50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0495 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_0495  phosphotransferase system galacitol-specific IIA domain-containing protein  100 
 
 		 166 aa  338  2e-92  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000311069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0125  phosphotransferase system galacitol-specific IIA domain-containing protein  54.14 
 
 		 184 aa  181  6e-45  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00946268  hitchhiker  0.00000000000330151 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4120  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  33.56 
 
 		 153 aa  81.3  0.000000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.105011  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3717  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  32.86 
 
 		 154 aa  78.6  0.00000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0121  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  37.61 
 
 		 157 aa  75.9  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0315962  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1935  PTS system, IIA component, putative  34.29 
 
 		 157 aa  76.3  0.0000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.025117  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3554  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  31.21 
 
 		 153 aa  73.2  0.000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1732  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  30.97 
 
 		 155 aa  70.5  0.000000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0234  phosphotransferase system galacitol-specific IIA domain-containing protein  29.63 
 
 		 153 aa  68.6  0.00000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4115  putative phosphoenolpyruvate-dependent sugar PTS system eiia 2  27.94 
 
 		 157 aa  68.6  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3994  putative phosphotransferase system mannitol/fructose-specific IIA domain  27.94 
 
 		 157 aa  68.6  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.489093 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4065  putative PTS system mannitol/fructose-specific transporter subunit IIA  27.94 
 
 		 157 aa  68.6  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.405107  normal  0.80579 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4010  putative phosphoenolpyruvate-dependent sugar phosphotransferase system, eiia 2  27.94 
 
 		 157 aa  68.6  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3767  PEP-dependent sugar transporting PTS family, IIA component  31.62 
 
 		 157 aa  66.6  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4823  PEP-dependent sugar transporting PTS family, IIA component  31.62 
 
 		 157 aa  66.6  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0214  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  31.78 
 
 		 153 aa  63.9  0.0000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0236  phosphoenolpyruvate-dependent sugar phosphotransferase system EIIA 2  37.89 
 
 		 155 aa  62.8  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0230  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  37.89 
 
 		 155 aa  62.8  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2222  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  30.95 
 
 		 165 aa  62  0.000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.694399 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3386  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  25.81 
 
 		 149 aa  59.7  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000117799  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3159  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  30.23 
 
 		 154 aa  59.3  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03830  phosphotransferase system mannitol/fructose-specifc IIA component (Ntr-type)  32.48 
 
 		 200 aa  58.9  0.00000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0037  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  33.93 
 
 		 150 aa  55.8  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2235  PTS system 2-O-a-mannosyl-D-glycerate specific transporter subunit IIABC  27.21 
 
 		 637 aa  48.1  0.00006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1640  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  27.16 
 
 		 152 aa  47.4  0.00008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.233864  hitchhiker  0.0036959 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0823  transcriptional antiterminator, BglG  33.33 
 
 		 652 aa  47.4  0.00009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.325703  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3753  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  25.17 
 
 		 150 aa  47  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3613  PTS system galactitol-specific transporter subunit IIA  27.43 
 
 		 154 aa  47  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.397916  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3445  PTS system galactitol-specific transporter subunit IIA  27.43 
 
 		 154 aa  47  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3447  PTS system galactitol-specific transporter subunit IIA  27.43 
 
 		 154 aa  47  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.487344  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3553  PTS system galactitol-specific transporter subunit IIA  27.43 
 
 		 154 aa  47  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3516  PTS system galactitol-specific transporter subunit IIA  27.43 
 
 		 154 aa  47  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0319619  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3257  galactitol-specific phosphotransferase enzyme iia component  30.36 
 
 		 159 aa  46.6  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000435521  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl181  fructose-specific PTS system IIABC component  28.89 
 
 		 715 aa  46.6  0.0002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1645  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  28.79 
 
 		 147 aa  45.8  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000320453 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0655  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  22.73 
 
 		 645 aa  44.3  0.0009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1144  PTS system galactitol-specific transporter subunit IIA  25.5 
 
 		 150 aa  43.5  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.199908  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0970  PTS system galactitol-specific transporter subunit IIA  24.83 
 
 		 150 aa  43.5  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.381164 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0154  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  27.48 
 
 		 157 aa  43.9  0.001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.882818  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02020  galactitol-specific enzyme IIA component of PTS  24.83 
 
 		 150 aa  42.7  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1563  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  24.83 
 
 		 150 aa  43.1  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00172388  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2230  PTS system galactitol-specific transporter subunit IIA  24.83 
 
 		 150 aa  43.1  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.846174  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2382  PTS system galactitol-specific transporter subunit IIA  24.83 
 
 		 150 aa  43.1  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1553  PTS system galactitol-specific transporter subunit IIA  24.83 
 
 		 150 aa  43.1  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01986  hypothetical protein  24.83 
 
 		 150 aa  42.7  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3073  PTS system galactitol-specific transporter subunit IIA  24.83 
 
 		 150 aa  43.1  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000478831 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3262  PTS system mannitol-specific eiicba component  28.4 
 
 		 152 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.71965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1033  fusion of IIA, IIB and IIC component of mannitol/fructose-specific phosphotransferase system mannitol/fructose-specific  28.19 
 
 		 634 aa  42.4  0.003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.194757  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0640  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  25.95 
 
 		 150 aa  42  0.004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.229714  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1144  PTS system galactitol-specific transporter subunit IIA  29.27 
 
 		 148 aa  41.2  0.006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>