45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1885 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_1885  VWA containing CoxE family protein  100 
 
 
368 aa  736    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2880  VWA containing CoxE family protein  67.02 
 
 
377 aa  474  1e-133  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.191674  normal  0.189706 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0601  VWA containing CoxE family protein  63.27 
 
 
389 aa  467  9.999999999999999e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1537  VWA containing CoxE family protein  58.36 
 
 
378 aa  436  1e-121  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02008  hypothetical protein  58.08 
 
 
378 aa  435  1e-121  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3108  von Willebrand factor type A domain protein  58.36 
 
 
378 aa  435  1e-121  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.708549  normal  0.744851 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0923  von Willebrand factor type A domain-containing protein  58.36 
 
 
378 aa  437  1e-121  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2255  von Willebrand factor type A domain-containing protein  58.08 
 
 
378 aa  435  1e-121  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02050  hypothetical protein  58.08 
 
 
378 aa  435  1e-121  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7544  von Willebrand factor type A (vWA) domain-containing protein  57.53 
 
 
380 aa  434  1e-120  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.183043  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2409  von Willebrand factor type A domain-containing protein  57.26 
 
 
378 aa  428  1e-119  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1557  VWA containing CoxE-like protein  60.71 
 
 
381 aa  424  1e-118  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0310279  normal  0.504339 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1393  VWA containing CoxE family protein  59.24 
 
 
376 aa  412  1e-114  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0792049  normal  0.21491 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0134  VWA containing CoxE family protein  43.75 
 
 
379 aa  298  7e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6233  VWA containing CoxE family protein  42.59 
 
 
375 aa  281  9e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1361  VWA containing CoxE family protein  35.97 
 
 
377 aa  266  5.999999999999999e-70  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6471  VWA containing CoxE family protein  41.46 
 
 
385 aa  251  2e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0451364  normal  0.124275 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3514  VWA domain-containing protein  40.71 
 
 
389 aa  246  4e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7989  VWA containing CoxE family protein  39.84 
 
 
400 aa  244  9.999999999999999e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3742  VWA containing CoxE family protein  39.56 
 
 
403 aa  244  1.9999999999999999e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.65677 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0754  VWA containing CoxE family protein  37.7 
 
 
376 aa  242  7.999999999999999e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4844  VWA containing CoxE family protein  40.93 
 
 
410 aa  241  1e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1510  VWA containing CoxE family protein  40.05 
 
 
388 aa  239  5e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0633588  normal  0.728089 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2431  VWA containing CoxE family protein  38.17 
 
 
403 aa  239  5e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00243334  hitchhiker  0.00000137951 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1510  VWA containing CoxE family protein  40.05 
 
 
387 aa  238  9e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.211615  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4578  VWA containing CoxE family protein  40.27 
 
 
390 aa  236  4e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.26752  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1789  VWA containing CoxE family protein  39.78 
 
 
387 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.347517  normal  0.0670662 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0406  VWA containing CoxE family protein  35.56 
 
 
388 aa  233  4.0000000000000004e-60  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4024  VWA containing CoxE family protein  36.73 
 
 
401 aa  231  2e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1279  VWA containing CoxE family protein  41.53 
 
 
424 aa  226  5.0000000000000005e-58  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.596835  hitchhiker  0.00435359 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2045  VWA containing CoxE family protein  39.67 
 
 
421 aa  223  4e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2171  VWA containing CoxE family protein  41.88 
 
 
552 aa  219  5e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.622478  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2409  VWA containing CoxE family protein  38.32 
 
 
393 aa  217  2e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000612945  decreased coverage  0.0000832829 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4685  VWA containing CoxE family protein  36.14 
 
 
391 aa  217  2e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1840  VWA containing CoxE family protein  41.03 
 
 
387 aa  216  4e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000454506  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1461  von Willebrand factor, type A  37.8 
 
 
410 aa  208  1e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.178623  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1555  VWA containing CoxE family protein  37.6 
 
 
433 aa  196  6e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.61333 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2512  VWA containing CoxE family protein  38.44 
 
 
1295 aa  183  4.0000000000000006e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.686285  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3885  hypothetical protein  38.85 
 
 
1330 aa  179  4.999999999999999e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0169004  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3408  VWA containing CoxE family protein  29.45 
 
 
460 aa  155  1e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2928  VWA containing CoxE family protein  30.15 
 
 
447 aa  140  3e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.84121  normal  0.653479 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2018  VWA containing CoxE family protein  30.11 
 
 
447 aa  140  4.999999999999999e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.531693  normal  0.264381 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0028  hypothetical protein  30.15 
 
 
481 aa  123  5e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.125752  normal  0.588325 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1851  hypothetical protein  36.54 
 
 
411 aa  45.8  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.257555 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1087  hypothetical protein  31.03 
 
 
448 aa  44.7  0.003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.6129  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>