87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_4823 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011353  ECH74115_4823  PEP-dependent sugar transporting PTS family, IIA component  100 
 
 
157 aa  321  2e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3767  PEP-dependent sugar transporting PTS family, IIA component  97.45 
 
 
157 aa  314  4e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4010  putative phosphoenolpyruvate-dependent sugar phosphotransferase system, eiia 2  62.42 
 
 
157 aa  210  7.999999999999999e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4115  putative phosphoenolpyruvate-dependent sugar PTS system eiia 2  62.42 
 
 
157 aa  209  7.999999999999999e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3994  putative phosphotransferase system mannitol/fructose-specific IIA domain  61.78 
 
 
157 aa  208  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.489093 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4065  putative PTS system mannitol/fructose-specific transporter subunit IIA  61.78 
 
 
157 aa  209  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.405107  normal  0.80579 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4120  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  43.8 
 
 
153 aa  92  3e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.105011  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0121  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  36.44 
 
 
157 aa  84.7  4e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0315962  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3717  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  32.06 
 
 
154 aa  82.8  0.000000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2222  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  38.52 
 
 
165 aa  81.6  0.000000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.694399 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0234  phosphotransferase system galacitol-specific IIA domain-containing protein  34.93 
 
 
153 aa  77  0.0000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0236  phosphoenolpyruvate-dependent sugar phosphotransferase system EIIA 2  36.36 
 
 
155 aa  74.7  0.0000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0230  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  36.36 
 
 
155 aa  74.7  0.0000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03830  phosphotransferase system mannitol/fructose-specifc IIA component (Ntr-type)  38.05 
 
 
200 aa  68.6  0.00000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0495  phosphotransferase system galacitol-specific IIA domain-containing protein  31.62 
 
 
166 aa  66.6  0.0000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000311069  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3386  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  28.91 
 
 
149 aa  65.1  0.0000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000117799  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3262  PTS system mannitol-specific eiicba component  29.06 
 
 
152 aa  65.5  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.71965  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0037  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  26.19 
 
 
150 aa  64.7  0.0000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3554  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  30 
 
 
153 aa  63.2  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3159  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  31 
 
 
154 aa  62.8  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1732  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  28.32 
 
 
155 aa  61.2  0.000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0214  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  25.71 
 
 
153 aa  60.5  0.000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1144  PTS system galactitol-specific transporter subunit IIA  27.82 
 
 
148 aa  60.5  0.000000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1640  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  27.78 
 
 
152 aa  57  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.233864  hitchhiker  0.0036959 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3257  galactitol-specific phosphotransferase enzyme iia component  26.32 
 
 
159 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000435521  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1645  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  28.78 
 
 
147 aa  56.2  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000320453 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0154  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  27.13 
 
 
157 aa  55.8  0.0000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.882818  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3753  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  27.52 
 
 
150 aa  53.5  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1968  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  32.76 
 
 
153 aa  51.2  0.000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00203229  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3758  PTS system, fructose subfamily, IIC subunit  26.87 
 
 
634 aa  51.2  0.000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0550  fructose specific permease  26.27 
 
 
630 aa  50.8  0.000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1573  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  30.77 
 
 
153 aa  50.4  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0125  phosphotransferase system galacitol-specific IIA domain-containing protein  27.43 
 
 
184 aa  50.4  0.00001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00946268  hitchhiker  0.00000000000330151 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3613  PTS system galactitol-specific transporter subunit IIA  27.2 
 
 
154 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.397916  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3445  PTS system galactitol-specific transporter subunit IIA  27.2 
 
 
154 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3447  PTS system galactitol-specific transporter subunit IIA  27.2 
 
 
154 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.487344  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3553  PTS system galactitol-specific transporter subunit IIA  27.2 
 
 
154 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1286  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  32.31 
 
 
151 aa  49.3  0.00002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0564  PTS system, fructose-specific, IIABC component  27.12 
 
 
630 aa  49.3  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3516  PTS system galactitol-specific transporter subunit IIA  27.2 
 
 
154 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0319619  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0824  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  34.21 
 
 
149 aa  46.6  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0014  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  31.11 
 
 
154 aa  47  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000106322 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3368  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  27.61 
 
 
143 aa  46.6  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0363  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  33.67 
 
 
156 aa  46.2  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.142335  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1464  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  24.83 
 
 
149 aa  45.8  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2030  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase  34.35 
 
