81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2512 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_2512  VWA containing CoxE family protein  100 
 
 
1295 aa  2424    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.686285  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3885  hypothetical protein  62.72 
 
 
1330 aa  449  1.0000000000000001e-124  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0169004  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2255  von Willebrand factor type A domain-containing protein  36.63 
 
 
378 aa  206  3e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1537  VWA containing CoxE family protein  36.63 
 
 
378 aa  205  4e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02050  hypothetical protein  36.63 
 
 
378 aa  205  5e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02008  hypothetical protein  36.63 
 
 
378 aa  205  5e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3108  von Willebrand factor type A domain protein  36.63 
 
 
378 aa  204  9.999999999999999e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.708549  normal  0.744851 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0923  von Willebrand factor type A domain-containing protein  36.9 
 
 
378 aa  203  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2409  von Willebrand factor type A domain-containing protein  36.1 
 
 
378 aa  200  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1885  VWA containing CoxE family protein  39.25 
 
 
368 aa  194  8e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0601  VWA containing CoxE family protein  36.17 
 
 
389 aa  191  7e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1557  VWA containing CoxE-like protein  37.15 
 
 
381 aa  189  4e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0310279  normal  0.504339 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1393  VWA containing CoxE family protein  37.99 
 
 
376 aa  189  4e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0792049  normal  0.21491 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7544  von Willebrand factor type A (vWA) domain-containing protein  35.96 
 
 
380 aa  189  4e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.183043  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0134  VWA containing CoxE family protein  33.51 
 
 
379 aa  185  5.0000000000000004e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4023  hypothetical protein  31.72 
 
 
749 aa  181  9e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.528793  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2880  VWA containing CoxE family protein  36.17 
 
 
377 aa  179  2e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.191674  normal  0.189706 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0755  hypothetical protein  25.92 
 
 
747 aa  171  7e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2172  hypothetical protein  34.16 
 
 
710 aa  167  8e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.671206  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3514  VWA domain-containing protein  32.88 
 
 
389 aa  167  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6471  VWA containing CoxE family protein  35.46 
 
 
385 aa  166  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0451364  normal  0.124275 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2171  VWA containing CoxE family protein  36.64 
 
 
552 aa  160  1e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.622478  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4024  VWA containing CoxE family protein  33.33 
 
 
401 aa  159  3e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6233  VWA containing CoxE family protein  32.61 
 
 
375 aa  156  2e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1617  hypothetical protein  20.84 
 
 
837 aa  156  2.9999999999999998e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2409  VWA containing CoxE family protein  32.25 
 
 
393 aa  152  4e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000612945  decreased coverage  0.0000832829 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4684  hypothetical protein  30.3 
 
 
755 aa  152  4e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3742  VWA containing CoxE family protein  32.12 
 
 
403 aa  152  4e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.65677 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1361  VWA containing CoxE family protein  26.03 
 
 
377 aa  151  8e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1510  VWA containing CoxE family protein  33.98 
 
 
388 aa  150  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0633588  normal  0.728089 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0406  VWA containing CoxE family protein  29.13 
 
 
388 aa  149  3e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1789  VWA containing CoxE family protein  33.7 
 
 
387 aa  149  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.347517  normal  0.0670662 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1510  VWA containing CoxE family protein  34.07 
 
 
387 aa  148  5e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.211615  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2045  VWA containing CoxE family protein  34.83 
 
 
421 aa  148  5e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7990  hypothetical protein  30.08 
 
 
755 aa  148  7.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2431  VWA containing CoxE family protein  30.95 
 
 
403 aa  147  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00243334  hitchhiker  0.00000137951 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1279  VWA containing CoxE family protein  34.11 
 
 
424 aa  147  1e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.596835  hitchhiker  0.00435359 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4685  VWA containing CoxE family protein  31.74 
 
 
391 aa  147  2e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7989  VWA containing CoxE family protein  30.83 
 
 
400 aa  145  4e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3513  hypothetical protein  28.2 
 
