95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_3554 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_3554  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  100 
 
 
153 aa  309  1e-83  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3717  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  39.16 
 
 
154 aa  103  6e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0121  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  36.36 
 
 
157 aa  101  3e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0315962  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4120  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  35.37 
 
 
153 aa  97.8  5e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.105011  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0234  phosphotransferase system galacitol-specific IIA domain-containing protein  40.94 
 
 
153 aa  97.1  9e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3753  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  33.56 
 
 
150 aa  90.1  1e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3553  PTS system galactitol-specific transporter subunit IIA  32.52 
 
 
154 aa  81.6  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0236  phosphoenolpyruvate-dependent sugar phosphotransferase system EIIA 2  36.36 
 
 
155 aa  81.6  0.000000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0230  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  36.36 
 
 
155 aa  81.6  0.000000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3613  PTS system galactitol-specific transporter subunit IIA  32.52 
 
 
154 aa  81.6  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.397916  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3445  PTS system galactitol-specific transporter subunit IIA  32.52 
 
 
154 aa  81.6  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3447  PTS system galactitol-specific transporter subunit IIA  32.52 
 
 
154 aa  82  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.487344  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3516  PTS system galactitol-specific transporter subunit IIA  32.52 
 
 
154 aa  81.6  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0319619  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0214  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  33.1 
 
 
153 aa  78.2  0.00000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3386  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  31.16 
 
 
149 aa  75.5  0.0000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000117799  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1732  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  36.11 
 
 
155 aa  75.1  0.0000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2222  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  31.58 
 
 
165 aa  74.7  0.0000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.694399 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3159  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  30.07 
 
 
154 aa  74.3  0.0000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0495  phosphotransferase system galacitol-specific IIA domain-containing protein  31.21 
 
 
166 aa  73.2  0.000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000311069  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0970  PTS system galactitol-specific transporter subunit IIA  32.74 
 
 
150 aa  73.2  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.381164 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1553  PTS system galactitol-specific transporter subunit IIA  32.74 
 
 
150 aa  72.8  0.000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3073  PTS system galactitol-specific transporter subunit IIA  32.74 
 
 
150 aa  72.8  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000478831 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1563  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  32.74 
 
 
150 aa  72.8  0.000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00172388  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2382  PTS system galactitol-specific transporter subunit IIA  32.74 
 
 
150 aa  72.8  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2230  PTS system galactitol-specific transporter subunit IIA  32.74 
 
 
150 aa  72.8  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.846174  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02020  galactitol-specific enzyme IIA component of PTS  32.74 
 
 
150 aa  72.8  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01986  hypothetical protein  32.74 
 
 
150 aa  72.8  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03830  phosphotransferase system mannitol/fructose-specifc IIA component (Ntr-type)  36.21 
 
 
200 aa  72.8  0.000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1144  PTS system galactitol-specific transporter subunit IIA  32.74 
 
 
150 aa  70.9  0.000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.199908  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3257  galactitol-specific phosphotransferase enzyme iia component  34.31 
 
 
159 aa  68.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000435521  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1640  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  30.71 
 
 
152 aa  67.8  0.00000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.233864  hitchhiker  0.0036959 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4010  putative phosphoenolpyruvate-dependent sugar phosphotransferase system, eiia 2  25.98 
 
 
157 aa  65.5  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0125  phosphotransferase system galacitol-specific IIA domain-containing protein  28.99 
 
 
184 aa  65.5  0.0000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00946268  hitchhiker  0.00000000000330151 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4115  putative phosphoenolpyruvate-dependent sugar PTS system eiia 2  25.98 
 
 
157 aa  65.5  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3262  PTS system mannitol-specific eiicba component  32.28 
 
 
152 aa  65.5  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.71965  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4065  putative PTS system mannitol/fructose-specific transporter subunit IIA  25.98 
 
 
157 aa  65.5  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.405107  normal  0.80579 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3994  putative phosphotransferase system mannitol/fructose-specific IIA domain  25.98 
 
 
157 aa  65.5  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.489093 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0037  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  26.98 
 
 
150 aa  64.7  0.0000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3767  PEP-dependent sugar transporting PTS family, IIA component  30 
 
 
157 aa  63.2  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1645  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  30.43 
 
 
147 aa  62.8  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000320453 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4823  PEP-dependent sugar transporting PTS family, IIA component  30 
 
 
157 aa  63.2  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0154  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  30.33 
 
 
157 aa  61.6  0.000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.882818  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1968  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  30.61 
 
 
153 aa  60.5  0.000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00203229  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1144  PTS system galactitol-specific transporter subunit IIA  27.68 
 
 
148 aa  60.1  0.00000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1459  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  29.73 
 
 
151 aa  57  0.00000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0640  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  35.64 
 