 
836 aa  45.1  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2394  PTS system, fructose subfamily, IIC subunit  29.52 
 
 
618 aa  45.4  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.123557  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3476  PTS fructose-specific enzyme IIBC component  27.78 
 
 
619 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000542106  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0836  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  31 
 
 
154 aa  45.1  0.0004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3846  PTS system fructose-specific transporter subunit IIABC  27.78 
 
 
626 aa  44.3  0.0007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000062066  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3462  PTS fructose-specific enzyme IIBC component  27.78 
 
 
619 aa  44.3  0.0007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000328489  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3563  PTS system fructose-specific transporter subunit IIABC  27.78 
 
 
622 aa  44.3  0.0007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0301222  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3744  PTS system, fructose-specific IIABC component  27.78 
 
 
618 aa  44.3  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000405115  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3726  PTS system, fructose-specific IIABC component  27.78 
 
 
618 aa  44.3  0.0007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2187600000000001e-29 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01986  hypothetical protein  23.77 
 
 
150 aa  43.9  0.0008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1563  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  23.77 
 
 
150 aa  43.9  0.0008  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00172388  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2230  PTS system galactitol-specific transporter subunit IIA  23.77 
 
 
150 aa  43.9  0.0008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.846174  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2382  PTS system galactitol-specific transporter subunit IIA  23.77 
 
 
150 aa  43.9  0.0008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1553  PTS system galactitol-specific transporter subunit IIA  23.77 
 
 
150 aa  43.9  0.0008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl181  fructose-specific PTS system IIABC component  26.61 
 
 
715 aa  43.9  0.0008  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3073  PTS system galactitol-specific transporter subunit IIA  23.77 
 
 
150 aa  43.9  0.0008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000478831 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02020  galactitol-specific enzyme IIA component of PTS  23.77 
 
 
150 aa  43.9  0.0008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0970  PTS system galactitol-specific transporter subunit IIA  23.77 
 
 
150 aa  43.9  0.0009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.381164 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1169  transcriptional antiterminator, BglG  26.67 
 
 
648 aa  43.9  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00649229  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1527  phosphoenolpyruvate-dependent sugar phosphotransferase system EIIA 2  31.5 
 
 
157 aa  43.1  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.115868  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2235  PTS system 2-O-a-mannosyl-D-glycerate specific transporter subunit IIABC  29.86 
 
 
637 aa  43.5  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0640  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  33.33 
 
 
150 aa  43.1  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.229714  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0325  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  22.54 
 
 
152 aa  43.5  0.001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.668723  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3767  PTS system, fructose-specific IIABC component  27.78 
 
 
619 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000180582  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3816  PTS system, fructose-specific IIABC component  28.33 
 
 
618 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000120874  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1144  PTS system galactitol-specific transporter subunit IIA  27.27 
 
 
150 aa  42.7  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.199908  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1512  PTS system, fructose subfamily, IIC subunit  27.83 
 
 
623 aa  42.4  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000350477  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0148  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  33.33 
 
 
149 aa  42.4  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000039829  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3565  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  27.68 
 
 
153 aa  42.7  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3657  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase  25.55 
 
 
864 aa  42  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1486  PTS system, fructose-specific IIABC component  27.5 
 
 
618 aa  42.4  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00732656  hitchhiker  0.00389815 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2753  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  25.78 
 
 
151 aa  42  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3528  HPr family phosphocarrier protein  25.55 
 
 
858 aa  42  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1787  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  34.94 
 
 
156 aa  41.6  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00550071 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0588  PTS system, fructose subfamily, IIC subunit  26.5 
 
 
626 aa  41.2  0.005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1170  PTS system, fructose subfamily, IIC subunit  24.53 
 
 
648 aa  41.6  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0405473  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1286  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase  23.3 
 
 
831 aa  40.8  0.007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.807752  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1935  PTS system, IIA component, putative  25.23 
 
 
157 aa  40.8  0.007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.025117  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3615  multiphosphoryl transfer protein 1  24.27 
 
 
831 aa  40.8  0.008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.629067 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2649  PTS system, fructose subfamily, IIC subunit  28.26 
 
 
623 aa  40.4  0.009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3482  PTS system, fructose subfamily, IIC subunit  26.67 
 
 
619 aa  40.4  0.01  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0610802  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0314  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  25.52 
 
 
152 aa  40.4  0.01  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>