More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E4434 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_02293  fused predicted PTS enzymes: Hpr component/enzyme I component/enzyme IIA component  44.6 
 
 
831 aa  688    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2535  multiphosphoryl transfer protein 1  44.84 
 
 
831 aa  688    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03833  fused predicted PTS enzymes: Hpr component/enzyme I component/enzyme IIA component  99.04 
 
 
833 aa  1700    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1274  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase  44.72 
 
 
831 aa  691    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4038  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase  98.92 
 
 
833 aa  1697    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2673  multiphosphoryl transfer protein 1  44.72 
 
 
831 aa  690    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4434  multi-phosphoryl transfer protein 2  100 
 
 
833 aa  1715    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4395  multi-phosphoryl transfer protein 2  98.68 
 
 
833 aa  1694    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.963786 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03782  hypothetical protein  99.04 
 
 
833 aa  1700    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1286  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase  44.6 
 
 
831 aa  687    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.807752  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5408  multi-phosphoryl transfer protein 2  99.04 
 
 
833 aa  1700    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4182  multi-phosphoryl transfer protein 2  99.04 
 
 
833 aa  1700    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02254  hypothetical protein  44.6 
 
 
831 aa  688    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4442  multiphosphoryl transfer protein 2  89.75 
 
 
829 aa  1527    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.557149 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4516  multiphosphoryl transfer protein 2  89.75 
 
 
829 aa  1527    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000995524 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4068  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase  98.92 
 
 
833 aa  1696    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2520  multiphosphoryl transfer protein 1  44.72 
 
 
831 aa  691    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3528  HPr family phosphocarrier protein  62.22 
 
 
858 aa  1054    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4487  multi-phosphoryl transfer protein 2  99.04 
 
 
833 aa  1699    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3657  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase  61.79 
 
 
864 aa  1052    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3615  multiphosphoryl transfer protein 1  44.48 
 
 
831 aa  684    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.629067 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0865  HPr family phosphocarrier protein  62.38 
 
 
809 aa  1001    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0151  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase  39.7 
 
 
550 aa  387  1e-106  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1787  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase  38.35 
 
 
573 aa  382  1e-104  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl519  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase  36.18 
 
 
573 aa  375  1e-102  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3804  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase  38.75 
 
 
570 aa  374  1e-102  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0211135  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2622  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase  40.04 
 
 
584 aa  374  1e-102  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0914  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase  37.8 
 
 
573 aa  375  1e-102  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4068  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase  38.75 
 
 
570 aa  372  1e-101  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.767709 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3789  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase  38.75 
 
 
570 aa  372  1e-101  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.411643  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4157  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase  38.83 
 
 
570 aa  372  1e-101  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00784189  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1081  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase  38.83 
 
 
570 aa  372  1e-101  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.696221  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2747  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase  39.15 
 
 
570 aa  371  1e-101  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.210737  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4179  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase  38.75 
 
 
570 aa  372  1e-101  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000276163  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3877  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase  38.76 
 
 
570 aa  369  1e-100  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.584229  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0225  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase  38.93 
 
 
571 aa  367  1e-100  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1166  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase  37.88 
 
 
572 aa  369  1e-100  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1144  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase  37.88 
 
 
572 aa  369  1e-100  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3958  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase  38.56 
 
 
570 aa  365  3e-99  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.112067  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4267  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase  38.56 
 
 
570 aa  365  3e-99  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0914385  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4115  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase  38.56 
 
 
568 aa  363  9e-99  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0457  phosphoenolpyruvate--protein phosphotransferase  37.08 
 
 
575 aa  362  2e-98  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000981374  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0670  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase  37.24 
 
 
572 aa  361  3e-98  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.98419  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0827  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase  40.08 
 
 
573 aa  360  4e-98  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0104  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase  37.28 
 
 
575 aa  359  9e-98  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.106099  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0637  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase  39.2 
 
 
550 aa  357  5.999999999999999e-97  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.612876  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0233  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase  35.14 
 
 
573 aa  357  6.999999999999999e-97  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.196858  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0822  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase  39.65 
 
 
577 aa  355  2e-96  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.5664  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14450  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase  36.06 
 
 
572 aa  355  2.9999999999999997e-96  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1242  phosphoenolpyruvate-protein kinase  36.12 
 
 
577 aa  354  2.9999999999999997e-96  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5089  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase  33.09 
 
 
832 aa  352  2e-95  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0016  phosphoenolpyruvate--protein phosphotransferase  40.8 
 
 
569 aa  352  2e-95  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000201046 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2895  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase  34.21 
 
