86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0154 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0154  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  100 
 
 		 157 aa  320  3e-87  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.882818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3717  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  32.26 
 
 		 154 aa  87.8  5e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0121  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  33.59 
 
 		 157 aa  84.3  5e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0315962  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1732  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  30.6 
 
 		 155 aa  77.8  0.00000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4120  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  34.25 
 
 		 153 aa  76.6  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.105011  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2222  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  32.28 
 
 		 165 aa  77  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.694399 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3994  putative phosphotransferase system mannitol/fructose-specific IIA domain  33.33 
 
 		 157 aa  68.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.489093 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4065  putative PTS system mannitol/fructose-specific transporter subunit IIA  33.33 
 
 		 157 aa  68.9  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.405107  normal  0.80579 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4010  putative phosphoenolpyruvate-dependent sugar phosphotransferase system, eiia 2  33.33 
 
 		 157 aa  68.9  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4115  putative phosphoenolpyruvate-dependent sugar PTS system eiia 2  33.33 
 
 		 157 aa  68.9  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0234  phosphotransferase system galacitol-specific IIA domain-containing protein  32.5 
 
 		 153 aa  68.9  0.00000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02020  galactitol-specific enzyme IIA component of PTS  29.25 
 
 		 150 aa  65.1  0.0000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2382  PTS system galactitol-specific transporter subunit IIA  29.25 
 
 		 150 aa  65.1  0.0000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2230  PTS system galactitol-specific transporter subunit IIA  29.25 
 
 		 150 aa  65.1  0.0000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.846174  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1553  PTS system galactitol-specific transporter subunit IIA  29.25 
 
 		 150 aa  65.1  0.0000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3073  PTS system galactitol-specific transporter subunit IIA  29.25 
 
 		 150 aa  65.1  0.0000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000478831 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01986  hypothetical protein  29.25 
 
 		 150 aa  65.1  0.0000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3753  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  26.19 
 
 		 150 aa  64.7  0.0000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1563  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  29.25 
 
 		 150 aa  65.1  0.0000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00172388  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03830  phosphotransferase system mannitol/fructose-specifc IIA component (Ntr-type)  33.06 
 
 		 200 aa  64.7  0.0000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0970  PTS system galactitol-specific transporter subunit IIA  29.25 
 
 		 150 aa  64.3  0.0000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.381164 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1144  PTS system galactitol-specific transporter subunit IIA  28.44 
 
 		 148 aa  63.9  0.0000000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3447  PTS system galactitol-specific transporter subunit IIA  28.89 
 
 		 154 aa  63.2  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.487344  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3445  PTS system galactitol-specific transporter subunit IIA  28.89 
 
 		 154 aa  63.2  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3553  PTS system galactitol-specific transporter subunit IIA  28.89 
 
 		 154 aa  63.2  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3613  PTS system galactitol-specific transporter subunit IIA  28.89 
 
 		 154 aa  63.2  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.397916  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3516  PTS system galactitol-specific transporter subunit IIA  28.89 
 
 		 154 aa  63.2  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0319619  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0214  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  33.33 
 
 		 153 aa  62  0.000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3554  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  30.33 
 
 		 153 aa  61.6  0.000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1640  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  33.98 
 
 		 152 aa  60.5  0.000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.233864  hitchhiker  0.0036959 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0037  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  24.8 
 
 		 150 aa  60.5  0.000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1144  PTS system galactitol-specific transporter subunit IIA  28.3 
 
 		 150 aa  59.3  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.199908  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3257  galactitol-specific phosphotransferase enzyme iia component  26.45 
 
 		 159 aa  58.2  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000435521  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1645  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  32.26 
 
 		 147 aa  57  0.00000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000320453 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0359  PTS system, fructose-specific IIABC components  32.82 
 
 		 650 aa  56.6  0.0000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4823  PEP-dependent sugar transporting PTS family, IIA component  27.13 
 
 		 157 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0236  phosphoenolpyruvate-dependent sugar phosphotransferase system EIIA 2  28.97 
 
 		 155 aa  55.5  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0230  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  28.97 
 
 		 155 aa  55.5  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0740  PTS system, fructose subfamily, IIC subunit  32.06 
 
 		 652 aa  54.7  0.0000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3262  PTS system mannitol-specific eiicba component  31.01 
 
 		 152 aa  55.1  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.71965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0724  PTS system, fructose subfamily, IIC subunit  32.06 
 
 		 652 aa  54.7  0.0000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3386  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  22.22 
 
 		 149 aa  54.7  0.0000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000117799  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0383  PTS system, fructose subfamily, IIC subunit  27.15 
 