 
150 aa  56.2  0.0000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.229714  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0823  transcriptional antiterminator, BglG  31.51 
 
 
652 aa  56.6  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.325703  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4516  multiphosphoryl transfer protein 2  30.46 
 
 
829 aa  53.5  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000995524 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4442  multiphosphoryl transfer protein 2  30.46 
 
 
829 aa  53.5  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.557149 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0148  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  34.26 
 
 
149 aa  53.1  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000039829  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03782  hypothetical protein  30.46 
 
 
833 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03833  fused predicted PTS enzymes: Hpr component/enzyme I component/enzyme IIA component  30.46 
 
 
833 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5408  multi-phosphoryl transfer protein 2  30.46 
 
 
833 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4434  multi-phosphoryl transfer protein 2  30.46 
 
 
833 aa  52.4  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4038  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase  30.46 
 
 
833 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4487  multi-phosphoryl transfer protein 2  30.46 
 
 
833 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4182  multi-phosphoryl transfer protein 2  30.46 
 
 
833 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0655  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  29.66 
 
 
645 aa  52  0.000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4395  multi-phosphoryl transfer protein 2  30.46 
 
 
833 aa  51.6  0.000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.963786 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1935  PTS system, IIA component, putative  28.33 
 
 
157 aa  50.8  0.000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.025117  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2260  PTS system, fructose-specific IIABC components  29.73 
 
 
646 aa  50.8  0.000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4068  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase  29.8 
 
 
833 aa  50.4  0.000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0149  phosphotransferase system fructose-specific component IIB  23.13 
 
 
643 aa  49.7  0.00001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000221373 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0383  PTS system, fructose subfamily, IIC subunit  26.49 
 
 
620 aa  50.1  0.00001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00944668  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1033  fusion of IIA, IIB and IIC component of mannitol/fructose-specific phosphotransferase system mannitol/fructose-specific  28 
 
 
634 aa  48.1  0.00004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.194757  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2665  PTS system, fructose subfamily, IIC subunit  29.53 
 
 
650 aa  47.8  0.00005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2721  PTS system, fructose subfamily, IIC subunit  29.53 
 
 
650 aa  47.8  0.00005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3395  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  28.57 
 
 
661 aa  48.1  0.00005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0550  fructose specific permease  29.87 
 
 
630 aa  47.8  0.00006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl181  fructose-specific PTS system IIABC component  28.44 
 
 
715 aa  47  0.00009  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0564  PTS system, fructose-specific, IIABC component  29.61 
 
 
630 aa  46.2  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3396  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  29.33 
 
 
150 aa  46.2  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2235  PTS system 2-O-a-mannosyl-D-glycerate specific transporter subunit IIABC  23.33 
 
 
637 aa  45.4  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1933  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  27.11 
 
 
172 aa  45.1  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000195157  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1464  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  25.4 
 
 
149 aa  45.1  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0505  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  36.84 
 
 
151 aa  45.1  0.0004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0750012  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0396  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  33.71 
 
 
156 aa  44.7  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0476136  normal  0.679365 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3407  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  26.14 
 
 
148 aa  44.3  0.0006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00378325  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5269  phosphoenolpyruvate-dependent sugar phosphotransferase system EIIA 2  28.57 
 
 
153 aa  44.3  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0588  PTS system, fructose subfamily, IIC subunit  27.21 
 
 
626 aa  43.9  0.0007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1170  PTS system, fructose subfamily, IIC subunit  28.38 
 
 
648 aa  43.9  0.0008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0405473  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0361  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  32.29 
 
 
156 aa  43.9  0.0009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0432494  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4004  PTS system, mannitol-specific IIC subunit  30.34 
 
 
657 aa  43.1  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.852778  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0577  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  24.83 
 
 
148 aa  43.1  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000200384  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0752  PTS system, fructose subfamily, IIC subunit  28.18 
 
 
664 aa  42.4  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3592  PTS system, fructose subfamily, IIC subunit  27.01 
 
 
637 aa  42.4  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0363  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  24.63 
 
 
156 aa  42.4  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.142335  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2426  bifunctional PTS system fructose-specific transporter subunit IIA/HPr protein  25.17 
 
 
379 aa  41.6  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0650  PTS system 2-O-a-mannosyl-D-glycerate specific transporter subunit IIABC  23.81 
 
 
638 aa  41.6  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001632  phosphotransferase system mannitol-specific  23.81 
 
 
650 aa  40.8  0.006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2753  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  27.43 
 
 
151 aa  41.2  0.006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0237  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  25.49 
 
 
154 aa  40.8  0.006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4149  PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  25.89 
 
 
154 aa  40.8  0.007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3758  PTS system, fructose subfamily, IIC subunit  23.38 
 
 
634 aa  40.4  0.008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2248  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  24.49 
 
 
145 aa  40.4  0.009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.127438  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>