 148 aa  43.5  0.0009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2631  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  30.48 
 
 		 148 aa  43.5  0.0009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.984641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0014  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  33.91 
 
 		 154 aa  43.5  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000106322 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4120  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  30 
 
 		 153 aa  42.7  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.105011  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0300  PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  31.96 
 
 		 164 aa  41.6  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.684561  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3396  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  29.52 
 
 		 150 aa  40.8  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0288  PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  30.17 
 
 		 151 aa  40.8  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.958173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0505  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  33.33 
 
 		 151 aa  40.4  0.007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0750012  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5351  putative fructose-like phosphotransferase system subunit EIIA  27.68 
 
 		 148 aa  40.4  0.009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>