43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2928 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2018  VWA containing CoxE family protein  97.32 
 
 		 447 aa  846    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.531693  normal  0.264381 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0028  hypothetical protein  75.63 
 
 		 481 aa  674    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.125752  normal  0.588325 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2928  VWA containing CoxE family protein  100 
 
 		 447 aa  899    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.84121  normal  0.653479 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3408  VWA containing CoxE family protein  52.47 
 
 		 460 aa  463  1e-129  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0601  VWA containing CoxE family protein  34.2 
 
 		 389 aa  162  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1557  VWA containing CoxE-like protein  34.8 
 
 		 381 aa  160  6e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0310279  normal  0.504339 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1361  VWA containing CoxE family protein  28.36 
 
 		 377 aa  159  1e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2255  von Willebrand factor type A domain-containing protein  31.02 
 
 		 378 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02050  hypothetical protein  31.02 
 
 		 378 aa  153  7e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02008  hypothetical protein  31.02 
 
 		 378 aa  153  7e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0923  von Willebrand factor type A domain-containing protein  29.81 
 
 		 378 aa  152  2e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2880  VWA containing CoxE family protein  31.62 
 
 		 377 aa  150  4e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.191674  normal  0.189706 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1537  VWA containing CoxE family protein  30.69 
 
 		 378 aa  149  7e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2409  von Willebrand factor type A domain-containing protein  30.69 
 
 		 378 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3108  von Willebrand factor type A domain protein  29.19 
 
 		 378 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.708549  normal  0.744851 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1393  VWA containing CoxE family protein  31.14 
 
 		 376 aa  143  5e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0792049  normal  0.21491 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7544  von Willebrand factor type A (vWA) domain-containing protein  30.4 
 
 		 380 aa  141  3e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.183043  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1885  VWA containing CoxE family protein  30.15 
 
 		 368 aa  140  3.9999999999999997e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0406  VWA containing CoxE family protein  27.34 
 
 		 388 aa  140  4.999999999999999e-32  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4024  VWA containing CoxE family protein  29.09 
 
 		 401 aa  135  9.999999999999999e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6233  VWA containing CoxE family protein  29.15 
 
 		 375 aa  135  9.999999999999999e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3514  VWA domain-containing protein  29.81 
 
 		 389 aa  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3742  VWA containing CoxE family protein  34.47 
 
 		 403 aa  133  5e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.65677 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2431  VWA containing CoxE family protein  28.12 
 
 		 403 aa  133  6e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00243334  hitchhiker  0.00000137951 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1510  VWA containing CoxE family protein  29.82 
 
 		 387 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.211615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4844  VWA containing CoxE family protein  32.16 
 
 		 410 aa  131  3e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1510  VWA containing CoxE family protein  29.82 
 
 		 388 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0633588  normal  0.728089 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7989  VWA containing CoxE family protein  27.22 
 
 		 400 aa  130  6e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1789  VWA containing CoxE family protein  29.45 
 
 		 387 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.347517  normal  0.0670662 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2409  VWA containing CoxE family protein  30.69 
 
 		 393 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000612945  decreased coverage  0.0000832829 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4685  VWA containing CoxE family protein  28.88 
 
 		 391 aa  128  3e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6471  VWA containing CoxE family protein  29.84 
 
 		 385 aa  127  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0451364  normal  0.124275 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0134  VWA containing CoxE family protein  26.73 
 
 		 379 aa  125  1e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4578  VWA containing CoxE family protein  26.99 
 
 		 390 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.26752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0754  VWA containing CoxE family protein  27.27 
 
 		 376 aa  120  7e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1555  VWA containing CoxE family protein  31.27 
 
 		 433 aa  119  7.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.61333 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1279  VWA containing CoxE family protein  30.16 
 
 		 424 aa  117  3.9999999999999997e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.596835  hitchhiker  0.00435359 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2512  VWA containing CoxE family protein  32.41 
 
 		 1295 aa  117  6e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.686285  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1461  von Willebrand factor, type A  30.92 
 
 		 410 aa  117  6e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.178623  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2045  VWA containing CoxE family protein  28.06 
 
 		 421 aa  112  1.0000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1840  VWA containing CoxE family protein  29.53 
 
 		 387 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000454506  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2171  VWA containing CoxE family protein  29.2 
 
 		 552 aa  111  3e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.622478  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3885  hypothetical protein  32.27 
 
 		 1330 aa  110  6e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0169004  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>