50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_1553 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_1563  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  100 
 
 		 150 aa  311  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00172388  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3073  PTS system galactitol-specific transporter subunit IIA  100 
 
 		 150 aa  311  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000478831 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2230  PTS system galactitol-specific transporter subunit IIA  100 
 
 		 150 aa  311  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.846174  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2382  PTS system galactitol-specific transporter subunit IIA  100 
 
 		 150 aa  311  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1553  PTS system galactitol-specific transporter subunit IIA  100 
 
 		 150 aa  311  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0970  PTS system galactitol-specific transporter subunit IIA  99.33 
 
 		 150 aa  309  1e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.381164 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01986  hypothetical protein  99.33 
 
 		 150 aa  308  2e-83  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02020  galactitol-specific enzyme IIA component of PTS  99.33 
 
 		 150 aa  308  2e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1144  PTS system galactitol-specific transporter subunit IIA  98.67 
 
 		 150 aa  305  2.0000000000000002e-82  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.199908  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3447  PTS system galactitol-specific transporter subunit IIA  60.67 
 
 		 154 aa  199  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.487344  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3613  PTS system galactitol-specific transporter subunit IIA  60.67 
 
 		 154 aa  198  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.397916  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3445  PTS system galactitol-specific transporter subunit IIA  60.67 
 
 		 154 aa  198  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3553  PTS system galactitol-specific transporter subunit IIA  60.67 
 
 		 154 aa  198  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3516  PTS system galactitol-specific transporter subunit IIA  60.67 
 
 		 154 aa  198  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0319619  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1144  PTS system galactitol-specific transporter subunit IIA  47.22 
 
 		 148 aa  152  2e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3257  galactitol-specific phosphotransferase enzyme iia component  42.55 
 
 		 159 aa  120  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000435521  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1645  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  39.04 
 
 		 147 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000320453 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3386  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  31.93 
 
 		 149 aa  81.6  0.000000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000117799  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1640  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  32.58 
 
 		 152 aa  73.2  0.000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.233864  hitchhiker  0.0036959 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3554  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  32.74 
 
 		 153 aa  72.8  0.000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3753  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  28.1 
 
 		 150 aa  71.6  0.000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3717  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  28.81 
 
 		 154 aa  70.9  0.000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1732  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  32.35 
 
 		 155 aa  65.5  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0154  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  29.25 
 
 		 157 aa  65.1  0.0000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.882818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0234  phosphotransferase system galacitol-specific IIA domain-containing protein  27.64 
 
 		 153 aa  65.5  0.0000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3262  PTS system mannitol-specific eiicba component  30 
 
 		 152 aa  60.5  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.71965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0214  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  25.22 
 
 		 153 aa  55.8  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0121  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  27.48 
 
 		 157 aa  55.5  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0315962  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0037  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  31.31 
 
 		 150 aa  54.3  0.0000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3159  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  22.31 
 
 		 154 aa  52.8  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4115  putative phosphoenolpyruvate-dependent sugar PTS system eiia 2  23.88 
 
 		 157 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4010  putative phosphoenolpyruvate-dependent sugar phosphotransferase system, eiia 2  23.88 
 
 		 157 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4065  putative PTS system mannitol/fructose-specific transporter subunit IIA  23.53 
 
 		 157 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.405107  normal  0.80579 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3994  putative phosphotransferase system mannitol/fructose-specific IIA domain  23.53 
 
 		 157 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.489093 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0186  PTS system, fructose subfamily, IIC subunit  29.17 
 
 		 673 aa  49.7  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0094  PTS system, fructose subfamily, IIC subunit  32.2 
 
 		 656 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.178291 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0823  transcriptional antiterminator, BglG  27.34 
 
 		 652 aa  47  0.00008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.325703  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3767  PEP-dependent sugar transporting PTS family, IIA component  24.59 
 
 		 157 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2217  PTS system, fructose subfamily, IIC subunit  28.69 
 
 		 699 aa  45.4  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00703787  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0236  phosphoenolpyruvate-dependent sugar phosphotransferase system EIIA 2  32.31 
 
 		 155 aa  44.3  0.0006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0230  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  32.31 
 
 		 155 aa  44.3  0.0006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4823  PEP-dependent sugar transporting PTS family, IIA component  23.77 
 
 		 157 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2222  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  25.49 
 
 		 165 aa  43.9  0.0008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.694399 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0495  phosphotransferase system galacitol-specific IIA domain-containing protein  24.83 
 
 		 166 aa  43.1  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000311069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0752  PTS system, fructose subfamily, IIC subunit  34.07 
 
 		 664 aa  42.4  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03830  phosphotransferase system mannitol/fructose-specifc IIA component (Ntr-type)  29.09 
 
 		 200 aa  41.6  0.003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001632  phosphotransferase system mannitol-specific  26.19 
 
 		 650 aa  42  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22320  PTS system IIA component/PTS system IIB component/PTS system IIC component  30.77 
 
 		 708 aa  40.8  0.006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.215617  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3023  phosphoenolpyruvate-dependent sugar PTS system, EIIA component  32.04 
 
 		 148 aa  40  0.01  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2631  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  32.04 
 
 		 148 aa  40  0.01  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.984641  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>