87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_03830 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_03830  phosphotransferase system mannitol/fructose-specifc IIA component (Ntr-type)  100 
 
 		 200 aa  375  1e-103  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0121  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  34.62 
 
 		 157 aa  99.8  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0315962  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4010  putative phosphoenolpyruvate-dependent sugar phosphotransferase system, eiia 2  36.89 
 
 		 157 aa  81.6  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3994  putative phosphotransferase system mannitol/fructose-specific IIA domain  36.89 
 
 		 157 aa  81.3  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.489093 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4065  putative PTS system mannitol/fructose-specific transporter subunit IIA  36.89 
 
 		 157 aa  81.3  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.405107  normal  0.80579 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4115  putative phosphoenolpyruvate-dependent sugar PTS system eiia 2  36.89 
 
 		 157 aa  80.9  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0234  phosphotransferase system galacitol-specific IIA domain-containing protein  31.97 
 
 		 153 aa  78.2  0.00000000000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0236  phosphoenolpyruvate-dependent sugar phosphotransferase system EIIA 2  33.58 
 
 		 155 aa  76.6  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0230  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  33.58 
 
 		 155 aa  76.6  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3554  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  34.13 
 
 		 153 aa  73.9  0.000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3717  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  28.8 
 
 		 154 aa  74.3  0.000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4120  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  34.65 
 
 		 153 aa  73.2  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.105011  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0214  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  33.07 
 
 		 153 aa  72.8  0.000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3159  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  25.38 
 
 		 154 aa  72  0.000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1640  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  31.36 
 
 		 152 aa  72  0.000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.233864  hitchhiker  0.0036959 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2222  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  36.22 
 
 		 165 aa  71.2  0.000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.694399 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3767  PEP-dependent sugar transporting PTS family, IIA component  38.79 
 
 		 157 aa  70.9  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4823  PEP-dependent sugar transporting PTS family, IIA component  38.79 
 
 		 157 aa  71.2  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0154  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  32.81 
 
 		 157 aa  67  0.0000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.882818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3386  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  28 
 
 		 149 aa  65.9  0.0000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000117799  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0037  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  28.46 
 
 		 150 aa  63.2  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1732  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  26.36 
 
 		 155 aa  62.8  0.000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3262  PTS system mannitol-specific eiicba component  29.09 
 
 		 152 aa  61.2  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.71965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3753  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  26.98 
 
 		 150 aa  60.5  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0495  phosphotransferase system galacitol-specific IIA domain-containing protein  32.54 
 
 		 166 aa  59.3  0.00000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000311069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1645  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  33.33 
 
 		 147 aa  55.5  0.0000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000320453 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02293  fused predicted PTS enzymes: Hpr component/enzyme I component/enzyme IIA component  28.77 
 
 		 831 aa  52  0.000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02254  hypothetical protein  28.77 
 
 		 831 aa  52  0.000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1935  PTS system, IIA component, putative  29.03 
 
 		 157 aa  52  0.000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.025117  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2520  multiphosphoryl transfer protein 1  28.77 
 
 		 831 aa  52  0.000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1274  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase  28.77 
 
 		 831 aa  52  0.000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1286  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase  28.77 
 
 		 831 aa  51.2  0.000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.807752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2673  multiphosphoryl transfer protein 1  28.77 
 
 		 831 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3257  galactitol-specific phosphotransferase enzyme iia component  31.86 
 
 		 159 aa  50.1  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000435521  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3615  multiphosphoryl transfer protein 1  28.77 
 
 		 831 aa  49.7  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.629067 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2173  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase  34.11 
 
 		 835 aa  49.3  0.00004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0125  phosphotransferase system galacitol-specific IIA domain-containing protein  25.71 
 
 		 184 aa  48.9  0.00005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00946268  hitchhiker  0.00000000000330151 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2535  multiphosphoryl transfer protein 1  28.08 
 
 		 831 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0090  bifunctional PTS system fructose-specific transporter subunit IIA/HPr protein  29.01 
 
 		 378 aa  47.4  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1408  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  28.47 
 
 		 147 aa  47.8  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.808256  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3447  PTS system galactitol-specific transporter subunit IIA  27.34 
 
 		 154 aa  47.4  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.487344  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3613  PTS system galactitol-specific transporter subunit IIA  27.34 
 
 		 154 aa  47.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.397916  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3445  PTS system galactitol-specific transporter subunit IIA  27.34 
 
 		 154 aa  47.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3516  PTS system galactitol-specific transporter subunit IIA  27.34 
 
 		 154 aa  47.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0319619  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3553  PTS system galactitol-specific transporter subunit IIA  27.34 
 
 		 154 aa  47.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0237  transcriptional antiterminator, BglG  29.69 
 
 		 705 aa  47  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0299  PTS system, fructose subfamily, IIC subunit  39.05 
 
 		 690 aa  46.6  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.843252  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1683  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  33.33 
 
 		 646 aa  45.4  0.0005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05958  bifunctional PTS system fructose-specific transporter subunit IIA/HPr protein  28.24 
 
