47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_3108 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_1537  VWA containing CoxE family protein  97.88 
 
 		 378 aa  753    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0923  von Willebrand factor type A domain-containing protein  97.62 
 
 		 378 aa  753    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02050  hypothetical protein  97.62 
 
 		 378 aa  753    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2409  von Willebrand factor type A domain-containing protein  97.09 
 
 		 378 aa  746    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2255  von Willebrand factor type A domain-containing protein  97.88 
 
 		 378 aa  755    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3108  von Willebrand factor type A domain protein  100 
 
 		 378 aa  772    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.708549  normal  0.744851 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02008  hypothetical protein  97.62 
 
 		 378 aa  753    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1557  VWA containing CoxE-like protein  68.77 
 
 		 381 aa  497  1e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0310279  normal  0.504339 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1885  VWA containing CoxE family protein  58.36 
 
 		 368 aa  435  1e-121  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7544  von Willebrand factor type A (vWA) domain-containing protein  56.64 
 
 		 380 aa  427  1e-118  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.183043  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1393  VWA containing CoxE family protein  57.14 
 
 		 376 aa  427  1e-118  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0792049  normal  0.21491 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2880  VWA containing CoxE family protein  57.71 
 
 		 377 aa  409  1e-113  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.191674  normal  0.189706 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0601  VWA containing CoxE family protein  54.45 
 
 		 389 aa  406  1.0000000000000001e-112  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6233  VWA containing CoxE family protein  44.14 
 
 		 375 aa  301  2e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0134  VWA containing CoxE family protein  41.8 
 
 		 379 aa  290  2e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1361  VWA containing CoxE family protein  36.31 
 
 		 377 aa  283  3.0000000000000004e-75  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1510  VWA containing CoxE family protein  37.7 
 
 		 388 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0633588  normal  0.728089 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1789  VWA containing CoxE family protein  38.14 
 
 		 387 aa  243  5e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.347517  normal  0.0670662 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1510  VWA containing CoxE family protein  37.85 
 
 		 387 aa  241  2e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.211615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3514  VWA domain-containing protein  38.31 
 
 		 389 aa  238  9e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3742  VWA containing CoxE family protein  36.78 
 
 		 403 aa  238  2e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.65677 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6471  VWA containing CoxE family protein  37.33 
 
 		 385 aa  232  7.000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0451364  normal  0.124275 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0754  VWA containing CoxE family protein  34.15 
 
 		 376 aa  229  4e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7989  VWA containing CoxE family protein  34.55 
 
 		 400 aa  228  1e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4844  VWA containing CoxE family protein  36.31 
 
 		 410 aa  226  7e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4578  VWA containing CoxE family protein  35.5 
 
 		 390 aa  222  9e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.26752  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1279  VWA containing CoxE family protein  39.57 
 
 		 424 aa  221  9.999999999999999e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.596835  hitchhiker  0.00435359 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2431  VWA containing CoxE family protein  33.07 
 
 		 403 aa  219  6e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00243334  hitchhiker  0.00000137951 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0406  VWA containing CoxE family protein  34.13 
 
 		 388 aa  218  2e-55  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4024  VWA containing CoxE family protein  34.97 
 
 		 401 aa  216  5e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2409  VWA containing CoxE family protein  34.69 
 
 		 393 aa  213  2.9999999999999995e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000612945  decreased coverage  0.0000832829 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2045  VWA containing CoxE family protein  36.07 
 
 		 421 aa  214  2.9999999999999995e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4685  VWA containing CoxE family protein  32.96 
 
 		 391 aa  213  3.9999999999999995e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1555  VWA containing CoxE family protein  37.2 
 
 		 433 aa  211  1e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.61333 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3885  hypothetical protein  37.6 
 
 		 1330 aa  206  4e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0169004  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2171  VWA containing CoxE family protein  37.89 
 
 		 552 aa  203  3e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.622478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1461  von Willebrand factor, type A  35.46 
 
 		 410 aa  203  4e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.178623  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1840  VWA containing CoxE family protein  35.03 
 
 		 387 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000454506  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2512  VWA containing CoxE family protein  35.36 
 
 		 1295 aa  194  3e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.686285  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3408  VWA containing CoxE family protein  32.41 
 
 		 460 aa  173  5e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2928  VWA containing CoxE family protein  29.19 
 
 		 447 aa  148  2.0000000000000003e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.84121  normal  0.653479 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2018  VWA containing CoxE family protein  30.4 
 
 		 447 aa  145  1e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.531693  normal  0.264381 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0028  hypothetical protein  32.14 
 
 		 481 aa  132  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.125752  normal  0.588325 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1851  hypothetical protein  32.33 
 
 		 411 aa  47.8  0.0004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.257555 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1214  VWA containing CoxE family protein  26.53 
 
 		 392 aa  43.1  0.007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2161  hypothetical protein  22.52 
 
 		 575 aa  42.7  0.01  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2692  hypothetical protein  24.89 
 
 		 458 aa  42.7  0.01  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0917977 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>