48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_1393 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_1393  VWA containing CoxE family protein  100 
 
 		 376 aa  746    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0792049  normal  0.21491 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7544  von Willebrand factor type A (vWA) domain-containing protein  75.07 
 
 		 380 aa  582  1.0000000000000001e-165  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.183043  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1537  VWA containing CoxE family protein  57.14 
 
 		 378 aa  428  1e-119  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2255  von Willebrand factor type A domain-containing protein  56.87 
 
 		 378 aa  429  1e-119  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0923  von Willebrand factor type A domain-containing protein  56.87 
 
 		 378 aa  426  1e-118  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02050  hypothetical protein  56.87 
 
 		 378 aa  428  1e-118  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2409  von Willebrand factor type A domain-containing protein  56.6 
 
 		 378 aa  424  1e-118  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02008  hypothetical protein  56.87 
 
 		 378 aa  428  1e-118  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3108  von Willebrand factor type A domain protein  57.14 
 
 		 378 aa  427  1e-118  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.708549  normal  0.744851 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1557  VWA containing CoxE-like protein  60.65 
 
 		 381 aa  421  1e-117  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0310279  normal  0.504339 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1885  VWA containing CoxE family protein  59.24 
 
 		 368 aa  412  1e-114  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0601  VWA containing CoxE family protein  55.98 
 
 		 389 aa  407  1.0000000000000001e-112  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2880  VWA containing CoxE family protein  58.51 
 
 		 377 aa  400  9.999999999999999e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.191674  normal  0.189706 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1361  VWA containing CoxE family protein  36.36 
 
 		 377 aa  283  3.0000000000000004e-75  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6233  VWA containing CoxE family protein  41.44 
 
 		 375 aa  280  4e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0134  VWA containing CoxE family protein  40.05 
 
 		 379 aa  269  7e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3742  VWA containing CoxE family protein  41.73 
 
 		 403 aa  266  5e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.65677 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4024  VWA containing CoxE family protein  41.42 
 
 		 401 aa  254  1.0000000000000001e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3514  VWA domain-containing protein  39.95 
 
 		 389 aa  253  3e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1510  VWA containing CoxE family protein  40.92 
 
 		 388 aa  250  2e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0633588  normal  0.728089 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1510  VWA containing CoxE family protein  40.65 
 
 		 387 aa  247  3e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.211615  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1789  VWA containing CoxE family protein  40.38 
 
 		 387 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.347517  normal  0.0670662 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0406  VWA containing CoxE family protein  34.49 
 
 		 388 aa  241  1e-62  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4844  VWA containing CoxE family protein  39.57 
 
 		 410 aa  237  3e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6471  VWA containing CoxE family protein  40.11 
 
 		 385 aa  235  1.0000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0451364  normal  0.124275 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7989  VWA containing CoxE family protein  37.8 
 
 		 400 aa  234  2.0000000000000002e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2431  VWA containing CoxE family protein  37.63 
 
 		 403 aa  230  3e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00243334  hitchhiker  0.00000137951 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0754  VWA containing CoxE family protein  34.14 
 
 		 376 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2409  VWA containing CoxE family protein  38.01 
 
 		 393 aa  219  7.999999999999999e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000612945  decreased coverage  0.0000832829 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4578  VWA containing CoxE family protein  37.3 
 
 		 390 aa  215  8e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.26752  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2171  VWA containing CoxE family protein  41.98 
 
 		 552 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.622478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2045  VWA containing CoxE family protein  37.67 
 
 		 421 aa  212  7.999999999999999e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4685  VWA containing CoxE family protein  37.33 
 
 		 391 aa  212  1e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1840  VWA containing CoxE family protein  39.46 
 
 		 387 aa  206  7e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000454506  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1461  von Willebrand factor, type A  39.58 
 
 		 410 aa  206  8e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.178623  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1555  VWA containing CoxE family protein  39.13 
 
 		 433 aa  197  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.61333 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1279  VWA containing CoxE family protein  38.42 
 
 		 424 aa  187  2e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.596835  hitchhiker  0.00435359 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2512  VWA containing CoxE family protein  37.2 
 
 		 1295 aa  182  6e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.686285  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3885  hypothetical protein  37.15 
 
 		 1330 aa  176  5e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0169004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3408  VWA containing CoxE family protein  32.07 
 
 		 460 aa  158  1e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2928  VWA containing CoxE family protein  31.14 
 
 		 447 aa  143  4e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.84121  normal  0.653479 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2018  VWA containing CoxE family protein  30.74 
 
 		 447 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.531693  normal  0.264381 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0028  hypothetical protein  30.77 
 
 		 481 aa  122  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.125752  normal  0.588325 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1141  VWA containing CoxE family protein  25.29 
 
 		 415 aa  47.8  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0115  VWA containing CoxE-like protein  31.53 
 
 		 380 aa  44.3  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2700  VWA containing CoxE family protein  26.05 
 
 		 404 aa  43.1  0.007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.877474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4136  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  31.11 
 
 		 1362 aa  43.1  0.008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00332177 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4081  VWA containing CoxE family protein  25.96 
 
 		 444 aa  42.7  0.01  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000060057  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>