 		 377 aa  45.1  0.0006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1649  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  26.15 
 
 		 159 aa  44.7  0.0008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2763  bifunctional PTS system fructose-specific transporter subunit IIA/HPr protein  27.69 
 
 		 376 aa  44.7  0.0009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.814587  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3592  PTS system, fructose subfamily, IIC subunit  27.94 
 
 		 637 aa  44.7  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3305  bifunctional PTS system fructose-specific transporter subunit IIA/HPr protein  29.23 
 
 		 376 aa  43.9  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.000000017486  normal  0.0105453 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0065  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  36.52 
 
 		 150 aa  43.5  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.302113  normal  0.357186 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2235  PTS system 2-O-a-mannosyl-D-glycerate specific transporter subunit IIABC  33.91 
 
 		 637 aa  43.9  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0794  bifunctional PTS system fructose-specific transporter subunit IIA/HPr protein  29.23 
 
 		 376 aa  43.9  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000503001  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1489  phosphocarrier, Hpr family  29.23 
 
 		 376 aa  43.9  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000251354  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0359  PTS system, fructose-specific IIABC components  31.2 
 
 		 650 aa  43.9  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2190  phosphoenolpyruvate-dependent sugar phosphotransferase system, EIIA 2  25.55 
 
 		 144 aa  43.9  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2228  phosphoenolpyruvate-dependent sugar phosphotransferase system EIIA 2  25.55 
 
 		 144 aa  43.9  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2316  bifunctional PTS system fructose-specific transporter subunit IIA/HPr protein  29.23 
 
 		 376 aa  43.9  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000000446962  hitchhiker  0.000655033 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2306  bifunctional PTS system fructose-specific transporter subunit IIA/HPr protein  29.23 
 
 		 376 aa  43.1  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  3.61611e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2466  bifunctional PTS system fructose-specific transporter subunit IIA/HPr protein  29.23 
 
 		 376 aa  43.9  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00000000152981  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1479  bifunctional PTS system fructose-specific transporter subunit IIA/HPr protein  29.23 
 
 		 376 aa  43.1  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0000150472  hitchhiker  0.000000341922 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2445  bifunctional PTS system fructose-specific transporter subunit IIA/HPr protein  27.69 
 
 		 376 aa  43.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00042727  normal  0.561664 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02098  fused fructose-specific PTS enzymes: IIA component/HPr component  31.01 
 
 		 376 aa  43.1  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00662904  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3476  PTS fructose-specific enzyme IIBC component  31.43 
 
 		 619 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000542106  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02057  hypothetical protein  31.01 
 
 		 376 aa  43.1  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00882544  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2442  bifunctional PTS system fructose-specific transporter subunit IIA/HPr protein  27.69 
 
 		 376 aa  43.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0123936  hitchhiker  0.00000144465 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2398  bifunctional PTS system fructose-specific transporter subunit IIA/HPr protein  27.69 
 
 		 376 aa  43.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000898637  hitchhiker  0.000336202 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2556  bifunctional PTS system fructose-specific transporter subunit IIA/HPr protein  27.69 
 
 		 376 aa  42.4  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0141828  hitchhiker  0.000185264 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0644  putative PTS system, ascorbate-specific IIA component SgaA  32.94 
 
 		 144 aa  42.4  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2354  bifunctional PTS system fructose-specific transporter subunit IIA/HPr protein  27.69 
 
 		 376 aa  42  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000351173  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1563  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  27.87 
 
 		 150 aa  42  0.006  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00172388  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3073  PTS system galactitol-specific transporter subunit IIA  27.87 
 
 		 150 aa  42  0.006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000478831 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2230  PTS system galactitol-specific transporter subunit IIA  27.87 
 
 		 150 aa  42  0.006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.846174  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2382  PTS system galactitol-specific transporter subunit IIA  27.87 
 
 		 150 aa  42  0.006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1553  PTS system galactitol-specific transporter subunit IIA  27.87 
 
 		 150 aa  42  0.006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28600  PTS system, fructose subfamily, IIA component  33.56 
 
 		 155 aa  42  0.007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0345947  normal  0.0698609 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02020  galactitol-specific enzyme IIA component of PTS  27.87 
 
 		 150 aa  41.6  0.008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0970  PTS system galactitol-specific transporter subunit IIA  27.87 
 
 		 150 aa  41.6  0.008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.381164 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01986  hypothetical protein  27.87 
 
 		 150 aa  41.6  0.008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000771  PTS system IIA component  26.09 
 
 		 147 aa  41.6  0.009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3462  PTS fructose-specific enzyme IIBC component  30.71 
 
 		 619 aa  41.6  0.009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000328489  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3846  PTS system fructose-specific transporter subunit IIABC  30.71 
 
 		 626 aa  41.2  0.01  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000062066  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3563  PTS system fructose-specific transporter subunit IIABC  30.71 
 
 		 622 aa  41.2  0.01  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0301222  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3726  PTS system, fructose-specific IIABC component  30.71 
 
 		 618 aa  41.2  0.01  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2187600000000001e-29 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>