 
749 aa  145  5e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1840  VWA containing CoxE family protein  37.26 
 
 
387 aa  145  6e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000454506  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2430  hypothetical protein  30 
 
 
763 aa  144  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0357065  hitchhiker  0.0000115459 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1461  von Willebrand factor, type A  32.07 
 
 
410 aa  142  3e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.178623  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4578  VWA containing CoxE family protein  32.64 
 
 
390 aa  141  6e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.26752  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4844  VWA containing CoxE family protein  30.23 
 
 
410 aa  142  6e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2408  hypothetical protein  30.24 
 
 
763 aa  140  1e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000507419  decreased coverage  0.000148317 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1460  hypothetical protein  30.43 
 
 
735 aa  138  6.0000000000000005e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.344765  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1555  VWA containing CoxE family protein  35.34 
 
 
433 aa  137  9e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.61333 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1278  hypothetical protein  30.35 
 
 
812 aa  134  9e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0059851 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0754  VWA containing CoxE family protein  29.12 
 
 
376 aa  133  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3408  VWA containing CoxE family protein  28.57 
 
 
460 aa  131  9.000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0329  hypothetical protein  22.85 
 
 
762 aa  130  2.0000000000000002e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1511  hypothetical protein  29.83 
 
 
770 aa  128  8.000000000000001e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.273453  normal  0.683191 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0133  hypothetical protein  25.69 
 
 
853 aa  127  1e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2046  hypothetical protein  30.95 
 
 
793 aa  127  2e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1790  hypothetical protein  31.12 
 
 
773 aa  124  9e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.462246  normal  0.0987848 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2928  VWA containing CoxE family protein  32.41 
 
 
447 aa  116  2.0000000000000002e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.84121  normal  0.653479 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6472  hypothetical protein  30.71 
 
 
785 aa  116  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0255501  normal  0.174721 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3740  hypothetical protein  29.14 
 
 
813 aa  115  6e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.516978  normal  0.150534 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2018  VWA containing CoxE family protein  32 
 
 
447 aa  114  9e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.531693  normal  0.264381 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0924  hypothetical protein  28.51 
 
 
759 aa  110  1e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.504013  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02049  hypothetical protein  29.38 
 
 
759 aa  107  1e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2254  hypothetical protein  29.18 
 
 
759 aa  107  1e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02007  hypothetical protein  29.38 
 
 
759 aa  107  1e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1538  conserved hypothetical protein  29.44 
 
 
759 aa  108  1e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.163739  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1556  hypothetical protein  30.77 
 
 
830 aa  107  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.586772  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2408  hypothetical protein  28.43 
 
 
759 aa  106  4e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1528  hypothetical protein  28.48 
 
 
759 aa  103  2e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.735894  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0028  hypothetical protein  31.03 
 
 
481 aa  103  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.125752  normal  0.588325 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2881  hypothetical protein  29.04 
 
 
759 aa  101  8e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.130306 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4579  hypothetical protein  29.72 
 
 
831 aa  93.2  3e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.848749  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4845  hypothetical protein  27.92 
 
 
854 aa  88.2  9e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7548  hypothetical protein  27.76 
 
 
764 aa  85.9  0.000000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6229  hypothetical protein  26.15 
 
 
828 aa  84.7  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1396  hypothetical protein  30.99 
 
 
770 aa  84.3  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.500039 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1841  hypothetical protein  30.23 
 
 
801 aa  80.5  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00003479  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1886  hypothetical protein  30.48 
 
 
817 aa  79.7  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1553  hypothetical protein  30.9 
 
 
826 aa  72.4  0.00000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.323576  normal  0.438631 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0600  hypothetical protein  31.54 
 
 
836 aa  57.4  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1751  carbon monoxide dehydrogenase, coxE accessory protein  30.39 
 
 
371 aa  48.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.520301 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0026  hypothetical protein  28.52 
 
 
940 aa  45.8  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00859162  normal  0.584217 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>