45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0601 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_0601  VWA containing CoxE family protein  100 
 
 		 389 aa  785    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2880  VWA containing CoxE family protein  65.62 
 
 		 377 aa  494  9.999999999999999e-139  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.191674  normal  0.189706 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1885  VWA containing CoxE family protein  63.27 
 
 		 368 aa  467  9.999999999999999e-131  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7544  von Willebrand factor type A (vWA) domain-containing protein  58.16 
 
 		 380 aa  429  1e-119  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.183043  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1557  VWA containing CoxE-like protein  59.52 
 
 		 381 aa  419  1e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0310279  normal  0.504339 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1537  VWA containing CoxE family protein  54.97 
 
 		 378 aa  410  1e-113  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02008  hypothetical protein  54.97 
 
 		 378 aa  409  1e-113  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02050  hypothetical protein  54.97 
 
 		 378 aa  409  1e-113  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0923  von Willebrand factor type A domain-containing protein  54.71 
 
 		 378 aa  409  1e-113  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2255  von Willebrand factor type A domain-containing protein  54.71 
 
 		 378 aa  409  1e-113  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3108  von Willebrand factor type A domain protein  54.45 
 
 		 378 aa  406  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.708549  normal  0.744851 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1393  VWA containing CoxE family protein  55.98 
 
 		 376 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0792049  normal  0.21491 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2409  von Willebrand factor type A domain-containing protein  54.19 
 
 		 378 aa  401  1e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6233  VWA containing CoxE family protein  43.98 
 
 		 375 aa  293  4e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0134  VWA containing CoxE family protein  42.67 
 
 		 379 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1361  VWA containing CoxE family protein  36.27 
 
 		 377 aa  282  7.000000000000001e-75  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3514  VWA domain-containing protein  38.85 
 
 		 389 aa  248  1e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3742  VWA containing CoxE family protein  40.36 
 
 		 403 aa  241  2e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.65677 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4024  VWA containing CoxE family protein  37.34 
 
 		 401 aa  237  3e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1510  VWA containing CoxE family protein  39.68 
 
 		 388 aa  231  1e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0633588  normal  0.728089 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4844  VWA containing CoxE family protein  38.05 
 
 		 410 aa  231  2e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1510  VWA containing CoxE family protein  39.63 
 
 		 387 aa  229  6e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.211615  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1789  VWA containing CoxE family protein  39.37 
 
 		 387 aa  227  2e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.347517  normal  0.0670662 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6471  VWA containing CoxE family protein  37.01 
 
 		 385 aa  225  9e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0451364  normal  0.124275 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7989  VWA containing CoxE family protein  35.48 
 
 		 400 aa  224  2e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0406  VWA containing CoxE family protein  35.7 
 
 		 388 aa  223  6e-57  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2431  VWA containing CoxE family protein  35.22 
 
 		 403 aa  219  8.999999999999998e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00243334  hitchhiker  0.00000137951 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4578  VWA containing CoxE family protein  35.71 
 
 		 390 aa  213  2.9999999999999995e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.26752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0754  VWA containing CoxE family protein  34.3 
 
 		 376 aa  209  9e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2171  VWA containing CoxE family protein  39.29 
 
 		 552 aa  207  2e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.622478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1461  von Willebrand factor, type A  36.93 
 
 		 410 aa  206  5e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.178623  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2409  VWA containing CoxE family protein  35.75 
 
 		 393 aa  205  9e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000612945  decreased coverage  0.0000832829 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4685  VWA containing CoxE family protein  34.02 
 
 		 391 aa  203  4e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1840  VWA containing CoxE family protein  37.24 
 
 		 387 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000454506  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1555  VWA containing CoxE family protein  38.62 
 
 		 433 aa  201  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.61333 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1279  VWA containing CoxE family protein  39.68 
 
 		 424 aa  197  3e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.596835  hitchhiker  0.00435359 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2045  VWA containing CoxE family protein  36.14 
 
 		 421 aa  186  6e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3885  hypothetical protein  36.43 
 
 		 1330 aa  178  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0169004  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2512  VWA containing CoxE family protein  35.28 
 
 		 1295 aa  177  3e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.686285  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3408  VWA containing CoxE family protein  31.97 
 
 		 460 aa  170  4e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2928  VWA containing CoxE family protein  34.2 
 
 		 447 aa  162  9e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.84121  normal  0.653479 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2018  VWA containing CoxE family protein  33.83 
 
 		 447 aa  162  1e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.531693  normal  0.264381 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0028  hypothetical protein  31.62 
 
 		 481 aa  133  3.9999999999999996e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.125752  normal  0.588325 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1851  hypothetical protein  42.53 
 
 		 411 aa  48.1  0.0003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.257555 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0980  hypothetical protein  32.54 
 
 		 431 aa  46.6  0.0007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000197684 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>