43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_1510 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_1789  VWA containing CoxE family protein  97.83 
 
 
387 aa  719    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.347517  normal  0.0670662 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1510  VWA containing CoxE family protein  100 
 
 
388 aa  773    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0633588  normal  0.728089 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1510  VWA containing CoxE family protein  98.1 
 
 
387 aa  722    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.211615  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3514  VWA domain-containing protein  68.16 
 
 
389 aa  538  9.999999999999999e-153  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3742  VWA containing CoxE family protein  68.75 
 
 
403 aa  521  1e-147  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.65677 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2431  VWA containing CoxE family protein  61.95 
 
 
403 aa  501  1e-141  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00243334  hitchhiker  0.00000137951 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4844  VWA containing CoxE family protein  67.1 
 
 
410 aa  498  1e-139  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0754  VWA containing CoxE family protein  62.02 
 
 
376 aa  490  1e-137  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4024  VWA containing CoxE family protein  62.3 
 
 
401 aa  479  1e-134  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6471  VWA containing CoxE family protein  60.8 
 
 
385 aa  454  1.0000000000000001e-126  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0451364  normal  0.124275 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7989  VWA containing CoxE family protein  56.23 
 
 
400 aa  441  1e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4578  VWA containing CoxE family protein  60.32 
 
 
390 aa  440  9.999999999999999e-123  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.26752  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4685  VWA containing CoxE family protein  57.95 
 
 
391 aa  429  1e-119  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2409  VWA containing CoxE family protein  57.14 
 
 
393 aa  415  9.999999999999999e-116  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000612945  decreased coverage  0.0000832829 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1840  VWA containing CoxE family protein  59.89 
 
 
387 aa  410  1e-113  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000454506  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2045  VWA containing CoxE family protein  59.2 
 
 
421 aa  411  1e-113  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1461  von Willebrand factor, type A  55.53 
 
 
410 aa  409  1e-113  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.178623  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1555  VWA containing CoxE family protein  60.47 
 
 
433 aa  407  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.61333 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2171  VWA containing CoxE family protein  55.74 
 
 
552 aa  377  1e-103  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.622478  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1279  VWA containing CoxE family protein  56.95 
 
 
424 aa  376  1e-103  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.596835  hitchhiker  0.00435359 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0406  VWA containing CoxE family protein  45.19 
 
 
388 aa  345  6e-94  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7544  von Willebrand factor type A (vWA) domain-containing protein  39.84 
 
 
380 aa  265  7e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.183043  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0134  VWA containing CoxE family protein  37.23 
 
 
379 aa  261  1e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6233  VWA containing CoxE family protein  40.81 
 
 
375 aa  259  6e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1393  VWA containing CoxE family protein  40.92 
 
 
376 aa  250  3e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0792049  normal  0.21491 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2255  von Willebrand factor type A domain-containing protein  37.98 
 
 
378 aa  246  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02050  hypothetical protein  37.98 
 
 
378 aa  245  6.999999999999999e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02008  hypothetical protein  37.98 
 
 
378 aa  245  6.999999999999999e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3108  von Willebrand factor type A domain protein  37.7 
 
 
378 aa  243  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.708549  normal  0.744851 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1537  VWA containing CoxE family protein  37.7 
 
 
378 aa  242  1e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0923  von Willebrand factor type A domain-containing protein  37.7 
 
 
378 aa  240  2e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1361  VWA containing CoxE family protein  32.09 
 
 
377 aa  241  2e-62  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1885  VWA containing CoxE family protein  39.95 
 
 
368 aa  239  9e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2409  von Willebrand factor type A domain-containing protein  37.16 
 
 
378 aa  238  1e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1557  VWA containing CoxE-like protein  41.08 
 
 
381 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0310279  normal  0.504339 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0601  VWA containing CoxE family protein  39.68 
 
 
389 aa  231  1e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2880  VWA containing CoxE family protein  39.5 
 
 
377 aa  216  8e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.191674  normal  0.189706 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3408  VWA containing CoxE family protein  31.45 
 
 
460 aa  153  5e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3885  hypothetical protein  37.21 
 
 
1330 aa  152  7e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0169004  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2512  VWA containing CoxE family protein  32.87 
 
 
1295 aa  148  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.686285  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2928  VWA containing CoxE family protein  29.82 
 
 
447 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.84121  normal  0.653479 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2018  VWA containing CoxE family protein  29.78 
 
 
447 aa  131  3e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.531693  normal  0.264381 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0028  hypothetical protein  27.5 
 
 
481 aa  107  5e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.125752  normal  0.588325 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>