45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_6233 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012792  Vapar_6233  VWA containing CoxE family protein  100 
 
 		 375 aa  766    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0134  VWA containing CoxE family protein  62.8 
 
 		 379 aa  496  1e-139  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02008  hypothetical protein  44.69 
 
 		 378 aa  305  6e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02050  hypothetical protein  44.69 
 
 		 378 aa  305  6e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0923  von Willebrand factor type A domain-containing protein  44.69 
 
 		 378 aa  305  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1537  VWA containing CoxE family protein  44.41 
 
 		 378 aa  303  5.000000000000001e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3108  von Willebrand factor type A domain protein  44.14 
 
 		 378 aa  301  2e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.708549  normal  0.744851 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2255  von Willebrand factor type A domain-containing protein  43.87 
 
 		 378 aa  300  2e-80  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2409  von Willebrand factor type A domain-containing protein  43.87 
 
 		 378 aa  299  4e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0601  VWA containing CoxE family protein  43.98 
 
 		 389 aa  293  3e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1557  VWA containing CoxE-like protein  44.69 
 
 		 381 aa  286  5e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0310279  normal  0.504339 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7544  von Willebrand factor type A (vWA) domain-containing protein  43.28 
 
 		 380 aa  284  2.0000000000000002e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.183043  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2880  VWA containing CoxE family protein  43.97 
 
 		 377 aa  283  3.0000000000000004e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.191674  normal  0.189706 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1885  VWA containing CoxE family protein  42.59 
 
 		 368 aa  281  9e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1393  VWA containing CoxE family protein  41.44 
 
 		 376 aa  280  4e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0792049  normal  0.21491 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1361  VWA containing CoxE family protein  35.98 
 
 		 377 aa  273  2.0000000000000002e-72  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1510  VWA containing CoxE family protein  41.14 
 
 		 387 aa  259  4e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.211615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1510  VWA containing CoxE family protein  40.81 
 
 		 388 aa  259  7e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0633588  normal  0.728089 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1789  VWA containing CoxE family protein  40.87 
 
 		 387 aa  257  2e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.347517  normal  0.0670662 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0406  VWA containing CoxE family protein  36.19 
 
 		 388 aa  249  5e-65  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3514  VWA domain-containing protein  39.14 
 
 		 389 aa  241  1e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2409  VWA containing CoxE family protein  40.38 
 
 		 393 aa  240  2.9999999999999997e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000612945  decreased coverage  0.0000832829 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4578  VWA containing CoxE family protein  38.81 
 
 		 390 aa  238  2e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.26752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2431  VWA containing CoxE family protein  38.87 
 
 		 403 aa  237  3e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00243334  hitchhiker  0.00000137951 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3742  VWA containing CoxE family protein  39.3 
 
 		 403 aa  233  3e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.65677 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6471  VWA containing CoxE family protein  38.61 
 
 		 385 aa  232  8.000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0451364  normal  0.124275 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4024  VWA containing CoxE family protein  37.04 
 
 		 401 aa  229  5e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0754  VWA containing CoxE family protein  34.77 
 
 		 376 aa  225  9e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7989  VWA containing CoxE family protein  36.98 
 
 		 400 aa  225  1e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4685  VWA containing CoxE family protein  36.02 
 
 		 391 aa  221  9.999999999999999e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2171  VWA containing CoxE family protein  40.67 
 
 		 552 aa  215  9.999999999999999e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.622478  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4844  VWA containing CoxE family protein  37.57 
 
 		 410 aa  211  1e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1279  VWA containing CoxE family protein  40.76 
 
 		 424 aa  210  3e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.596835  hitchhiker  0.00435359 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1555  VWA containing CoxE family protein  38.17 
 
 		 433 aa  206  7e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.61333 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1840  VWA containing CoxE family protein  36.7 
 
 		 387 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000454506  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1461  von Willebrand factor, type A  35.43 
 
 		 410 aa  200  3.9999999999999996e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.178623  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2045  VWA containing CoxE family protein  35.23 
 
 		 421 aa  197  3e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3885  hypothetical protein  35.25 
 
 		 1330 aa  179  9e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0169004  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2512  VWA containing CoxE family protein  32.08 
 
 		 1295 aa  150  3e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.686285  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3408  VWA containing CoxE family protein  27.8 
 
 		 460 aa  138  2e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2928  VWA containing CoxE family protein  29.15 
 
 		 447 aa  135  9.999999999999999e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.84121  normal  0.653479 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2018  VWA containing CoxE family protein  31.09 
 
 		 447 aa  134  3e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.531693  normal  0.264381 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0028  hypothetical protein  29.69 
 
 		 481 aa  115  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.125752  normal  0.588325 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2161  hypothetical protein  26.21 
 
 		 575 aa  46.2  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1214  VWA containing CoxE family protein  30.67 
 
 		 392 aa  43.1  0.008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>