 		 620 aa  54.7  0.0000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00944668  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3767  PEP-dependent sugar transporting PTS family, IIA component  29.91 
 
 		 157 aa  54.7  0.0000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2394  PTS system, fructose subfamily, IIC subunit  30 
 
 		 618 aa  53.5  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.123557  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1935  PTS system, IIA component, putative  26.4 
 
 		 157 aa  52.8  0.000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.025117  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1968  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  28.81 
 
 		 153 aa  50.8  0.000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00203229  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0640  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  24.67 
 
 		 150 aa  49.7  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.229714  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3159  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  20.17 
 
 		 154 aa  49.3  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2649  PTS system, fructose subfamily, IIC subunit  27.41 
 
 		 623 aa  48.9  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1512  PTS system, fructose subfamily, IIC subunit  27.46 
 
 		 623 aa  48.9  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000350477  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1486  PTS system, fructose-specific IIABC component  31.06 
 
 		 618 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00732656  hitchhiker  0.00389815 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3816  PTS system, fructose-specific IIABC component  31.06 
 
 		 618 aa  48.1  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000120874  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3395  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  29.07 
 
 		 661 aa  47.4  0.00007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3563  PTS system fructose-specific transporter subunit IIABC  30.53 
 
 		 622 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0301222  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3726  PTS system, fructose-specific IIABC component  30.53 
 
 		 618 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2187600000000001e-29 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0577  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  25.17 
 
 		 148 aa  47  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000200384  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3462  PTS fructose-specific enzyme IIBC component  30.53 
 
 		 619 aa  46.6  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000328489  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3744  PTS system, fructose-specific IIABC component  30.3 
 
 		 618 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000405115  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3846  PTS system fructose-specific transporter subunit IIABC  30.53 
 
 		 626 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000062066  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1682  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  23.94 
 
 		 149 aa  46.6  0.0002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3767  PTS system, fructose-specific IIABC component  30.53 
 
 		 619 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000180582  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1033  fusion of IIA, IIB and IIC component of mannitol/fructose-specific phosphotransferase system mannitol/fructose-specific  26.6 
 
 		 634 aa  46.2  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.194757  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1169  transcriptional antiterminator, BglG  31.19 
 
 		 648 aa  45.4  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00649229  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3482  PTS system, fructose subfamily, IIC subunit  30.53 
 
 		 619 aa  45.8  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0610802  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2933  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  26.23 
 
 		 147 aa  45.1  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3476  PTS fructose-specific enzyme IIBC component  30.43 
 
 		 619 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000542106  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0655  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  25.17 
 
 		 645 aa  44.7  0.0005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2872  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  31.48 
 
 		 162 aa  44.3  0.0006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.416555  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4290  putative fructose-like phosphotransferase system subunit EIIA  26.36 
 
 		 148 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.226084 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl181  fructose-specific PTS system IIABC component  29.06 
 
 		 715 aa  44.3  0.0007  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0495  phosphotransferase system galacitol-specific IIA domain-containing protein  27.48 
 
 		 166 aa  43.9  0.0008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000311069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5351  putative fructose-like phosphotransferase system subunit EIIA  25.41 
 
 		 148 aa  43.5  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0125  phosphotransferase system galacitol-specific IIA domain-containing protein  34.21 
 
 		 184 aa  43.9  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00946268  hitchhiker  0.00000000000330151 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03785  predicted enzyme IIA component of PTS  25.41 
 
 		 148 aa  42.7  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03734  hypothetical protein  25.41 
 
 		 148 aa  42.7  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4117  putative fructose-like phosphotransferase system subunit EIIA  25.41 
 
 		 148 aa  42.7  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4430  putative fructose-like phosphotransferase system subunit EIIA  25.41 
 
 		 148 aa  43.1  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4084  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  25.41 
 
 		 148 aa  42.7  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001412  PTS system mannitol-specific IIA component  26.14 
 
 		 147 aa  42  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1346  PTS system, fructose specific IIABC components  25.81 
 
 		 654 aa  41.6  0.004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.249131  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0120  sigma-54 factor interaction domain-containing protein  29.89 
 
 		 977 aa  40.8  0.008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1683  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  25.3 
 
 		 646 aa  40.8  0.008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0148  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  23.97 
 
 		 149 aa  40.4  0.009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000039829  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1170  PTS system, fructose subfamily, IIC subunit  23.74 
 
 		 648 aa  40.4  0.009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0405473  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2579  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  33.33 
 
 		 162 aa  40.4  0.01  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000168856 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>