 
819 aa  351  3e-95  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00460973 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0647  phosphoenolpyruvate--protein phosphotransferase  35.77 
 
 
575 aa  349  1e-94  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0814297  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1779  phosphoenolpyruvate--protein phosphotransferase  35.14 
 
 
571 aa  348  2e-94  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1528  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase  33.05 
 
 
703 aa  348  2e-94  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.611034  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0309  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase  33.48 
 
 
865 aa  348  3e-94  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1770  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase  34.32 
 
 
840 aa  347  4e-94  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.334796  normal  0.0969879 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1360  phosphoenolpyruvate-protein kinase  35.58 
 
 
579 aa  347  4e-94  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.432867  hitchhiker  0.000142062 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004158  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase of PTS system  40.27 
 
 
574 aa  344  4e-93  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000102592  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2666  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase  37.28 
 
 
539 aa  344  5e-93  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2352  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase  37.28 
 
 
539 aa  343  5.999999999999999e-93  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0487  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase  40.04 
 
 
573 aa  343  8e-93  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000335072  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2313  PTS system, enzyme I, transcriptional regulator PtsP  36.61 
 
 
782 aa  343  1e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05327  multifunctional phosphocarrier protein HPr/phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase  38.42 
 
 
850 aa  341  2.9999999999999998e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0395678  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3192  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase  38.82 
 
 
575 aa  340  5e-92  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.120392  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1097  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase  40.53 
 
 
575 aa  338  1.9999999999999998e-91  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0431339  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01307  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase  39.82 
 
 
574 aa  338  2.9999999999999997e-91  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1881  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase  37.37 
 
 
588 aa  337  5.999999999999999e-91  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0884031  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2440  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase  37.52 
 
 
573 aa  337  5.999999999999999e-91  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.274673  normal  0.109117 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0883  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase  35.25 
 
 
567 aa  337  7.999999999999999e-91  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000204387  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1020  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase  37.6 
 
 
581 aa  336  1e-90  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2048  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase  37.22 
 
 
838 aa  336  1e-90  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.488537  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3270  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase  38.4 
 
 
575 aa  335  2e-90  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0139639  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1461  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase  36.41 
 
 
566 aa  334  5e-90  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2749  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase  40.56 
 
 
575 aa  333  1e-89  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000117022  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1316  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase  40.56 
 
 
575 aa  333  1e-89  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  0.00000000000000159263  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1427  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase  40.56 
 
 
575 aa  333  1e-89  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000892  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3875  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase  37.04 
 
 
568 aa  331  3e-89  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2358  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase  38.8 
 
 
574 aa  332  3e-89  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00384016  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12190  fructose-specific multiphosphoryl transfer protein  32.7 
 
 
957 aa  330  6e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1560  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase  36.98 
 
 
585 aa  330  7e-89  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1289  phosphoenolpyruvate--protein phosphotransferase  39.05 
 
 
588 aa  330  8e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000244678  hitchhiker  0.0000151744 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3384  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase  37.3 
 
 
586 aa  330  9e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0821  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase  33.97 
 
 
956 aa  329  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0946111 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2944  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase  39.78 
 
 
575 aa  329  1.0000000000000001e-88  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000558026  normal  0.274813 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02316  PEP-protein phosphotransferase of PTS system (enzyme I)  39.08 
 
 
575 aa  328  3e-88  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000589054  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2905  putative GAF sensor protein  33.73 
 
 
782 aa  328  3e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000121326  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1262  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase  39.08 
 
 
575 aa  328  3e-88  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000565297  decreased coverage  0.00000416053 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2571  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase  39.08 
 
 
575 aa  328  3e-88  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00718349  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2703  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase  39.08 
 
 
575 aa  328  3e-88  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000279756  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3647  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase  39.08 
 
 
575 aa  328  3e-88  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000415722  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02277  hypothetical protein  39.08 
 
 
575 aa  328  3e-88  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000407326  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2551  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase  39.08 
 
 
575 aa  328  3e-88  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000126439  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2798  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase  39.69 
 
 
575 aa  328  3e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.620926  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2764  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase  39.08 
 
 
575 aa  328  3e-88  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00020001  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1245  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase  39.08 
 
 
575 aa  328  4.0000000000000003e-88  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000730573  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1011  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase  38.45 
 
 
575 aa  328  4.0000000000000003e-88  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.534098  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2007  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase  33.24 
 
 
854 aa  327  4.0000000000000003e-88  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.436147 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3449  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase  41.98 
 
 
575 aa  327  4.0000000000000003e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.803856  hitchhiker  0.000845971 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>